「植物界」の新概念と新分類体系を構築する系統学的研究

• 研究課題/領域番号: 21657024
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 野崎 久義 東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (40250104)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,350千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 150千円); 2011年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2010年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円); 2009年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
• キーワード: 大系統 / 大分類 / 植物界 / 色素体一次共生 / 色素体二次共生 / 細胞内共生的遺伝子水平伝達

研究概要

一次共生植物が単系統であると示した既存のデータの再検討による再解析並びに自由性生活の無色ミドリムシ類PeranemaのESTデータの構築と利用を実施した結果、一次共生植物が単系統と解析されている原因が遺伝子進化速度が高い細胞内寄生虫や繊毛虫等の影響である可能性が示せた。また、色素体二次共生植物のクロララクニオン藻とミドリムシ藻で、それぞれ緑藻の二次共生以前の隠された紅藻の2または3次共生が核ゲノムの解析で明らかになり、二次共生植物の概念も刷新しつつある。

研究成果

• [雑誌論文] Anextended phylogenetic analysis revealsancient origin of "non-green"phosphoribulokinase genes from twolineages of "green" secondaryphotosynthetic eukaryotes: Euglenophyta and Chlorarachniophyta (2011)
  • 著者名/発表者名: Yang, Y., Maruyama, S., Sekimoto, H.,Sakayama, H. & Nozaki, H
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 4 号: 1 ページ: 330-330
  • DOI: 10.1186/1756-0500-4-330
  • 査読あり
• [雑誌論文] Eukaryote-to-eukaryote gene transfergives rise to genome mosaicism in euglenids (2011)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S., Suzaki, T., Weber, A. P. M.,Archibald, J. M. & Nozaki, H
  • 雑誌名: BMC Evol. Biol. 巻: 11 号: 1 ページ: 105-105
  • DOI: 10.1186/1471-2148-11-105
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aquatic plant speciation affected by diversifying selection of organelle DNA regions (2011)
  • 著者名/発表者名: Kato, S., Misawa, K., Takahashi, F., Sakayama, H., Sano, S., Kosuge, K., Kasai, F., Watanabe, M., Tanaka, J. & Nozaki, H.
  • 雑誌名: J. Phycol. 巻: 47 号: 5 ページ: 999-1008
  • DOI: 10.1111/j.1529-8817.2011.01037.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionaryanalyses of the nuclear-encoded photosynthetic gene psbO from tertiary plastid-containing algae in Dinophyta (2011)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, A., Takahashi, F., Kataoka, H.,Hara, Y. & Nozaki, H.
  • 雑誌名: J. Phycol. 巻: 47 号: 2 ページ: 407-414
  • DOI: 10.1111/j.1529-8817.2011.00961.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary analyses of the nuclear-encoded photosynthetic gene psbO from tertiary plastid-containing algae in Dinophyta (2011)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, A.
  • 雑誌名: J.Phycol. 巻: 47 ページ: 407-414
  • 査読あり
• [雑誌論文] Horizontal gene transfer by the parasitic plant Striga hermonthica (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, S., Maruyama, S., Nozaki, H.. &Shirasu, K
  • 雑誌名: Science 巻: 328 号: 5982 ページ: 1128-1128
  • DOI: 10.1126/science.1187145
  • 査読あり
• [雑誌論文] Permuted tRNAgenes in the nuclear and nucleomorphgenomes of photosynthetic eukaryotes (2010)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S., Junichi Sugahara, J., Kanai,A. & Nozaki, H
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol 巻: 27 号: 5 ページ: 1070-1076
  • DOI: 10.1093/molbev/msp313
  • 査読あり
• [雑誌論文] Permuted tRNA genes in the nuclear and nucleomorph genomes of photosynthetic eukaryotes (2010)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S.
  • 雑誌名: Mol.Biol.Evol. 巻: 27 ページ: 1070-1076
  • 査読あり
• [雑誌論文] Horizontal gene transfer by the parasitic plant Striga hermonthica (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, S.
  • 雑誌名: Science 巻: 328 ページ: 112-112
