天然変性タンパク質としての観点に基づくiPS細胞誘導因子Sox2の動態と機能解析

• 研究課題/領域番号: 21770126
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 公益財団法人サントリー生命科学財団 (2010); (財)サントリー生物有機科学研究所 (2009)
• 研究代表者: 菅瀬 謙治 公益財団法人サントリー生命科学財団, 生物有機科学研究所, 主席研究員 (00300822)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2009年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 分子認識及び相互作用 / 分子認識および相互作用

研究概要

NMR緩和分散実験から、Sox2は遊離状態において揺らいでおり、DNAに結合する第1ヘリックス及びそれと接触する領域が約2%瞬間的にほどけていることが分かった。一方でDNA結合型では緩和分散は観測されず、DNA結合型はマイクロ秒からミリ秒のタイムスケールでは安定であることが分かった。これらの結果から、遊離状態で観測された揺らぎはDNAとの非特異的な結合に関与していることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Calcitonin in a protochordate, Ciona intestinalis--the prototype of the vertebrate calcitonin/calcitonin gene-related peptide superfamily. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sekiguchi T, Suzuki N, Fujiwara N, Aoyama M, Kawada T, Sugase K, Murata Y, Sasayama Y, Ogasawara M, Satake H
  • 雑誌名: FEBS J. Vol.276 ページ: 4437-4447
  • 査読あり
• [雑誌論文] Calcitonin in a protochordate, Ciona intestinalis-the prototype of the vertebrate calcitonin/calcitonin gene-related peptide superfamily (2009)
  • 著者名/発表者名: Sekiguchi T, Suzuki N, Fujiwara N, Aoyama M, Kawada T, Sugase K, Murata Y, Sasayama Y, Ogasawara M, Satake H
  • 雑誌名: FEBS J. 276 ページ: 4437-4447
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidating slow binding kinetics of a protein without observable bound resonances by longitudinal relaxation NMR spectroscopy
  • 著者名/発表者名: Sugase K
  • 雑誌名: J.Biomol.NMR in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lipopolysaccharide induces raft domain expansion in membrane composed of a phospholipid-cholesterol-sphingomyelin ternary system.
  • 著者名/発表者名: Nomura K, Maeda M, Sugase K, Kusumoto S
  • 雑誌名: Innate Immun. in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidating slow binding kinetics of a protein without observable bound resonances by longitudinal relaxation NMR spectroscopy
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase
  • 雑誌名: Journal of Biomolecular NMR 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Fluctuation and function of nuclear proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Fluctuation and function of nuclear proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学(岩手県)
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Fitting Relaxation Dispersion Data With A New Software Package GLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Cairns, Australia
  • 年月日: 2010-08-24
• [学会発表] Fitting Relaxation Dispersion Data With A New Software Package GLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Cairns convention centre (Australia)
  • 年月日: 2010-08-24
• [学会発表] NMRによるヘムオキシゲナーゼのヘム認識機構の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所(大阪府)
  • 年月日: 2010-07-30
• [学会発表] NMR による天然変性タンパク質の動的構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] NMRによる天然変性タンパク質の動的構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 緩和分散解析用プログラムGLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第49回NMR討論会
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 動きの面から見た核内タンパク質の機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム第3回研究交流会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-04
• [学会発表] 動きの面から見た核内タンパク質の機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム第3回研究交流会
  • 発表場所: 東京大学(東京)
  • 年月日: 2010-03-04
• [学会発表] 天然変性状態と機能の相関 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 天然変性状態と機能の相関 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] Elucidation of protein-protein interactions by relaxation NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: The 3rd APNMR Biannual Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Jeju, Korea
  • 年月日: 2009-10-27
• [学会発表] Elucidation of protein-protein interactions by relaxation NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: The 3rd APNMR Biannual Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Ramada hotel(Jeju, Korea)
  • 年月日: 2009-10-27
• [学会発表] 天然変性タンパク質の構造と機能の最前線 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第49回生命科学夏の学校
  • 発表場所: 三田
  • 年月日: 2009-08-30
• [学会発表] 天然変性タンパク質の構造と機能の最前線 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第49回 生命科学 夏の学校
  • 発表場所: 神戸セミナーハウス(三田)
  • 年月日: 2009-08-30
• [図書] Water and Biomolecules : Physical Chemistry of Life Phenomena (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering) (ed. Kuwajima K, Goto Y, Hirata F, Terazima M, Kataoka M) (2009)
  • 著者名/発表者名: Wright PE, Felitsky DJ, Sugase K, Dyson HJ
  • 総ページ数: 307
• [図書] Water and Biomolecules : Physical Chemistry of Life Phenomena(Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering)(ed.Kuwajima K, Goto Y, Hirata F, Terazima M, Kataoka M) (2009)
  • 著者名/発表者名: Wright PE, Felitsky DJ, Sugase K, Dyson HJ
  • 総ページ数: 307
  • 出版者: Springer-Verlag
• [備考] ホームページ等
• [備考]
  • URL: http://www.sunbor.or.jp