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ATMT法による深在性真菌治療薬ミカファンギンの生合成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21780079
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学
研究機関富山県立大学

研究代表者

山田 雅人  富山県立大学, 工学部, 助教 (40448692)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2010年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードミカファンギン / FR901379 / Coleophoma empetri / ATMT / NRPS / 変異解析 / 抗生物質 / スクリーニング
研究概要

エキノカンジン群物質の1つであるFR901379を生産する糸状菌Coleophoma empetri F-11899のアグロバクテリウム形質転換法によるT-DNA挿入変異解析と次世代シーケンスによるドラフトゲノム解析によって生合成関連遺伝子群を見いだした。しかしながら、その生合成関連遺伝子群がコードされているクラスター領域は非常に大きく、機能未知の遺伝子や酸化還元酵素の遺伝子の数が多いことなどから、FR901379生産菌のゲノム配列情報だけからでは生合成経路や反応の単純な推定は困難であった。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of antifungal lipopeptide producing fungus Coleophoma empetri F-118992009

    • 著者名/発表者名
      Yamada M, Yawata K, Orino Y, Ueda S, Isogai Y, Taguchi G, Shimosaka M, Hashimoto S
    • 雑誌名

      Current Genetics

      巻: 55 ページ: 623-630

    • URL

      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=19876630

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of antifungal lipopeptide producing fungus Coleophoma empetri F-11899.2009

    • 著者名/発表者名
      Yamada M, Yawata K, Orino Y, Ueda S, Isogai Y, Taguchi G, Shimosaka M, Hashimoto S.
    • 雑誌名

      Current Genetics 55

      ページ: 623-630

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における異種発現のためのgpdプロモーターの単離2011

    • 著者名/発表者名
      浅井 剛久、山田 雅人、上田 聡、磯貝 泰弘、橋本 正治
    • 学会等名
      2011年度(平成23年度)日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都)
    • 年月日
      2011-03-27
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における2種の次世代シーケンサーを用いたゲノムアセンブル配列の比較2011

    • 著者名/発表者名
      中谷和也、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂(東京)
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899のFR901379非生産株のT-DNA挿入変異箇所の解析2011

    • 著者名/発表者名
      境井千佳子、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂(東京)
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899のFR901379非生産株のT-DNA挿入変異箇所の解析2011

    • 著者名/発表者名
      境井千佳子、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における2種の次世代シーケンサーを用いたゲノムアセンブル配列の比較2011

    • 著者名/発表者名
      中谷和也、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における異種タンパク質発現用プロモーターの検討2010

    • 著者名/発表者名
      浅井 剛久、山田 雅人、磯貝 泰弘、橋本 正治
    • 学会等名
      2010年度(平成22年度)日本生物工学会
    • 発表場所
      ワールドコンベンションセンターサミット宮崎シーガイア(宮崎)
    • 年月日
      2010-10-29
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] ミカファンギン原体生産糸状菌Coleophoma empetri F-11899のATMT変異株ライブラリーの作製とFR901379非生産株の単離2010

    • 著者名/発表者名
      山田 雅人、織野 陽介、境井 千佳子、磯貝 泰弘、橋本 正治
    • 学会等名
      2010年度(平成22年度)日本農芸化学会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(東京)
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ミカファンギン原体生産糸状菌Coleophoma empetri F-11899のATMT変異株ライブラリーの作製とFR301379非生物産株の単離2010

    • 著者名/発表者名
      ○山田雅人、織野陽介、境井千佳子、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      2010年度(平成22年度)日本農芸化学会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(東京都)
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Coleophoma empetriのATMT変異株ライブラリーの作製とミカファンギン原体生合成遺伝子の単離2009

    • 著者名/発表者名
      山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      石川富山福井県大合同シンポジウム
    • 発表場所
      あわらおんせん越路(福井)
    • 年月日
      2009-12-18
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Coleophoma empetriのATMT変異株ライブラリーの作製とミカファンギン原体生合遺伝子の単離2009

    • 著者名/発表者名
      ○山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
    • 学会等名
      石川富山福井県大合同シンポジウム
    • 発表場所
      あわらおんせん越路(福井県)
    • 年月日
      2009-12-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation as a tool for genomics in an industrially important fungus2009

    • 著者名/発表者名
      Yamada M, Yawata K, Hashimoto S, Shimosaka M
    • 学会等名
      The Society for Industrial Microbiology, The Annual Meeting and Exhibition 2009
    • 発表場所
      WESTIN Harbour Hotel, (Toronto, Canada)
    • 年月日
      2009-07-27
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation as a tool for genomics in an industrially important fungus.2009

    • 著者名/発表者名
      ○Yamada M, Yawata K, Hashimoto S, Shimosaka M
    • 学会等名
      The Society for Industrial Microbiology, The Annual Meeting and Exhibition 2009
    • 発表場所
      WESTIN Harbour Hotel (Toronto, Canada)
    • 年月日
      2009-07-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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