• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

腐性ブドウ球菌に存在する唯一の接着因子UafAの構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 21770101
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 良和  北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (20374225)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード接着因子 / 結晶構造解析 / 腐性ブドウ球菌
研究概要

病原性細菌はホスト細胞に感染するための様々な接着因子を持つが,若年女性の尿路感染症の主要な原因菌の一つである腐性ブドウ球菌はUafAという1種類しか接着因子を持たない.本研究では, UafAの機能ドメインの結晶構造を1. 5Aの高分解能で決定した.他の生物由来の接着因子との構造比較から, Bドメインを用いた,新たなリガンド認識機構が提案された.

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2012 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (16件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Crystal Structure of the Octameric Pore of Staphylococcalγ-hemolysin Reveals theβ-barrel Pore Formation Mechanism by Two Components2011

    • 著者名/発表者名
      Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Yoshikazu Tanaka, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makoto Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 108 ページ: 17314-17319

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Futao Yu, Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Takeo Suzuki, Akiyoshi Nakamura, Nagisa Hirano, Tsutomu Suzuki, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 108 ページ: 19593-19598

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the functional region of Uro-adherence factor A(UafA) from Staphylococcus saprophyticus reveals participation of the B domain in ligand binding2011

    • 著者名/発表者名
      Eriko Matsuoka, Yoshikazu Tanaka, Makoto Kuroda, Yuko Shouji, Toshiko Ohta, Isao Tanaka, and Min Yao
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 20 ページ: 406-416

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Mutational Analyses of the Receptor Binding Domain of Botulinum D/C Mosaic Neurotoxin : Insight into the Ganglioside Binding Mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Nuemket Nipawan, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 411 ページ: 433-439

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of dihydrouridine synthase from Thermus thermophilus and its complex with tRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Futao Yu, Yoshikazu Tanaka, Shiho Yamamoto, Akiyoshi Nakamura, Shunsuke Kita, Nagisa Hirano, Isao Tanaka, and Min Yao
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: F67 ページ: 685-688

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 2-Methyl-2, 4-pentanediol induces spontaneous assembly of staphylococcal alpha-hemolysin into heptameric pore structure2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Potein Science

      巻: 20 ページ: 448-456

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the octameric pore of staphylococcal γ-hemolysin reveals the β-barrel pore formation mechanism by two components2011

    • 著者名/発表者名
      Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Yoshikazu Tanaka, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makoto Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 108 号: 42 ページ: 17314-17319

    • DOI

      10.1073/pnas.1110402108

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Mutational Analyses of the Receptor Binding Domain of Botulinum D/C Mosaic Neurotoxin : Insight into the Ganglioside Binding Mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Nuemket Nipawan, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao, Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communication

      巻: 411 ページ: 433-439

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the functional region of Uro-adherence factor A (UafA) from Staphylococcus saprophyticus reveals participation of the B do main in ligand binding.2011

    • 著者名/発表者名
      E.Matsuoka, Y.Tanaka, M.Kuroda, Y.Shouji, T.Ohta, I.Tanaka, M.Yao
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 20 ページ: 406-416

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 2-Methyl-2,4-pentanediol induces spontaneous assembly of staphylococcal alpha-hemolysin into heptameric pore structure2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Tanaka, N.Hirano, J.Kaneko, Y.Kamio, M.Yao, I.Tanaka
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 20 ページ: 448-456

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Energetic Hot-Spots for the Interaction between a Ladder-like Polycyclic Ether and the Anti-Ciguatoxin Antibody 10C9Fab.2011

    • 著者名/発表者名
      M.Ui, Y.Tanaka, T.Tsumuraya, I.Fujii, M.Inoue, M.Hirama, K.Tsumoto
    • 雑誌名

      Molecular BioSystems

      巻: 7 ページ: 793-798

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deduced RNA binding mechanism of ThiI based on structural and binding analyses of a minimal RNA ligand2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Tanaka, S.Yamagata, Y.Kitago, Y.Yamada, S.Chimnaronk, M.Yao, I.Tanaka
    • 雑誌名

      RNA 15

      ページ: 1498-1506

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The interaction of hyperthermophilic TATA-box binding protein with single-stranded DNA is entropically favorable and exhibits a large negative heat capacity change at high salt conce ntration2009

