シロイヌナズナＤＣＬ１を用いた種子特異的ｐｒｅ-ｍｉＲＮＡ発現プロファイリング

• 研究課題/領域番号: 21770056
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 基礎生物学研究所
• 研究代表者: 立松 圭 基礎生物学研究所, 植物器官形成学研究室, 助教 (00373324)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: シロイヌナズナ / 機能性小分子RNA / pre-miRNA / AtDCL1タンパク質 / 種子休眠・発芽 / DCL1遺伝子 / HYL1遺伝子 / 過剰発現株

研究概要

miRNAの生合成因子であるDCL1タンパク質と結合するmiRNAの前駆体pre-miRNAを植物体から精製するために、抗体反応に必要なタグ配列をつないだDCL1遺伝子を過剰発現する形質転換体シロイヌナズナを作成した。形質転換体シロイヌナズナにおいてmRNA量やタンパク質量を測定し、導入したDCL1が発現していることを確認した。タグ配列を認識する抗体を用いた免疫沈降法を利用して、目的のpre-miRNAを精製する実験系を確立した。

研究成果

• [雑誌論文] Tissue-specific transcriptome analysis reveals cell wall metabolism, flavonol biosynthesis, and defense responses are activated in the endosperm of germinating Arabidopsis thaliana seeds. (2012)
  • 著者名/発表者名: Endo, A.*, Tatematsu, K.*, Hanada, K.*, Duermeyer, L., Okamoto, M., Yonekura-Sakakibara, K., Saito, K., Toyoda, T., Kawakami, N., Kamiya, Y., Seki, M., and Nambara, E.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 巻: 53, (*: Equally contributed) ページ: 16-27
  • NAID: 10030306944
  • 査読あり
• [雑誌論文] Abscisic acid and the control of seed dormancy and germination. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nambara, E., Okamoto, M., Tatematsu, K., Yano, R., Seo, M., Kamiya, Y.
  • 雑誌名: Seed Sci. Res. 巻: 20 ページ: 55-67
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of endogenous abscisic acid-mediated transcription in Arabidopsis seeds using tiling arrays. (2010)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, M., Tatematsu, K., Matsui, A., Morosawa, T., Ishida, J., Tanaka, M., Endo, T., Mochizuki, Y., Toyoda, T., Kamiya, Y., Shinozaki, K., Nambara E., and Seki, M.
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 62 ページ: 39-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of endogenous abscisic acid-mediated transcription in Arabidopsis seeds using tiling arrays (2010)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, et al
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 62 ページ: 39-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] Abscisic acid and the control of seed dormancy and germination (2010)
  • 著者名/発表者名: Nambara, et al
  • 雑誌名: Seed Science Research 巻: 20 ページ: 55-67
  • 査読あり
• [雑誌論文] Temporal expression patterns of hormone metabolism genes during imbibition of Arabidopsis thaliana Seeds: a comparative study on dormant and non-dormant accessions. (2009)
  • 著者名/発表者名: Preston, J.*, Tatematsu, K.*, Kanno, Y., Hobo, T., Kimura, M., Jikumaru, Y., Yano, R., Kamiya, Y., and Nambara, E.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 巻: 50, (*: Equally contributed) ページ: 1786-1800
  • NAID: 80020607108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nitrate responses of Arabidopsis cho1 mutants: obvious only when excess nitrate is supplied. (2009)
  • 著者名/発表者名: Nambara, E., Yamagishi, K., Tatematsu, K., Nakabayashi, K., and Kamiya, Y.
  • 雑誌名: Plant Signal. Behav. 巻: 4 ページ: 1164-1166
• [雑誌論文] Temporal expression patterns of hormone metabolism genes during imbibition of Arabidopsis thaliana Seeds : a comparative study on dormant and non-dormant accessions (2009)
  • 著者名/発表者名: Preston, Tatematsu et al.
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 50 ページ: 1786-1800
  • NAID: 80020607108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nitrate responses of Arabidopsis cho1 mutants : obvious only when excess nitrate is supplied (2009)
  • 著者名/発表者名: Nambara et al.
  • 雑誌名: Plant Singal.Behav. 4 ページ: 1164-1166
• [学会発表] Analysis of the genes that expressed in endosperms after imbibition of Arabidopsis seeds. (2011)
  • 著者名/発表者名: Nambara, E., Tatematsu K., Hanada, K., Okamoto, M., Endo, A., Seki, M., and Kamiya, Y.
  • 学会等名: Canadian Plant Genomic Workshop 2011
  • 発表場所: Niagara Falls, Canada
• [学会発表] miR165/166 might regulate non-cell-autonomously the expression domains of HD-Zip III in Arabidopsis leaf primordia. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu, K.
  • 学会等名: The 2nd NIBB-MPIPZ Joint Symposium Plant Science Communications 2010
  • 発表場所: NIBB, Okazaki, Japan
• [学会発表] Studies of ABA action on Arabidopsis seed germination (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu, K., Nakabayashi, K., Osuna, D., Fernandez-Arbaizar, A., Albertos-Arranz, P., Kamiya, Y., Lorenzo, O., and Nambara, E.
  • 学会等名: 3rd ISSS Workshop on Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Studies of ABA action on Arabidopsis seed germination (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu K., et al
  • 学会等名: 3rd ISSS Workshop on Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
  • 発表場所: イギリス ヨーク
• [学会発表] miR165/166 might regulate non-cell-autonomously the expression domains of HD-Zip III in Arabidopsis leaf primordia (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu K.
  • 学会等名: The 2nd NIBB-MPIPZ Joint Symposium Plant Science Communications 2010
  • 発表場所: 岡崎基礎生物学研究所
• [学会発表] シロイヌナズナ種子における吸水極初期の植物ホルモン代謝 (2009)
  • 著者名/発表者名: 南原英司, 立松圭, 菅野裕理, 保浦徳昇, 軸丸裕介, 神谷勇治
  • 学会等名: 植物化学調節学会第４４回大会
  • 発表場所: 東北大学, 仙台
• [学会発表] The role of miRNA in leaf development along the adaxial-abaxial axis in Arabidopsis thaliana. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu, K.
  • 学会等名: Japanese-German Symposium on Evolution and Development
  • 発表場所: Cologne, Germany
• [学会発表] シロイヌナズナ種子における吸水極初期の植物ホルモン代謝 (2009)
  • 著者名/発表者名: 南原, ら
  • 学会等名: 植物化学調節学会第44回大会
  • 発表場所: 仙台東北大学
• [備考] 自然科学研究機構基礎生物学研究所 一般公開「体験！生き物研究空間」 体験実験「生き物をDNA鑑定してみよう-PCR法による遺伝子解析-」, 20101002
• [備考] 自然科学研究機構基礎生物学研究所 高校生実験講座2010 「葉と花の生まれるところを見てみよう」 （共催：日本学術振興会 H22年度 ひらめき・ときめきサイエンス～ようこそ大学の研究室へ～KAKENHI） 20100821