分子生物学的アプローチによる木材腐朽部に存在する微生物の群集構造解析

• 研究課題/領域番号: 21780164
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 木質科学
• 研究機関: 東京農工大学
• 研究代表者: 吉田 誠 東京農工大学, 大学院・農学研究院, 特任准教授 (30447510)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2009年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
• キーワード: 木材腐朽 / 菌類

研究概要

リボソームDNA の介在配列であるITSを対象とした変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)法を用いて,腐朽在中に存在する菌類を検出する技術を開発した。本手法で解析した結果,腐朽在中には多様な糸状菌類が存在していることが明らかとなった。さらに,FISH法により菌糸の可視化が可能かどうかを検討したところ,DNA プローブを用いた際には腐朽菌の検出が困難であったが,ペプチド核酸(PNA)プローブを用いた場合には腐朽菌を可視化することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を利用した腐朽木材中に存在する真菌類の菌叢解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 久住朝子, 半智史, 片山葉子, 船田良, 福田清春, 吉田誠
  • 雑誌名: 木材保存 36巻,3号 ページ: 100-110
  • NAID: 10029100551
  • 査読あり
• [雑誌論文] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を用いた木材腐朽菌の検出法の最適化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 吉田誠, 船田良, 福田清春
  • 雑誌名: 木材保存協会第26回年次大会論文集 ページ: 46-47
• [雑誌論文] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を利用した腐朽木材中に存在する真菌類の菌叢解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 久住朝子, 半智史, 片山葉子, 船田良, 福田清春, 吉田誠
  • 雑誌名: 木材保存 巻: 36巻 ページ: 100-110
  • NAID: 10029100551
  • 査読あり
• [雑誌論文] 変性濃度勾配ゲル電気泳動法による木材腐朽菌の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 吉田誠, 福田清春
  • 雑誌名: 日本木材保存協会第25回年次大会論文集 ページ: 48-49
• [雑誌論文] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を利用した腐朽木材中に存在する真菌類の菌叢解析
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 久住朝子, 半智史, 片山葉子, 船田良, 福田清春, 吉田誠
  • 雑誌名: 木材保存 (In press)
  • NAID: 10029100551
  • 査読あり
• [学会発表] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を用いた木材腐朽菌の検出法の最適化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 吉田誠, 船田良, 福田清春
  • 学会等名: 日本木材保存協会第26回年次大会
  • 発表場所: メルパルク東京(東京都)
  • 年月日: 2011-05-25
• [学会発表] サクラの樹幹における真菌類の局在様式の調査 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 永石憲道, 福田清春, 吉田誠
  • 学会等名: 第61回日本木材学会大会
  • 発表場所: 京都大学(京都)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー7に属する酵素遺伝子の腐朽材からの検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 堀友宣, 中田裕治, 福田清春, 吉田誠
  • 学会等名: 第61回日本木材学会大会
  • 発表場所: 京都大学(京都)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法(DGGE法)を用いた腐朽材の菌叢解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 福田清春, 吉田誠
  • 学会等名: 第60回日本木材学会大会
  • 発表場所: 宮崎観光ホテル(宮崎県)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を用いた木材腐朽に関わる糸状菌群の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 久住朝子, 片山葉子, 吉田誠, 福田清春
  • 学会等名: 第9回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • 発表場所: 東京大学(東京都)
  • 年月日: 2009-11-18
• [学会発表] 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法による木材腐朽菌の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田裕治, 吉田誠, 福田清春
  • 学会等名: 日本木材保存協会第25回年次大会
  • 発表場所: メルパルク東京(東京都)
  • 年月日: 2009-05-21
• [備考] ホームページ等