研究課題/領域番号 |
21780011
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研究種目 |
若手研究(B)
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配分区分 | 補助金 |
研究分野 |
育種学
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研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 |
研究代表者 |
持田 恵一 独立行政法人理化学研究所, バイオマス研究基盤チーム, 上級研究員 (90387960)
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研究協力者 |
櫻井 哲也 独立行政法人理化学研究所, ゲノム情報統合化研究ユニット, ユニットリーダー (90415167)
吉田 拓広 独立行政法人理化学研究所, ゲノム情報統合化研究ユニット, テクニカルスタッフ
上原 由紀子 独立行政法人理化学研究所, バイオマス研究基盤チーム, テクニカルスタッフ
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研究期間 (年度) |
2009 – 2010
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研究課題ステータス |
完了 (2010年度)
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配分額 *注記 |
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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キーワード | イネ科植物 / 遺伝子共発現 / 比較ゲノム / ゲノムデータベース / データベース / トランスクリプトーム |
研究概要 |
本研究では、穀物の遺伝子発現ネットワークの情報学的な解析と関連データベース群の体系的な統合を行い、穀物での有用遺伝子探索とその育種利用に向けたゲノム知識基盤の構築を行った。特に、オオムギ遺伝子共発現解析を行い、ムギ類での有用遺伝子探索のための知識基盤を構築した(Mochida et al.2011)。また、比較ゲノム情報基盤に基づいた、イネ科6植物の転写因子データベースを構築し、イネ科穀物での遺伝子制御ネットワークを理解するための知識基盤を整備した(Mochida et al.provisionally accepted)。
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