サンゴ-褐虫藻共生体の分子メカニズム～白化現象解明を目指して～

• 研究課題/領域番号: 21710199
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学 (2011); 独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構 (2009-2010)
• 研究代表者: 新里 宙也 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70524726)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2011年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / 白化現象 / 遺伝子発現応答

研究概要

サンゴと褐虫藻の共生システムの分子メカニズムを、次世代シークエンサーを用いて網羅的・ゲノム科学的に明らかにすることを目的とする。トランスクリプトームとゲノムの情報を用いて、サンゴ(コユビミドリイシAcropora digitifera)の全遺伝子を網羅したcDNAマイクロアレイを作成し、ストレス下での遺伝子発現変化を解析した。さらにサンゴのゲノム情報から、ストレス応答に関わっているとされる遺伝子について、ゲノム科学的な解析を行った。

研究成果

• [雑誌論文] The repertoire of chemical defense genes in the coral (2012)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C, Hamada M, Shoguchi E, Kawashima T, Satoh N
  • 雑誌名: Acropora digitifera genome Zoological Science 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fluorescent Protein Candidate Genes in the Coral Acropora digitifera Genome (2012)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C, Shoguchi E, Tanaka M, Satoh N
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 29 ページ: 260-264
  • NAID: 40019215564
  • URL: http://dx.doi.org/10.2108/zsj.29.260
  • 査読あり
• [雑誌論文] The repertoire of chemical defense genes in the coral Acropora digitifera genome (2012)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C, Hamada M, Shoguchi E, Kawashima T, Satoh N
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: (In press)
  • NAID: 40019360751
  • 査読あり
• [雑誌論文] サンゴの遺伝子研究のこれまでの歩みとゲノム解読による新展開 (2012)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 雑誌名: 海の研究 巻: (In press)
  • NAID: 110009490137
  • 査読あり
• [雑誌論文] Using the Acropora digitifera genome to understand coral responses to environmental change (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C, Shoguchi E, Kawashima T, Hamada M, Hisata K, Tanaka M, Fujie M, Fujiwara M, Koyanagi R, Ikuta T, Fujiyama A, Miller DJ, Satoh N
  • 雑誌名: Nature 巻: 476 号: 7360 ページ: 320-323
  • DOI: 10.1038/nature10249
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of fast-evolving genes in the scleractinian coral Acropora using comparative EST analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A, Shinzato C, Foret S, Miller DJ
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6 号: 6 ページ: e20140-e20140
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0020140
  • 査読あり
• [雑誌論文] サンゴ礁のゲノム科学 (2011)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 雑誌名: 生物の科学遺伝 巻: 65 ページ: 44-49
• [雑誌論文] Identification of fast-evolving genes in the scleractinian cocal Acropora using comparative EST analysis. (2011)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A, Shinzato C, Foret S, Miller DJ.
  • 雑誌名: PLos ONE 巻: (In press)
  • 査読あり
• [学会発表] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C
  • 学会等名: Workshop on Marine Evolutionary and Environmental Genomics
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 年月日: 2011-12-05
• [学会発表] Grenome sequencing of the coral Acropora digitifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Chuya Shinzato
  • 学会等名: Workshop on Marine Evolutionary and Environmental Genomics
  • 発表場所: Taipei, Taiwa
  • 年月日: 2011-12-05
• [学会発表] コユビミドリイシの全ゲノム解読とサンゴの環境変動への応答の理解 (2011)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也、佐藤矩行
  • 学会等名: 共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化-遺伝子から地球環境まで-」
  • 発表場所: 東京大学大気海洋研究所
  • 年月日: 2011-11-18
• [学会発表] コユビミドリイシ・ゲノムの解読 (2011)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会
  • 発表場所: 沖縄県那覇市
  • 年月日: 2011-11-05
• [学会発表] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C
  • 学会等名: The International Workshop"Searching for Eve : basal metazoans and the evolution of multicellular complexity"
  • 発表場所: Tutzing, Germany
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Chuya Shinzato
  • 学会等名: The International Workshop "Searching for Eve : basal metazoans and the evolution of multicellular complexity"
  • 発表場所: Tutzing, Germany
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C
  • 学会等名: ARC CoE Boden Conference-Genome Biology of Corals and their Relatives
  • 発表場所: Townsville, Australia
  • 年月日: 2011-03-07
• [学会発表] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera. (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinzato, C
  • 学会等名: ARC CoE Boden Conference-Genome Biology of Corals and their Relatives
  • 発表場所: オーストラリア、タウンズビル
  • 年月日: 2011-03-07
• [学会発表] サンゴ生物学へのゲノム科学的アプローチ～バイオミネラリゼーション研究への応用に向けて～ (2011)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化-遺伝子から地球環境まで-」
  • 発表場所: 東京大学 大気海洋研究所
  • 年月日: 2011-02-10
• [学会発表] コユビミドリイシのマイクロアレイの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会
  • 発表場所: つくばカピオ
  • 年月日: 2010-12-02
• [学会発表] 造礁サンゴ、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)のゲノム解読 (2010)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] The coral Acropora digitifera genome project (2010)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: Okazaki Biological conference
  • 発表場所: ヤマハリゾートつま恋(静岡)
  • 年月日: 2010-01-11
• [学会発表] The coral Acropora digitifera genome project (2009)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: International Symposium Marine Genomics
  • 発表場所: サザンプラザ海邦(沖縄)
  • 年月日: 2009-12-18
• [学会発表] コユビミドリイシ・ゲノムプロジェクト (2009)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会
  • 発表場所: 本部町中央公民館(沖縄)
  • 年月日: 2009-11-27
• [学会発表] The coral Acropora digitifera genome project (2009)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C
  • 学会等名: International Workshop : The evolution of multicellularity
  • 発表場所: Tutzing, Germany
  • 年月日: 2009-09-14
• [学会発表] The coral Acropora digitifera genome project (2009)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: International Workshop : The evolution of multicellularity
  • 発表場所: Tutzing(ドイツ)
  • 年月日: 2009-09-14
• [備考]
  • URL: http://www.irp.oist.jp/satoh/index.php