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SAIL法を用いたジスルフィド架橋結合の位置および立体配座決定法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21770110
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 構造生物化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

武田 光広  名古屋大学, 理学研究科, 研究員 (90508558)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2009年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード蛋白質 / NMR / タンパク質 / SAIL法 / ジスルフィド結合
研究概要

蛋白質中のジスルフィド(S-S)結合の位置および立体配座の情報は蛋白質の構造形成・安定化機構の理解に重要であるが、その有効な解析手法が確立していない。本研究においては、S-S結合を構成する2つのシステイン残基のベータプロトン間NOEを、高度安定同位体標識タンパク質調製技術SAIL(立体整列同位体標識)法を利用して観測することにより、その位置と立体配座を決定する方法を開発した。同手法は、解析対象のベータプロトン以外の水素を完全に重水素置換する事により、従来の均一標識タンパク質において問題となるシグナルの縮重やスピン拡散の問題を回避する。この結果、高感度かつ高い定量性を保持したままNOEを観測し、S-S結合の位置・立体配座を決定出来る。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Construction and performance of an NMR tube with a sample cavity formed within magnetic susceptibility-matched glass.2011

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Hallenga K, Shigezane M, Waelchli M, Lohr F, Markley JL, Kainosho M.
    • 雑誌名

      J.Magn.Reson. 209

      ページ: 167-173

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Construction and performance of an NMR tube with a sample cavity formed within magnetic susceptibility-matched glass.2011

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Hallenga K, Shigezane M, Waelchli M, Lohr F, Markley JL, Kainosho M.
    • 雑誌名

      Journal of Magnetic Resonance

      巻: 209 ページ: 167-173

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of stereoarray isotope labeled (SAIL) lysine via the head-to-tail conversion of SAIL glutamic acid2011

    • 著者名/発表者名
      Terauchi T, Kamikawai T, Vinogradov MG, Starodubtseva EV, Takeda M, Kainosho M.
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 13 ページ: 161-163

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Application of SAIL phenylalanine and tyrosine with alternative isotope-labeling patterns for protein structure determination.2010

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Ono AM, Terauchi T, Kainosho M.
    • 雑誌名

      J.Biomol.NMR 46

      ページ: 45-49

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of the sulfhydryl groups in proteins with slow hydrogen exchange rates and determination of their proton/deuteron fractionation factors using the deuterium-induced effects on the 13C(beta) NMR signals.2010

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Jee J, Terauchi T, Kainosho M.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 132

      ページ: 6254-6260

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of the sulfhydryl groups in proteins with slow hydrogen exchange rates and determination of their proton/deuteron fractionation factors using the deuterium-induced effects on the 13C(beta)NMR signals.2010

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Jee J, Terauchi T, Kainosho M
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 132 ページ: 6254-6260

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Application of SAIL phenylalanine and tyrosine with alternative isotope-labeling patterns for protein structure determination.2010

    • 著者名/発表者名
      武田光広、小野明、寺内勉、甲斐荘正恒
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR Vol.46

      ページ: 45-49

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydrogen exchange rate of tyrosine hydroxyl groups in proteins as studied by the deuterium isotope effect on C(zeta) chemical shifts.2009

    • 著者名/発表者名
      Takeda M, Jee J, Ono AM, Terauchi T, Kainosho M.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 131

      ページ: 18556-18562

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydrogen exchange rate of tyrosine hydroxyl groups in proteins as studied by the deuterium isotope effect on C(zeta) chemical shifts.2009

    • 著者名/発表者名
      武田光広、JunGoo Jee,小野明、寺内勉、甲斐荘正恒
    • 雑誌名

      Journal of the American chemical society Vol.131

      ページ: 18556-18562

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 蛋白質側鎖OH/SHの水素交換速度の解析2010

    • 著者名/発表者名
      武田光広、Chun-Jiun Yang、JunGoo Jee、小野明、寺内勉、甲斐荘正恒
    • 学会等名
      第49回NMR討論会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-11-15
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 蛋白質側鎖OH/SHの水素交換速度の解析2010

    • 著者名/発表者名
      武田光広、Chun-Jiun Yang、JunGoo Jee、小野明、寺内勉、甲斐荘正恒
    • 学会等名
      第49回NMR討論会
    • 発表場所
      東京タワーホール船堀
    • 年月日
      2010-11-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] NMR Hydrogen Exchange Study of Tyrosine Hydroxyl and Cysteine Sulfhydryl Groups by Deuterium Isotope Shift Effects2010

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Takeda, Akira M Ono, Tsutomu Terauchi, JunGoo Jee, Masatsune Kainosho
    • 学会等名
      Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference
    • 発表場所
      Florence Italy
    • 年月日
      2010-07-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] NMR Hydrogen Exchange Study of Tyrosine Hydroxyl and Cysteine Sulfhydryl Groups by Deuterium Isotope Shift Effects2010

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Takeda, Akira Mono, Tsutomu Terauchi, JunGoo Jee, Masatsune Kainosho
    • 学会等名
      Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference
    • 発表場所
      Palazzo dei Congressi and Palazzo degli Affari, Florence Italy
    • 年月日
      2010-07-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] SAIL芳香族アミノ酸による蛋白質の構造・動態解析2009

    • 著者名/発表者名
      武田光広、甲斐荘正恒
    • 学会等名
      第48回NMR討論会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-11-10
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] SAIL芳香族アミノ酸による蛋白質の構造・動態解析2009

    • 著者名/発表者名
      武田光広、甲斐荘正恒
    • 学会等名
      第48回NMR討論会
    • 発表場所
      九州大学百年構造(福岡県)
    • 年月日
      2009-11-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Application of SAIL phenylalanine and tyrosine residues with different isotope labeling patterns for structure2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Takeda, Akira Mei Ono, Tsutomu Terauchi, Masatsune Kainosho
    • 学会等名
      Asia-Pacific NMR
    • 発表場所
      Jeju Korea
    • 年月日
      2009-10-25
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Application of SAIL phenylalanine and tyrosine residues with different isotope labeling patterns for structure determination2009

    • 著者名/発表者名
      武田光広、甲斐荘正恒
    • 学会等名
      The 3rd Asia-Pacific NMR Symposium
    • 発表場所
      済州島(韓国)
    • 年月日
      2009-10-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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