溶液X線散乱法による天然解鎖蛋白質の精密構造解析

• 研究課題/領域番号: 21700322
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 岩手医科大学 (2010); 長岡技術科学大学 (2009)
• 研究代表者: 関 安孝 岩手医科大学, 薬学部, 講師 (30377220)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2009年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
• キーワード: 分子シミュレーション / 天然解鎖蛋白質 / 溶液X線散乱法

研究概要

解鎖蛋白質の構造特性を研究するために,ポリペプチド・コンホメーションの新しい生成法を開発した。この方法からの予測と溶液X線散乱測定の結果を比較して,高濃度変性剤溶液中の蛋白質の構造特性を解析した。ポリペプチド鎖の平均自乗半径の残基数依存性とKratkyプロフィルの形の解析から,高濃度変性剤溶液は,蛋白質に対して良溶媒であることが確認された。また構造集団が実測データを再現するためには,主鎖二面角がα領域内にある確率が20～40%でなければならないことが分かった。

研究成果

• [雑誌論文] Structural Characteristics of Hydration Sites in Lysozyme (2011)
  • 著者名/発表者名: Soda, K., Shimbo, Y., Seki, Y., Taiji, M.
  • 雑誌名: Biophysical Chemistry In Press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermodynamic and Structural Properties of the Acid Molten Globule State of Horse (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, S., Seki, Y., Katoh, E., Kidokoro, S.-i.
  • 雑誌名: Cytochrome c Biochemistry 50 ページ: 3116-3126
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermodynamic and Structural Properties of the Acid Molten Globule State of Horse Cytochrome c (2011)
  • 著者名/発表者名: 中村茂芳
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 50 ページ: 3116-3126
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Characteristics of Hydration Sites in Lysozyme (2011)
  • 著者名/発表者名: 曽田邦嗣
  • 雑誌名: Biophysical Chemistry 巻: (In Press)
  • 査読あり
• [学会発表] 溶液X線散乱とNMRの残余双極子結合による解けたタンパク質の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 関安孝
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] 溶液X線散乱とNMRの残余双極子結合による解けたタンパク質の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 関安孝
  • 学会等名: 日本生物物理学会
  • 発表場所: 東北大学(宮城県)
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] 解けたタンパク質のNMR残余双極子結合定数の推定法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 関安孝
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 分子モデリング法と溶液X線散乱法による天然解鎖蛋白質の構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 関安孝
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] 分子モデリング法と溶液X線散乱法による天然解蛋白質の構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 関安孝
  • 学会等名: 日本生物物理学会 第47回年会
  • 発表場所: アスティ徳島(徳島市)
  • 年月日: 2009-10-30