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1細胞マイクロ分析システム:遺伝子発現から代謝までの階層的理解

研究課題

研究課題/領域番号 21685008
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 分析化学
研究機関東北大学

研究代表者

珠玖 仁  東北大学, 環境科学研究科, 准教授 (10361164)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
27,560千円 (直接経費: 21,200千円、間接経費: 6,360千円)
2011年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2010年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
2009年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
キーワード1細胞解析 / 遺伝子発現 / レポーター遺伝子 / 代謝活性 / 初期胚
研究概要

本研究では、1細胞レベルでの核酸(DNA.RNA)、タンパク質の同時定量法を確立し、遺伝子発現から代謝経路を含む階層的理解を目標とする。分析システムの感度向上により、核酸-タンパク質修飾などエピジェネティックな発現制御に係る情報を得る。これにより、マウス初期胚の発生過程、iPS細胞など遺伝子導入系細胞の発現効率の評価、組織培養やマイクロデバイスを用いるオンチップ培養過程で遺伝子発現解析が可能となる。(1)損傷回復モデルおよび同調培養系で1細胞遺伝子発現解析を実施した。一般的に、大量細胞系と1細胞系で、遺伝子発現の結果は極めて良く一致した。損傷復培養では各種成長因子を添加し、スクラッチングにより形成した傷モデルのエッジ部分特異的に、膜受容体およびシグナル伝達の下流に位置するキナーゼのmRNA発現量が大量細胞系-1細胞系間で有意に異なることを見出した。同調培養系では、細胞周期感受性の蛍光プローブレポータータンパク質の発現を蛍光顕微鏡下で観察しながら、mRNA発現を1細胞レベルで定量することを試みた。(2)3次元培養系に適用可能な多機能プローブとして、リング電極-針状電極2電極系で顕微鏡観察下、細胞塊を構成する任意の1細胞を狙って電場破砕→mRNA回収・定量が可能であることを実証した。(3)DNAのGpCメチル化領域を検出するために、簡易型発光検出装置を搭載したパイロシーケンサを用いてDNA配列を解読するための基礎検討を実施した。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Electrorotation chip consisting of three-dimensional interdigitated array electrodes2011

    • 著者名/発表者名
      K.Ino, et al., (他7名)
    • 雑誌名

      Sens.Actuat.B

      巻: 153 ページ: 468-473

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An electrochemical device with microwells for determining the photosynthetic activity of a single cyanobacterium, 20112011

    • 著者名/発表者名
      M.Koide, et al., (他5名)
    • 雑誌名

      Sens.Actuat.B

      巻: 153 ページ: 474-478

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative characterization of reporter gene expression at single-cell level with real-time RT-PCR, chemluminescence, fluorescence, and electrochemical imaging2010

    • 著者名/発表者名
      H.Shiku, et al., (他8名)
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 584 ページ: 4000-4008

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 呼吸活性を指標とした胚の品質評価-マウス胚移植試験の成績と産子の正常性について2010

    • 著者名/発表者名
      横尾正樹, 伊藤-佐々木隆広, 珠玖仁, 末永智一, 阿部宏之
    • 雑誌名

      産婦人科の実際

      巻: 59(9) ページ: 1375-1379

    • NAID

      40017287075

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 流路培養による微小環境の再現2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 雑誌名

      生物工学

      巻: 88 ページ: 533-533

    • NAID

      110007880950

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] 単一細胞由来mRNAの定量解析2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁、伊野浩介、末永智一
    • 雑誌名

      Electrochemistry

      巻: 78(10) ページ: 832-836

    • NAID

      10026969876

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electrochemical Detection of Endotoxin Using Recombinant Factor C Zymogen2010

    • 著者名/発表者名
      K.Y.Inoue, K.Ino, H.Shiku, T.Matsue
    • 雑誌名

      Electrochem.Commun.

