試験管内再現系を用いた、クロマチンの構造制御/転写活性制御の解析

• 研究課題/領域番号: 21770167
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 国立遺伝学研究所 (2010-2011); 京都大学 (2009)
• 研究代表者: 日詰 光治 国立遺伝学研究所, 細胞遺伝研究系, 助教 (10378846)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: タンパク質 / 核酸の構造・動態・機能 / クロマチン / ヌクレオソーム / 原子間力顕微鏡 / DNA複製 / 原子力間顕微鏡 / 試験管内再構成

研究概要

クロマチン構造を変化させる因子と、その因子がもたらす具体的な構造変化の相関を明らかにすることを目指し、以下のことを明らかにした。(1)コアヒストンのアセチル化によりもたらされるヌクレオソーム間の反発力の強化と、リンカーヒストン依存的ファイバーの太さの変化を明らかにした。(2)ヌクレオソームのスライディングや解離の様子を、高速AFMによる動画観察により可視化解析を行った。(3)複製開始領域を決定するORCにより形成されるクロマチン/ORC複合体のAFM可視化解析を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Nano-scale analyses of the chromatin decompaction induced by histone acetylation (2011)
  • 著者名/発表者名: Hizume, K., Araki, S., Hata, K., Prieto, E., Kundu, T. K., Yoshikawa, K., and Takeyasu, K.
  • 雑誌名: Arch Histol Cytol 巻: 73 ページ: 149-163
  • NAID: 10030516588
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nano-scale analysis of the chromatin decompaction induced by histone acetylation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kohji Hizume
  • 雑誌名: Archives of Histology and Cytology 巻: Vol.73,Num3 ページ: 149-163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular dynamics of DNA and nucleosomes in solution studied by fast-scanning atomic force microscopy (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, Y., Higuchi, Y., Hizume, K., Yokokawa, M., Yoshimura, S. H., Yoshikawa, K., and Takeyasu, K.
  • 雑誌名: Ultramicroscopy 巻: 110 ページ: 682-688
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular dynamics of DNA and nucleosomes in solution studied by fast-scanning atomic force microscopy (2010)
  • 著者名/発表者名: Yuki Suzuki, Yuji Higuchi, Kohji Hizume, Masatoshi Yokokawa, Shige H.Yoshimura, Kenichi Yoshikawa, Kunio Takeyasu
  • 雑誌名: Ultramicroscopy (印刷中)(未定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-molecule anatomy by atomic force microscopy and recognition imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, H., Hizume, K., Kumeta, M., S, H. Y., and Takeyasu, K.
  • 雑誌名: Arch Histol Cytol 巻: 72 ページ: 217-225
  • NAID: 10028159728
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural properties of yeast chromatin fiber examined by AFM and in vitro reconstitution system (2009)
  • 著者名/発表者名: Prieto, E., Hizume, K., Takeyasu, K., and Yoshimura, S. H.
  • 雑誌名: Proceedings of 2009 International Symposium on Micro-Nano Mechatronics and Human Science ページ: 145-149
• [学会発表] Analysis of the interaction between chromatin and the origin recognition complex using atomic force microscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: 日詰光治、矢倉勝、荒木弘之
  • 学会等名: 日本分子生物学会第34回年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Analysis of the interaction between chromatin and the origin recognition complex using atomic force microscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: 日詰光治
  • 学会等名: 日本分子生物学会第34回年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Structural properties of yeast chromatin fiber examined by AFM and in vitro reconstitution system (2009)
  • 著者名/発表者名: Prieto, E., Hizume, K., Takeyasu, K., and Yoshimura, S. H.
  • 学会等名: 2009 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2009-11-10
• [学会発表] Structural properties of yeast chromatin fiber examined by AFM and in vitro reconstitution system. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kohji Hizume
  • 学会等名: 2009 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2009-11-10