光クロスリンク法によるタンパク質間相互作用ネットワークの解析

• 研究課題/領域番号: 21770195
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 佐藤 文 独立行政法人理化学研究所, 拡張遺伝暗号システム研究チーム, 特別研究員 (30469902)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 蛋白質 / 光クロスリンク / 非天然型アミノ酸 / 分子間相互作用

研究概要

「光クロスリンク法」は,生細胞中で形成されているタンパク質複合体を安定化して単離し,解析することのできる新しい研究手法である.本研究では,光クロスリンク法をタンパク質間相互作用ネットワークの解明に応用することを目的として,数種類のタンパク質結合ドメインについて光クロスリンカーを導入する適切な位置を特定し,その知見を収集することができた.さらに,光クロスリンク法により架橋したタンパク質複合体の結晶構造解析に成功した.

研究成果

• [雑誌論文] Genetic Incorporation of a Photo-Crosslinkable Amino Acid Reveals Novel Protein Complexes with GRB2 in Mammalian Cells. (2011)
  • 著者名/発表者名: 樋野展正、尾山大明、佐藤文、向井崇人、伊良波史枝、林明子、秦裕子、山本雅、横山茂之、坂本健作
  • 雑誌名: Journal of molecular biology 406 ページ: 343-353
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallographic Study of a Site-Specifically Cross-Linked Protein Complex with a Genetically Incorporated Photoreactive Amino Acid. (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤心、三桝信哉、佐藤文、樋野展正、坂本健作、梅原崇史、横山茂之
  • 雑誌名: Biochemistry 50 ページ: 250-257
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic Incorporation of a Photo-Crosslinkable Amino Acid Reveals Novel Protein Complexes with GRB2 in Mammalian Cells. (2011)
  • 著者名/発表者名: 樋野展正、尾山大明、佐藤文、向井崇人、伊良波史枝、林明子、秦裕子、山本雅、横山茂之、坂本健作
  • 雑誌名: Journal of molecular biology 巻: 406 ページ: 343-353
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallographic Study of a Site-Specifically Cross-Linked Protein Complex with a Genetically Incorporated Photoreactive Amino Acid. (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤心、三桝信哉、佐藤文、樋野展正、坂本健作、梅原崇史、横山茂之
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 50 ページ: 250-257
  • 査読あり
• [雑誌論文] Codon reassignment in the Escherichia coli genetic code. (2010)
  • 著者名/発表者名: 向井崇人、林明子、伊良波史枝、佐藤文、大竹和正、横山茂之、坂本健作
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 38 ページ: 8188-8195
  • 査読あり
• [雑誌論文] Codon reassignment in the Escherichia coli genetic code. (2010)
  • 著者名/発表者名: 向井崇人、林明子、伊良波史枝、佐藤文、大竹和正、横山茂之、坂本健作
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 38 ページ: 8188-8195
  • 査読あり
• [学会発表] 大腸菌におけるRF-1ノックアウトによるUAGコドンの再定義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、向井崇人、林明子、伊良波史枝、大竹和正、横山茂之、坂本健作
  • 学会等名: 第5回無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 岡山県岡山市
• [学会発表] 大腸菌におけるRF-1ノックアウトによるUAGコドンの再定義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、向井崇人、林明子、伊良波史枝、大竹和正、横山茂之、坂本健作
  • 学会等名: 第5回 無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 岡山市
• [学会発表] サプレッサーtRNAの改変による無細胞翻訳系における非天然型アミノ酸のタンパク質への導入効率の向上 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、坂本健作、横山茂之、大野敏、横川隆志、西川一八
  • 学会等名: 第4回無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 岐阜県下呂市
• [学会発表] サプレッサーtRNAの改変による無細胞翻訳系における非天然型アミノ酸のタンパク質への導入効率の向上 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、坂本健作、横山茂之、大野敏、横川隆志、西川一八
  • 学会等名: 第4回 無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 岐阜県下呂市
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://protein.gsc.riken.jp/sakamoto/
• [備考]
  • URL: http://protein.gsc.riken.jp/sakamoto/