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核マトリクス付着領域予測プログラムMARcode法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21710197
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 基礎ゲノム科学
研究機関岡山大学

研究代表者

宮地 まり  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (50349255)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2010年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2009年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード核内構造 / 神経細胞 / 核構造 / 繰返し配列 / 核内高次構造 / DM結合タンパク質 / RNA結合タンパク質
研究概要

MARcode法開発のため、DNAトポイソメラーゼ(トポ)IIβと複合体を形成し、神経細胞分化過程で働くと考えられる核マトリクスタンパク質SP120に着目した。SP120がAT-richなトポIIβ作用点に特異的に結合することを示した。SP120のMAR結合ドメインを解析し、新たにRGドメインが活性を持つことを見出した。SP120がAまたはTが3つ以上連続する配列(AT-patch)に直接結合することを示した。網羅的解析により、多数のin vivo SP120結合領域を同定した。今後、同定配列を評価し、MARcode法完成を目指す。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (15件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Regulation of DNA topoisomerase IIβ through RNA-dependent association with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (hnRNP U).2010

    • 著者名/発表者名
      河野真二、宮地まり、一安詳子、筒井公、筒井研
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. Vol.285

      ページ: 26451-26460

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of DNA Topoisomerase IIβ through RNA-dependent association with beterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (hnRNP U).2010

    • 著者名/発表者名
      Kawano S., Miyaji M., Ichiyasu S., Tsutsui K.M., Tsutsui K.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 285 ページ: 26451-26460

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNAトポイソメラーゼIIβによる神経関連遺伝子の発現制御2009

    • 著者名/発表者名
      筒井研, 筒井公子, 宮地まり, 佐野訓明
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 Vol.54

      ページ: 1333-1343

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] DNAトポイソメラーゼIIβによる神経関連遺伝子の発現制御2009

    • 著者名/発表者名
      筒井研
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 54

      ページ: 13331343-13331343

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] From Topology to Topography : Regulation of Neuronal Genes by Targeted Action of DNA Topoisomerase IIβ2011

    • 著者名/発表者名
      Miyaji Mary
    • 学会等名
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      淡路島
    • 年月日
      2011-01-25
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] From Topology to Topography : Regulation of Neuronal Genes by Targeted Action of DNA Topoisomerase IIβ2011

    • 著者名/発表者名
      Mary Miyaji, Ryohei Furuta, Shinji Kawano, Kimiko Tsutsui, Ken Tsutsui
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      兵庫県淡路市
    • 年月日
      2011-01-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβ神経関連遺伝子へのターゲット機構2010

    • 著者名/発表者名
      宮地まり
    • 学会等名
      第33回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβ-SP120複合体形成におけるRNAの役割2010

    • 著者名/発表者名
      河野真二
    • 学会等名
      第33回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβの遠位通過部位マッピング法(eTIP-HiC)の開発2010

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第33回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβの神経関連遺伝子へのターゲット機構2010

    • 著者名/発表者名
      宮地まり、河野真二、古田良平、佐野訓明、筒井公子、筒井研
    • 学会等名
      分子生物学会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] トポIIβは、いかにして神経関連遺伝子の発現を誘導するか?2010

    • 著者名/発表者名
      宮地まり
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      修善寺
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] トポIIβは、いかにして神経関連遺伝子の発現を誘導するか?2010

    • 著者名/発表者名
      宮地まり, 河野真二, 古田良平, 筒井公子, 筒井研
    • 学会等名
      核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      静岡県伊豆市
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 核マトリックスタンパク質SP120/SAF-A/hnRNP UのDNA認識機構2009

    • 著者名/発表者名
      宮地まり
    • 学会等名
      第32回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-11
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 核マトリックスタンパク質SP120/SAF-A/hnRNP UのDNA認識機講2009

    • 著者名/発表者名
      宮地まり
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2009-12-11
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] トポイソメラーゼIIβとSP120/hnRNP U/SAF-Aの複合体形成機構2009

    • 著者名/発表者名
      河野真二
    • 学会等名
      第32回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβとSP120/hnRNP U/SAF-Aの複合体形成が酵素活性に及ぼす影響2009

    • 著者名/発表者名
      河野真二
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2009-10-23
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβによる神経関連遺伝子の発現制御機構2009

    • 著者名/発表者名
      佐野訓明
    • 学会等名
      第32回日本神経科学大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-09-16
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] トポIIβによる神経関連遺伝子の発現制御におけるSP120/hnRNP U/SAF-Aの役割2009

    • 著者名/発表者名
      山口(宮地)まり
    • 学会等名
      第8回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      修善寺
    • 年月日
      2009-06-19
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] トポIIβによる神経関連遺伝子の発現制御におけるSP120/hnRNPU/SAF-Aの役割2009

    • 著者名/発表者名
      山口(宮地)まり
    • 学会等名
      核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      静岡県伊豆市
    • 年月日
      2009-06-19
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://nbgp.med.okayama-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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