低エネルギーSAD法における回折データの高シグナル低ノイズ化に向けた技術開発

• 研究課題/領域番号: 21687010
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
• 研究代表者: 山田 悠介 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教 (20391708)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 24,050千円 (直接経費: 18,500千円、間接経費: 5,550千円); 2011年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2010年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円); 2009年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
• キーワード: X線結晶解析 / タンパク質結晶構造解析 / 低エネルギーSAD法 / 構造生物学

研究概要

本課題ではタンパク質X線結晶構造解析の位相決定手法の一つである低エネルギーSAD法について、回折データに存在する微弱な異常散乱シグナルを高精度に測定するための技術開発を行ってきた。その結果として、測定試料のまわりのX線吸収効果を低減するためのヘリウムガス吹付装置とヘリウム置換用チャンバー、そして取得したデータからいち早く異常散乱シグナルのレベルを評価するための回折データ処理システムの開発を行った。

研究成果

• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおけるデータ管理 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第29回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2012-03-15
• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおけるデータ管理 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第29回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば(茨城県)
  • 年月日: 2012-03-15
• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折実験システムの高度化と汎用化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • 発表場所: 鳥栖
  • 年月日: 2012-01-09
• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折実験システムの高度化と汎用化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • 発表場所: 鳥栖(佐賀)
  • 年月日: 2012-01-09
• [学会発表] PF構造生物学ビームラインにおける回折データセットの収集と解析の自動化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第28回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2011-07-12
• [学会発表] PF構造生物学ビームラインにおける回折データセットの収集と解析の自動化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第28回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば(茨城県)
  • 年月日: 2011-07-12
• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける高度化への取り組み (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 平成23年度日本結晶学会年会及び総会
  • 発表場所: 北海道大学
• [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける高度化への取り組み (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 平成23年度日本結晶学会年会及び総会
  • 発表場所: 札幌(北海道)
• [学会発表] 高エネ研フォトンファクトリーにおける生体高分子X線結晶構造解析ビームラインの高度化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] PF構造生物ビームラインの高度化と自動化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 平成22年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター
  • 年月日: 2010-12-03
• [学会発表] より高度なタンパク質X線結晶構造解析のための回折データ処理の自動化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田悠介
  • 学会等名: 第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2010-01-09
• [図書] 入門構造生物学-放射光X線と中性子で最新の生命現象を読み解く- (2010)
  • 著者名/発表者名: 高エネルギー加速器研究機構構造生物学研究センター
  • 総ページ数: 203
  • 出版者: 共立出版
• [図書] 入門 構造生物学-放射光X線と中性子で最新の生命現象を読み解く- (2010)
  • 著者名/発表者名: 高エネルギー加速器研究機構構造生物学研究センター編
  • 総ページ数: 203
  • 出版者: 共立出版
• [備考]
  • URL: http://pfweis.kek.jp
• [備考]
  • URL: http://pfweis.kek.jp