    • 著者名/発表者名
      S.Nagatoishi, Y.Tanaka, M.Kudou, K.Tsumoto
    • 雑誌名

      Mol.BioSyst. 5

      ページ: 957-961

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Contributions of interfacial residues of human Interleukin15 to the specificity and affinity for its private alpha-receptor2009

    • 著者名/発表者名
      S.Sakamoto, J.M.Caaveiro, E.Sano, Y.Tanaka, M.Kudou, K.Tsumoto
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 389

      ページ: 880-894

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Crystal structure of pore-forming toxin from Staphylococcus aureus-An example of the utility of crystal structure analysis-2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 学会等名
      Japan-Australia Symposium on Plant Sciences for Agriculture(JAS2012)
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 年月日
      2012-01-20
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal structure of pore-forming toxin from Staphylococcus aureus-An example of the utility of crystal structure analysis-2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      Japan-Australia Symposium on Plant Sciences for Agriculture (JAS2012)
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2012-01-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Thermus thermophilus由来ジヒドロウリジン合成酵素とtRNA複合体の結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      田中良和, Yu Futao, 山下恵太郎, 鈴木健夫, 中村彰良, 平野なぎ沙, 鈴木勉, 姚閔, 田中勲
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2011-11-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Crystal Structure of the Octameric Pore of Staphylococcal gamma-hemolysin2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 学会等名
      The Eighth International Conference on Flow Dynamics(ICFD2011)
    • 発表場所
      ホテルメトロポリタン仙台(仙台市)
    • 年月日
      2011-11-10
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal Structure of the Octameric Pore of Staphylococcal gamma-hemolysin2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      The Eighth International Conference on Flow Dynamics (ICFD2011)
    • 発表場所
      宮城県
    • 年月日
      2011-11-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来巨大蛋白質Ebhの全体構造に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      田中良和
    • 学会等名
      日本化学会東北支部化学系学協会東北大会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来巨大蛋白質Ebhの全体構造に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      田中良和
    • 学会等名
      日本化学会東北支部化学系学協会東北大会
    • 発表場所
      宮城県
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure of dihydrouridine synthase in complex with RNA reveals its tRNA recognition and reaction mechanisms2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Futao Yu, Keitaro Yamashita, Akiyoshi Nakamura, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki, Min Yao, and Isao Tanaka
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting of the RNA Society(Kyoto)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府)
    • 年月日
      2011-06-17
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal structure of dihydrouridine synthase in complex with RNA reveals its tRNA recognition and reaction mechanisms2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Futao Yu, Keitaro Yamashita, Akiyoshi Nakamura, Takeo Suzuki, Tsutorou Suzuki, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting of the RNA Society (Kyoto)
    • 発表場所
      京都府
    • 年月日
      2011-06-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] RNA binding mechanism of ThiI deduced from structural and binding analyses of a minimal RNA ligand2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Shiori Yamagata, Yu Kitago, Yoko Yamada, Sarin Chimnaronk, Min Yao and Isao Tanaka
    • 学会等名
      Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 部分RNAの結晶構造解析から推察されたtRNAチオ化修飾酵素ThiIのtRNA認識機構2010

    • 著者名/発表者名
      田中良和
    • 学会等名
      九州シンポジウム
    • 発表場所
      玄海ロイヤルホテル(宗像市)
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] Deduced RNA binding mechanism of ThiI2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Shiori Yamagata, Yu Kitago, Yoko Yamada, Sarin Chimnaronk, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      Protein Society
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来α-hemolysinの自発的7量体形成2010

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 平野なぎ沙, 河内宏樹, 山下恵太郎, 金子淳, 神尾好是, 姚閔, 田中勳
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来a-ヘモリジンは自発的に7量体へと会合する2010

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 平野なぎ沙, 河内宏樹, 山下恵太郎, 金子淳, 神尾好是, 姚閔, 田中勳
    • 学会等名
      毒素シンポジウム
    • 発表場所
      長浜ロイヤルホテル(長浜市)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] tRNAチオ化修飾酵素ThiIのRNA認識機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 山形しおり, 北郷悠, 山田洋子, チムナロンサリン, 姚閔, 田中勲
    • 学会等名
      RNA学会
    • 発表場所
      新潟、新潟コンベンミョンセンター
    • 年月日
      2009-07-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] tRNAチオ化修飾酵素 ThiIのtRNA認識機構2009

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 山形しおり, 北郷悠, 山田洋子, チムナロンサリン, 姚閔, 田中勲
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本、熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2019-06-06  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi