• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

定量プロテオミクスによる脱ユビキチン化酵素の網羅的基質探索

研究課題

研究課題/領域番号 21710200
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関東京大学

研究代表者

太田 一寿  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (00322727)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード翻訳後修飾 / ユビキチン / 出芽酵母 / プロテオミクス / 質量分析
研究概要

我々は独自に開発したポリユビキチン化タンパク質濃縮法と高感度質量分析技術を組み合わせることにより、出芽酵母ゲノムにコードされるUSP 型脱ユビキチン化酵素全16種類の網羅的基質同定を試みた。最終的に、94の潜在的な酵素-基質関係を同定し、その一部については分子生物学的な手法による確認作業を追加した。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (3件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] A yeast one-hybrid system to screen for methylated DNA-binding proteins.2010

    • 著者名/発表者名
      Feng SY., Ota K., Ito T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A yeast one-hybrid system to screen for methylated DNA-binding proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Feng SY, Ota K, Ito T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 38

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Remodeling of the SCF complex-mediated ubiquitination system by compositional alteration of incorporated F-box proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Kato, M., Kito, K., Ota, K.Ito, T.
    • 雑誌名

      Proteomics 10

      ページ: 115-123

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Remodeling of the SCF Complex-mediated Ubiquitination System by Compositional2009

    • 著者名/発表者名
      Kato M., Kito K., Ota K., Ito T.
    • 雑誌名

      Alteration of Incorporated F-box Proteins Proteomics

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Circular permutation of ligand-binding module improves dynamic range of genetically encoded FRET-based nanosensor.2009

    • 著者名/発表者名
      Okada S., Ota K., Ito T.
    • 雑誌名

      Protein Sci.

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] RSP5機能のユビキチン化による制御機構2010

    • 著者名/発表者名
      太田一寿、紀藤圭治、伊藤隆司
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-09
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア外膜蛋白質MDM34のユビキチン化機構2009

    • 著者名/発表者名
      太田一寿・岡田悟・伊藤隆司
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] USP型脱ユビキチン化酵素の網羅的基質探索2009

    • 著者名/発表者名
      廣田剛志・太田一寿・紀藤圭治・伊藤隆司
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://itolab.k.u-tokyo.ac.jp

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://itolab.k.u-tokyo.ac.jp

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://itolab2.cb.k.u-tokyo.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi