新規シッフ塩基型核酸の開発とメチルシトシン識別への応用

• 研究課題/領域番号: 21750171
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 堂野 主税 大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (60420395)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: バイオテクノロジー / メチル化核酸塩基 / クロスリンク / DNA / 分子認識 / 有機化学

研究概要

DNAの核酸塩基とのシッフ塩基形成反応に基づく、新しいDNAのメチル化塩基識別法を開発した。ホルミル基を有する人工核酸塩基を含むプローブDNAを用いると、対合する塩基との配列選択的シッフ塩基形成により、鎖問クロスリンクを生じる。本反応が有する、標的塩基上のメチル化の有無に対する高い感受性を用いることにより、DNA中のシトシン、アデニンのメチル化識別を達成した。

研究成果

• [雑誌論文] Ligand Inducible Assembly of a DNA Tetrahedron (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.代表, Atsumi, H.Nakatani, K.
  • 雑誌名: Chem.Commun. 47 ページ: 3499-3501
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand Inducible Assembly of a DNA Tetrahedron (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C., et al.
  • 雑誌名: Chem.Commun. 巻: 47 ページ: 3499-3501
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discrimination of N6-methyl Adenine in a Specific DNA Sequence (2010)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.代表, Shibata, T.Nakatani, K.
  • 雑誌名: Chem.Commun. 46 ページ: 5530-5532
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discrimination of N6-methyl Adenine in a Specific DNA Sequence (2010)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C., et al.
  • 雑誌名: Chem.Commun. 巻: 46 ページ: 5530-5532
  • 査読あり
• [雑誌論文] The effect of linker length on binding affinity of a photoswitchable molecular glue for DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: C.Dohno, et.al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 17 ページ: 2536-2543
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photoswitchable Unsymmetrical Ligand for DNA Hetero-Mismatches (2009)
  • 著者名/発表者名: C.Dohno, et.al.
  • 雑誌名: Eur.J.Org.Chem. ページ: 4051-4058
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Light-Driven, Supramolecular Optical Switch (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Uno, et.al.
  • 雑誌名: Angew.Chem.Int.Ed 48 ページ: 7362-7365
  • 査読あり
• [学会発表] Photoswitchable molecular glue for DNA Nanotechnology (2011)
  • 著者名/発表者名: Chikara Dohno, 代表、招待講演
  • 学会等名: International Symposium Advanced Science and Technology for Single Molecular Analysis of DNA and Related Molecules (ISSMA2011)
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Photoswitchable molecular glue for DNA Nanotechnology (2011)
  • 著者名/発表者名: Chikara Dohno
  • 学会等名: International Symposium : Advanced Science and Technology for Single Molecular Analysis of DNA and Related Molecules(ISSMA2011)
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)(招待講演)
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Discrimination of methylated bases in the specific sequence (2010)
  • 著者名/発表者名: 柴田知範、堂里主税,代表、中谷和彦
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
  • 発表場所: ホノルル(米国)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] ホルミル基含有修飾核酸によるDNAメチル化の識別 (2010)
  • 著者名/発表者名: 柴田知範
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 近畿大学(大阪府)
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] Adenine methylation-sensitive cross-link formation (2010)
  • 著者名/発表者名: 柴田知範
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC2010)
  • 発表場所: はまぎんホール(横浜)
• [学会発表] Discrimination of methylated bases in the specific squence (2010)
  • 著者名/発表者名: 柴田知範
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
  • 発表場所: ホノルル(米国)
• [学会発表] DNA cross-link generated by a novel modified DNA containing a formyl group (2009)
  • 著者名/発表者名: 柴田知範、堂里主税,代表, 中谷和彦
  • 学会等名: The sixth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 高山市民文化会館(岐阜県)
  • 年月日: 2009-09-27
• [学会発表] 核酸二次構造安定性を大きく変化させる新規光応答性小分子リガンド (2009)
  • 著者名/発表者名: 堂野主税
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡県)
  • 年月日: 2009-09-13