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心の状態にかかわる遺伝子モジュール解析システムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 21700233
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 感性情報学・ソフトコンピューティング
研究機関室蘭工業大学

研究代表者

岡田 吉史  室蘭工業大学, 大学院・工学研究科, 助教 (00443177)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード心理状態 / 遺伝子発現 / モジュール / データベース / 心の状態 / 遺伝子発現データ / 遺伝子モジュール / 疑似クリーク / 飽和集合 / DNAマイクロアレイ / 遺伝子機能解析
研究概要

本研究では、心の状態にかかわる遺伝子発現データの解析支援を目的として、1)個々の心理状態で特有の発現パタンを示す遺伝子群(モジュール)を抽出する新しい手法を開発し、2)抽出されたモジュールとその生物学的機能情報を集積したデータベースを構築した。これにより、複数の公共データベースに分散して存在する発現データが本システム上に整理・組織化され、生物学的に有用なモジュールを容易に発見できるようになった。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (45件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (33件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Novel Gene Analysis Method for Biomarker Mining in DNA Microarray Data2011

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 雑誌名

      International Journal of Computer Information Systems and Industrial Management Applications vol.3

      ページ: 256-263

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Audio Classification Based on Closed Itemset Mining Algorithm2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Takahiro Tada, Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima
    • 雑誌名

      International Journal of Computer Information Systems and Industrial Management Applications vol.3

      ページ: 159-164

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Novel Gene Analysis Method for Biomarker Mining in DNA Microarray Data2011

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 雑誌名

      International Journal of Computer Information Systems and Industrial Management Applications

      巻: 3 ページ: 256-263

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Audio Classification Based on Closed Itemset Mining2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Takahiro Tada, Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima
    • 雑誌名

      International Journal of Computer Information Systems and Industrial Management Applications

      巻: 3 ページ: 159-164

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] GEMIND : gene expression module database for human mentality2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Masahiro Sawai
    • 雑誌名

      The journal of three dimensional images vol.23, no.3

      ページ: 30-35

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of differentially expressed gene modules between two-class DNA microarray data2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Terufumi Inoue
    • 雑誌名

      Bioinformation vol.4, no.4

      ページ: 134-137

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-Performance Gene Expression Module Analysis Tool and Its Application to Chemical Toxicity Data2009

    • 著者名/発表者名
      Wataru Fujibuchi, Hyeryung Kim, Yoshifumi Okada, Takeaki Taniguchi, Hideko Sone
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology vol.577

      ページ: 55-65

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of differentially expressed gene modules between two-class DNA microarray data2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Inoue, T.
    • 雑誌名

      Bioinformation 4(4)

      ページ: 134-137

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-Performance Gene Expression Module Analysis Tool and Its Application to Chemical Toxicity Data2009

    • 著者名/発表者名
      Fujibuchi, W., Kim, H., Okada, Y., Taniguchi, T., Sone, H.
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology 577

      ページ: 55-65

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] GEMIND : gene expression module database for human mentality2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Sawai, M.
    • 雑誌名

      The journal of three dimensional images 23(3)

      ページ: 30-35

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Gene Expression Data Analysis Using Heuristic Attribute Reduction in Rough Set Theory2010

    • 著者名/発表者名
      Yasuo Kudo, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      SCIS & ISIS 2010
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2010-12-12
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene Expression Data Analysis Using Heuristic Attribute Reduction in Rough Set Theory2010

    • 著者名/発表者名
      Yasuo Kudo, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      SCIS & ISIS 2010
    • 発表場所
      Okayama Convention Center(岡山県)
    • 年月日
      2010-12-12
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子モジュールを用いた病気のクラス識別2010

    • 著者名/発表者名
      井上皓文, 岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 飽和集合マイニングに基づく遺伝子発現データ解析2010

    • 著者名/発表者名
      大橋克哉、多田貴博、井上皓文、岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 飽和集合列挙法を用いた多クラス識別器の開発2010

    • 著者名/発表者名
      多田貴博, 長島知正, 岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝子モジュールを用いた病気のクラス識別2010

    • 著者名/発表者名
      井上皓文, 岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      公立はこだて未来大学(北海道)
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 飽和集合マイニングに基づく遺伝子発現データ解析2010

    • 著者名/発表者名
      大橋克哉、多田貴博、井上皓文、岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      公立はこだて未来大学(北海道)
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 飽和集合列挙法を用いた多クラス識別器の開発2010

    • 著者名/発表者名
      多田貴博, 長島知正, 岡田吉史
    • 学会等名
      日本感性工学会第3回生命ソフトウェア部会研究会
    • 発表場所
      公立はこだて未来大学(北海道)
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Audio classification based on a closed itemset mining algorithm2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Takahiro Tada, Kentarou Fukuta, Tomomasa Nagashima
    • 学会等名
      CISIM 2010
    • 発表場所
      ポーランド
    • 年月日
      2010-10-08
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene analysis Framework for a Biomarker Mining2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      CISIM 2010
    • 発表場所
      ポーランド
    • 年月日
      2010-10-08
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Audio classification based on a closed itemset mining algorithm2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshifumi Okada, Takahiro Tada, Kentarou Fukuta, Tomomasa Nagashima
    • 学会等名
      CISIM 2010
    • 発表場所
      AGH University(ポーランド)
    • 年月日
      2010-10-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Gene analysis Framework for a Biomarker Mining2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Tomomasa Nagashima, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      CISIM 2010
    • 発表場所
      AGH University(ポーランド)
    • 年月日
      2010-10-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] A novel biomarker mining method for identifying cancer genetic networks in gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      ICHS 2010
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] A novel biomarker mining method for identifying cancer genetic networks in gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Takashi Uozumi, Yoshifumi Okada
    • 学会等名
      ICHS 2010
    • 発表場所
      Doshisha University(京都)
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] LEAF : leave-one-out forward selection method for cancer classification using gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Yoshifumi Okada, Tomomasa Nagashima
    • 学会等名
      9th IEEE/ACIS
    • 発表場所
      山形
    • 年月日
      2010-08-18
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] LEAF : leave-one-out forward selection method for cancer classification using gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fukuta, Yoshifumi Okada, Tomomasa Nagashima
    • 学会等名
      9th IEEE/ACIS
    • 発表場所
      Tsukuoka Hotel(山形)
    • 年月日
      2010-08-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Rule-based Classification for Audio Data Based on Closed Itemset Mining2010

