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がん関連CNV(copy number variation)の同定に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 21659088
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 人体病理学
研究機関山口大学

研究代表者

佐々木 功典  山口大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (80116722)

研究期間 (年度) 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2009年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードCNV / アレイCGH / 子宮癌 / 大腸癌 / 癌感受性
研究概要

2004年に遺伝子全体を含むような数Kbpから数Mbpに及ぶ大きな領域のDNAコピー数が、ヒト個人の間で異なるという大規模コピー数多型(CNV-copy number variation:遺伝子多型としては1塩基多型(SNP)の対極にあるもの)の存在が報告され世の中に大きな衝撃を与えた。現在、CNVと各種疾患との関係が漸次明らかにされつつあり、我々も癌とCNVとの関連を明らかにする目的で、本研究ではcomparative genomic hybridization (CGH)の技術を用いて癌の感受性(罹患しやすさ)に関係するCNVの同定に関する研究を行った。
各種固形癌(子宮癌、大腸癌、胃癌など)について、各患者(20~30例)から採取した癌組織(細胞)と非癌細胞(リンパ球)および当該癌に罹患したことのない高齢者(20人)のリンパ球からのDNAを抽出した。抽出されたDNAはBACアレイCGHによりコピー数が解析され、高頻度にコピー数異常を呈するBACクローンを同定した。癌患者における非癌検体からのDNAで、癌細胞からのDNAと同様に高頻度に出現したコピー数異常部位をまずCNV候補とした。それらのうち非癌患者DNAにおける結果と比較し、癌との関連性が考えられるCNVを絞っていった。このときデータベースとの照合も行った。子宮癌、大腸癌ではこれらの候補CNVを同定することに成功し、本研究の目的は達せられたと考えている。

報告書

(1件)
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Breast cancer cell lines carry cell line-specific genomic alterations that are distinct from aberrations in breast cancer tissues : comparison of the CGH profiles between cancer cell lines and primary cancer tissues.2010

    • 著者名/発表者名
      Tsuji K
    • 雑誌名

      BMC cancer 10

      ページ: 15-15

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intercellular centrosome number is correlated with the copy number of chromosomes in bladder cancer.2009

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Y
    • 雑誌名

      Cancer Genet Cytogenet 191

      ページ: 38-42

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A copy number gain of the 6p arm is linked with advanced hepatocellularcarcinoma2009

    • 著者名/発表者名
      Chochi Y
    • 雑誌名

      J Pathol 217

      ページ: 677-684

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 乳癌におけるホルモンレセプターの発現とDNAコピー数異常との関連についての検討2009

    • 著者名/発表者名
      古屋智子
    • 学会等名
      第68回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-10-03
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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