      巻: 12 ページ: 1066-1069

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electrochemical topography of a cell monolayer with an addressable microelectrode array2010

    • 著者名/発表者名
      Z.Lin, et al.
    • 雑誌名

      Chem.Commun. 46

      ページ: 559-561

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Addressable Electrochemiluminescence Detection System Based on Redox-cycling of Ru(bpy)_3^<2+>2010

    • 著者名/発表者名
      Z.Lin, et al.
    • 雑誌名

      Chen.Commun. 46

      ページ: 243-245

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chronoammmperometric characterization of secreted alkaline phosphatase from single cell entrapped in a poly(dimethylsiloxisane)microwell2010

    • 著者名/発表者名
      H.Shiku, et al.
    • 雑誌名

      Electrochimica Acta 55(印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electrochemical Single-Cell Gene-Expression Assay Combining Dielectrop horetic Manipulation with Secreted Alkaline Phosphatase Reporter System2009

    • 著者名/発表者名
      T.Murata, et al.
    • 雑誌名

      Biosens.Bioelectron. 25

      ページ: 913-919

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transfected Single-Cell Imaging by Scanning Electrochemical Optical Microscopy with Shear Force Feedback Regulation2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Takahashi, et al.
    • 雑誌名

      Anal.Chem. 81

      ページ: 9647-9681

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three dimensional microelectrode array device integrating multi-channel microfluidics to realize manipulation and characterization of enzyme-immobilized polystyrene beads2009

    • 著者名/発表者名
      R.Kunikata, et al.
    • 雑誌名

      Sens Actual B 141

      ページ: 256-262

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of Electrochemical Reporter Assay Using HeLa Cells Transfected with Vector Plasmids Encoding Various Responsive Elements2009

    • 著者名/発表者名
      H.Shiku, et al.
    • 雑誌名

      Anal.Chim.Acta 640

      ページ: 87-92

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] リング電極搭載型1細胞ウェルアレイデバイス2011

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁, 鈴木準也, 伊野浩介, 末永智一
    • 学会等名
      電気化学会第78回大会
    • 発表場所
      横浜国立大学、神奈川県(大会は中止。要旨集のみ発行)
    • 年月日
      2011-03-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of mRNA and protein expresssions at single-cell level2010

    • 著者名/発表者名
      H.Shiku
    • 学会等名
      Pacifichem 2010
    • 発表場所
      Convention Center, Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2010-12-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] リング-リング電極搭載型多点計測デバイスによる細胞アッセイ2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁, 武田径明, 伊野浩介, 末永智一
    • 学会等名
      2010年電気化学会秋季大会
    • 発表場所
      神奈川工科大学、神奈川県
    • 年月日
      2010-09-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 電気化学顕微鏡SECMによる動物細胞内在性酵素の評価2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      電気化学会第77回大会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 多機能走査型プローブ顕微鏡システムによる1細胞マイクロ分析2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      バイオプロセツシング研究会
    • 発表場所
      (財)新世代研究所 会議室東京御茶ノ水
    • 年月日
      2010-02-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 多機能ナノ走査型プローブ顕微鏡による1細胞分析法2010

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      宮城地区フロンティア化学講演会
    • 発表場所
      ホテルクレセント、仙台市太白区
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 密閉系マイクロウェルアレイによる遺伝子導入HeLa細胞の電気化学的評価2009

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      2009年電気化学会秋季大会
    • 発表場所
      東京農工大学、小金井
    • 年月日
      2009-09-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Development of multi-functional probes for gene expression analysis at single cell leve2009

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      The Sixth International Forum on Post-genome Technologies(IFPT'6)
    • 発表場所
      中国北京
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative characterization of gene expression at single cell level combining reporter system with RT real-time PCR2009

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      APBioChEC'09
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Monitoring respiration activity of mouse embryo on an integrated electrochemical microdevice2009

    • 著者名/発表者名
      珠玖仁
    • 学会等名
      APBioChEC'09
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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