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Tada, Nagashima, T., Okada,Y.
    • 学会等名
      IMECS 2010
    • 発表場所
      香港
    • 年月日
      2010-03-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] 飽和集合マイニングに基づくクラス識別法-遺伝子発現データへの適用-2010

    • 著者名/発表者名
      吉田恵梨香, 多田貴博, 長島知正, 岡田吉史
    • 学会等名
      第42回計測自動制御学会北海道支部学術講演会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-02-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] F値を用いた遺伝子発現差解析手法とその評価2010

    • 著者名/発表者名
      大道一史, 福多賢太郎, 岡田吉史, 長島知正
    • 学会等名
      第42回計測自動制御学会北海道支部学術講演会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-02-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 飽和集合マイニングに基づくクラス識別法-遺伝子発現デタヘの適用-2010

    • 著者名/発表者名
      吉田恵梨香, 多田貴博, 長島知正, 岡田吉史
    • 学会等名
      第42回計測自動制御学会北海道支部学術講演会
    • 発表場所
      日本(札幌)
    • 年月日
      2010-02-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] F値を用いた遺伝子発現差解析手法とその評価2010

    • 著者名/発表者名
      大道一史, 福多賢太郎, 岡田吉史, 長島知正
    • 学会等名
      第42回計測自動制御学会北海道支部学術講演会
    • 発表場所
      日本(札幌)
    • 年月日
      2010-02-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Discriminative Gene Module Analysis for Two-Class DNA Microarray Data and Its Application to Cancer Datasets2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Inoue, T., Nagashima, T.
    • 学会等名
      Int.Conf.Humanized Systems
    • 発表場所
      韓国
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Discriminative Gene Module Analysis for Two-Class DNA Microarray Data and Its Application to Cancer Datasets2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Inoue, T., Nagashima, T.
    • 学会等名
      Int.Conf.Humanized Systems
    • 発表場所
      韓国(ソウル)
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Application of F-Value to Classification Problems with Numerous Numbers of Explanatory Variables2009

    • 著者名/発表者名
      Nagashima, T., Okada, Y., Sawai, M.
    • 学会等名
      2009 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2009-10-18
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Detection of Differentially Expressed Gene Modules in Human Cancer2009

    • 著者名/発表者名
      Inoue, T., Nagashima, T., Okada, Y.
    • 学会等名
      2009 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2009-10-18
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Application of F-Value to Classification Problems with Numerous Numbers of Explanatory Variables2009

    • 著者名/発表者名
      Nagashima, T., Okada, Y., Sawai, M.
    • 学会等名
      2009 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications
    • 発表場所
      日本(札幌)
    • 年月日
      2009-10-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Detection of Differentially Expressed Gene Modules in Human Cancer2009

    • 著者名/発表者名
      Inoue, T., Nagashima, T., Okada, Y.
    • 学会等名
      2009 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications
    • 発表場所
      日本(札幌)
    • 年月日
      2009-10-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] CellMontage/SAMURAI2 : Enhanced Gene Expression Similarity Search Tools2009

    • 著者名/発表者名
      藤渕航, 岡田吉史, Horton Paul
    • 学会等名
      CBRC2009
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-10-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] CellMontage/SAMIURAI2 : Enhanced Gene Expression Similarity Search Tools2009

    • 著者名/発表者名
      藤渕航, 岡田吉史, Horton Paul
    • 学会等名
      CBRC2009
    • 発表場所
      日本(東京)
    • 年月日
      2009-10-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Extraction of Discriminative Gene Modules between Two-Class DNA Microarray Data and Its Application to Chronic Loneliness Patients2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Inoue, T., Nagashima, T.
    • 学会等名
      Proc.of 2009 International Conference on Biometrics and Kansei Engineering
    • 発表場所
      ポーランド
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Applicability of F-value to Classification Problems with a Numerous Number of Explanatory Variables : Toward Classification Problems in Biometric and Kansei Engineering2009

    • 著者名/発表者名
      Nagashima, T., Wang, X., Okada, Y., Sawai, M.
    • 学会等名
      Proc.of 2009 International Conference on Biometrics and Kansei Engineering
    • 発表場所
      ポーランド
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Extraction of Discriminative Gene Modules between Two-Class DNA Microarray Data and Its Application to Chronic Loneliness Patients2009

    • 著者名/発表者名
      Okada, Y., Inoue, T., Nagashima, T.
    • 学会等名
      Proc.of 2009 International Conference on Biometrics and Kansei Engineering
    • 発表場所
      ポーランド(チェシン)
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Applicability of F-value to Classification Problems with a Numerous Number of Explanatory Variables : Toward Classification Problems in Biometric and Kansei Engineering2009

    • 著者名/発表者名
      Nagashima, T., Wang, X., Okada, Y., Sawai, M.
    • 学会等名
      Proc.of 2009 International Conference on Biometrics and Kansei Engineering
    • 発表場所
      ポーランド(チェシン)
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://cbr13.csse.muroran-it.ac.jp/Gemind

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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