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution and phylogeny of theblue-light receptors aureochromes ineukaryotes (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa, M., Takahashi, F., Nozaki, H.,Nagasato, C., Motomura, T. & Kataoka, H
  • 雑誌名: Planta 230 巻: 230 号: 3 ページ: 543-552
  • DOI: 10.1007/s00425-009-0967-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogenetic positions of Glaucophyta,green plants (Archaeplastida) andHaptophyta (Chromalveolata) as deducedfrom slowly evolving nuclear genes (2009)
  • 著者名/発表者名: Nozaki, H., Maruyama, S., Matsuzaki, M.,Nakada, T., Kato, S. & Misawa, K
  • 雑誌名: Mol.Phylog. Evol 巻: 53 号: 3 ページ: 872-880
  • DOI: 10.1016/j.ympev.2009.08.015
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyanobacterialcontribution to the genomes of theplastid-lacking protists (2009)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S., Matsuzaki, M., Misawa, K.& Nozaki, H
  • 雑誌名: BMC Evol. Biol 巻: 9 号: 1 ページ: 197-197
  • DOI: 10.1186/1471-2148-9-197
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyanobacterial contribution to the genomes of the plastid-lacking protists. (2009)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S
  • 雑誌名: BMC Evol.Biol. 9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogenetic positions of Glaucophyta, green plants (Archaeplastida) and Haptophyta (Chromalveolata) as deduced from slowly evolving nuclear genes. (2009)
  • 著者名/発表者名: Nozaki, H.
  • 雑誌名: Mol.Phylog.Evol. 53 ページ: 872-880
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution and phylogeny of the blue-light receptors aureochromes in eukaryotes. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa, M.
  • 雑誌名: Planta 230 ページ: 543-552
  • 査読あり
• [学会発表] 蛍光融合タンパク質を利用したパーキンサス色素体およびミトコンドリアの細胞学・生化学的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松崎素道、増田功、黒岩晴子、黒岩常祥、野崎久義、北潔
  • 学会等名: 日本植物学会第75回大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス、東京都
• [学会発表] 三次共生型渦鞭毛藻Kryptoperidiniumの色素体についての考察 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高橋文雄、横山亜紀子、野崎久義
  • 学会等名: 日本植物学会第75回大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス、東京都
• [学会発表] 多遺伝子系統解析結果におけるハプト藻の系統的位置のゆらぎ (2011)
  • 著者名/発表者名: 野崎久義、丸山真一朗、楊億、洲崎敏伸
  • 学会等名: 日本藻類学会第35回大会
  • 発表場所: 富山大学、富山市
• [学会発表] 広範囲な分子系統解析は緑色系二次共生藻の光合成PRK遺伝子が緑色ではない藻類からの起源を示す (2011)
  • 著者名/発表者名: 楊億、丸山真一郎、関本弘之、坂山英俊、野崎久義
  • 学会等名: 日本藻類学会第35回大会
  • 発表場所: 富山大学、富山市
• [学会発表] 細胞内共生による藻類多様性の起源-色素体進化の新仮説と「"超"植物界」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 野崎久義
  • 学会等名: 葉山セミナー先導科学考究
  • 発表場所: 総合研究大学院大学、葉山(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-16
• [学会発表] 緑色植物の姉妹群とハプト植物の系統的位置 (2009)
  • 著者名/発表者名: 野崎久義
  • 学会等名: 日本植物学会第73回大会
  • 発表場所: 山形大学(山形県)
  • 年月日: 2009-09-19
• [学会発表] Genome information renewing the concept of Plantae (2009)
  • 著者名/発表者名: Nozaki, H.
  • 学会等名: Ninth International Phycological Congress(第9回国際藻類学会議)
  • 発表場所: 国立オリンビック記念青年総合センター(東京都)
  • 年月日: 2009-08-07
• [学会発表] Genome information renewing the concept of Plantae (2009)
  • 著者名/発表者名: Nozaki, H
  • 学会等名: Ninth International Phycological Congress
  • 発表場所: National Olympic Memorial Youth Center, Japan
• [学会発表] 緑色植物の姉妹群とハプト植物の系統的位置 (2009)
  • 著者名/発表者名: 野崎久義、丸山真一朗、松崎素道、仲田崇志、加藤将、三澤計治
  • 学会等名: 日本植物学会第73回大会
  • 発表場所: 山形大学小白川キャンパス、山形市
• [備考] 東京大学理学系研究科プレスリリース「むかしむかし、ミドリムシは紅かった?」新聞掲載: 4月21日付の朝日小学生新聞第1面「ミドリムシは昔、赤かった?遺伝子を発見」
  • URL: http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/08.html
• [備考] 東京大学理学系研究科プレスリリース
  • URL: http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/08.html