バイオインフォマティクスによるがん疾患診断手法の開発と治療標的遺伝子探索

• 研究課題/領域番号: 21710211
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: ゲノム情報科学
• 研究機関: 中部大学
• 研究代表者: 高橋 広夫 中部大学, 応用生物学部, 講師 (30454367)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2009年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 医療・福祉 / バイオマーカー / 癌 / 細胞・組織 / バイオテクノロジー

研究概要

申請者は以前よりがん診断マーカー抽出のための新バイオインフォマティクス手法の開発を行ってきたが、本研究では、新手法により抽出された遺伝子を標的とした、新しい抗がん剤の開発を行った。また、従来では、困難であった診断遺伝子セット評価法の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Forkhead box A1 transcriptional pathway in KRT7-expressing esophageal squamous cell carcinomas with extensive lymph node metastasis (2010)
  • 著者名/発表者名: Sano, M.Aoyagi, K.Takahashi, H.Kawamura, T.Mabuchi, T.Igaki, H.Tachimori, Y.Kato, H.Ochiai, A.Honda, H.Nimura, Y.Nagino, M.Yoshida, T.Sasaki, H.
  • 雑誌名: Int.J.Oncol. 36(2) ページ: 321-330
  • 査読あり
• [雑誌論文] Forkhead box A1 transcriptional pathway in KRT7-expressing esophageal squamous cell carcinomas with extensive lymph node metastasis (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Sano
  • 雑誌名: Int.J.Oncol. 36 ページ: 321-330
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of ENHANCER OF SHOOT REGENERATION 1-upregulated genes during in vitro shoot regeneration (2009)
  • 著者名/発表者名: Matsuo, N.Mase, H.Makino, M.Takahashi, H.Banno, H.
  • 雑誌名: Plant Biotechnol. 26(4) ページ: 385-393
  • NAID: 10026136124
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of ENHANCER OF SHOOT REGENERATION 1-upregulated genes during in vitro shoot regeneration (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Matsuo
  • 雑誌名: Plant Biotechnol. 26 ページ: 385-393
  • 査読あり
• [学会発表] 遺伝子セット抽出評価のための遺伝的アルゴリズムと並び替え検定を使用した手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 丸井誠堂
  • 学会等名: 第76回化学工学会年会
  • 発表場所: 東京農工大学(東京)
  • 年月日: 2011-03-23
• [学会発表] 遺伝子セット抽出評価のための遺伝的アルゴリズムと並び替え検定を使用した手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 丸井誠堂・小塩高広・高橋広夫・小林猛
  • 学会等名: 第76回化学工学会年会(震災により開催中止、発表は成立)
  • 発表場所: 東京農工大学
• [学会発表] Analysis of alternative splicing mechanism regulated by an Arabidopsis ASF/SF2-like serine/arginine-rich protein, atSR30, in response to high-light stress (2010)
  • 著者名/発表者名: 横山国大
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] Identification of genes whose alternative splicing events are regulated by an Arabidopsis serine/arginine-rich-related protein, atSR45a, in response to high-light stress using a tiling microarray. (2010)
  • 著者名/発表者名: 森達也
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] Identification of genes whose alternative splicing events are regulated by an Arabidopsis serine/arginine-rich-related protein, atSR45a, in response to high-light stress using a tiling microarray (2010)
  • 著者名/発表者名: 森達也・田部記章・丸田隆典・横山国大・佐藤信雄・高橋広夫・吉村和也・重岡成
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Analysis of alternative splicing mechanism regulated by an Arabidopsis ASF/SF2-like serine/arginine-rich protein, atSR30, in response to high-light stress (2010)
  • 著者名/発表者名: 横山国大・石川裕基・森達也・田部記章・丸田隆典・佐藤信雄・高橋広夫・吉村和也・重岡成
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 食道扁平上皮がんの悪性度と相関するリンパ節転移のFOXA転写経路を介した新たな分子機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 青柳一彦
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜パシフィコ(横浜)
  • 年月日: 2009-10-03
• [学会発表] New simple and practical gene filtering approach, modified signal-to-noise filtering method (2009)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi
  • 学会等名: European Biomarkers Summit 2009
  • 発表場所: Barcelona, Spain
• [学会発表] 食道扁平上皮がんの悪性度と相関するリンパ節転移のFOXA転写経路を介した新たな分子機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 青柳一彦・佐野正行・高橋広夫・馬渕智子・藤田剛・井垣弘康・日月裕司・本多裕之・落合淳志・吉田輝彦・佐々木博己
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] The AS2 regulates leaf polarity by repressing ETT/ARF3 in Arabidopsis. (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Iwasaki, H.Iwakawa, H.Takahashi, Y.Ueno, I.Pekker, Y.Eshed, S.Kojima, Y.Machida, C.Machida
  • 学会等名: Auxins and Cytokinins in Plant Development-Third International Symposium.
  • 発表場所: Prague, Czech Republic
• [学会発表] Arabidopsis DNA contains very few putative G-quadruplex sequence motifs. (2009)
  • 著者名/発表者名: A.Nakagawa, H.Takahashi, N.Sato, S.Kojima, B.-Y.Cha, J.-T.Woo, Y.Machida, C.Machida
  • 学会等名: In Proceedings of the 20th International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: Edinburgh, the United Kingdom