高効率DNA連結反応に関与するタンパク質複合体の構造・機能解析

• 研究課題/領域番号: 21780102
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用生物化学
• 研究機関: 独立行政法人日本原子力研究開発機構
• 研究代表者: 山田 貢 独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 博士研究員 (80510924)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
• キーワード: 生体分子 / タンパク質 / 生物物理 / 酵素反応 / バイオテクノロジー / 構造生物

研究概要

ラジオデュランスは二種類のDNAリガーゼ(DR2069、DRB0100)を持っている。解析の結果、DR2069にはDNAリガーゼ活性が認められたが、DRB0100はDNAリガーゼ活性は認められなかった。一方でDNAリガーゼによる連結反応の前段階において消化酵素からDNAを保護するDdrAタンパク質の結晶解析を実施し、結晶化、回折データ収集に成功した。最大分解能2.1Åまでの良好な回折データを収集し、現在構造解析中である。

研究成果

• [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of DNA damage response A protein from Deinococcus radiodurans (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamada M., Satoh K., Narumi I.
  • 雑誌名: R1Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 66 ページ: 1614-1616
  • 査読あり
• [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of DNA damage response A protein from Deinococcus radiodurans R1 (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamada M., Satoh K., Narumi I.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 巻: 66 ページ: 1614-1616
  • 査読あり
• [学会発表] 放射線抵抗性細菌由来DNA修復促進タンパク質PprAの構造機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田, 貢
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] Structural and functional analysis of PprA from Deinococcus radiodurans (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田貢、安達基泰、佐藤勝也、玉田太郎、由良敬、黒木良太、鳴海一成
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
• [備考] ホームページ等