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システム生物学的アプローチによるオーキシン様除草剤の細胞毒性解明

研究課題

研究課題/領域番号 21780305
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関岩手大学

研究代表者

ラーマン アビドゥール (RAHMAN Abidur / RAHMAN ABIDUR)  岩手大学, 農学部, 准教授 (30447114)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2009年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードherbicide / 2,4-D / auxin / actin / apoptosis / transcriptome / Arabidopsis / microarray / シロイヌナズナ / オーキシン / マイクロアレイ / オーキシン様除草剤 / 細胞死 / 根
研究概要

オーキシン様除草剤(2,4-ジクロロフェノキシ酢酸、2,4-D)は、耕作地において雑草を枯死させる目的で広く用いられている。しかし、双子葉類を枯らす分子機構は明らかとなっていない。以前、我々は2,4-Dが細胞骨格を分解し、オーキシンとは独立した新規の経路によってアポトーシスを誘導するという証拠を示した(Rahman et al., 2007 ; Takahashi et al.,投稿準備中)。これらの結果は、2,4-Dの除草効果は一般的に信じられているオーキシン毒性とは異なる細胞に対する毒性と強くリンクしていることを示した。2,4-Dの作用機構と細胞毒性の分子機構をさらに明らかにするため、オミックス、バイオインフォマティクスそして逆遺伝学を含むシステムバイオロジーの手法を用いた。IAAと2,4-D処理時のトランスクリプトーム比較によって2,4-D応答遺伝子セットを同定した。2,4-D特異的応答性遺伝子の遺伝子オントロジーアノテーション解析は細胞骨格とアポトーシスに関連した遺伝子のグループを明らかにし、2,4-Dはアクチン分解とその後のアポトーシスを通して植物を枯らすということを示した。この経路を制御するタンパク質の機能を理解するために逆遺伝学的アプローチを用いた。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (21件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Gravitropism of Arabidopsis thaliana roots requires the polarization of PIN2 toward the root tip in meristematic cortical cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman A, Takahashi M, Shibasaki K, Wu S, Inaba T, Tsurumi S, Baskin TI
    • 雑誌名

      Plant Cell 22

      ページ: 1762-1776

    • NAID

      130006995249

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Shootward and rootward : peak terminology for plant polarity.2010

    • 著者名/発表者名
      Baskin, TI, Peret, B, Balu?ka, F, Benfey, PN, Bennett, M, Forde, BG, Gilroy, S, Helariutta, Y, Hepler, PK, Leyser, O, Masson, PH, Muday, GK, Murphy, AS., Poethig, S, Rahman, A, Roberts, K, Scheres, B, Sharp, RE, Somerville, C.
    • 雑誌名

      Trends in Plant Science 15

      ページ: 593-594

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Gravitropism of Arabidopsis thaliana roots requires polarization of PIN 2 toward the root tip in meristematic cortical cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman A, Takahashi M, Shibasaki K, Wu S, Inaba T, Tsurumi S, Baskin TI
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 22 ページ: 1762-1776

    • NAID

      130006995249

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Shootward and rootward : peak terminology for plant polarity.2010

    • 著者名/発表者名
      Baskin TI, Peret B, Baluska F, Benfey PN, Bennett M, Forde BG, Gilroy S, Helariutta Y, Hepler PK, Leyser O, Masson PH, Muday GK, Murphy AS, Poethig S, Rahman A, Roberts K, Scheres B, Sharp RE, Somerville C
    • 雑誌名

      Trends in Plant Science

      巻: 15 ページ: 593-594

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms.2009

    • 著者名/発表者名
      Shibasaki K, Uemura M, Tsurumi S, Rahman A
    • 雑誌名

      Plant Cell 21

      ページ: 3823-3838

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] PINOID kinase regulates root gravitropism through modulation of PIN2-dependent basipetal auxin transport in Arabidopsis thaliana.2009

    • 著者名/発表者名
      Sukumar P. Edwards KS, Rahman A, DeLong A, Muday GK
    • 雑誌名

      Plant Physiol 150

      ページ: 722-735

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms2009

    • 著者名/発表者名
      Shibasaki K, Uemura M, Tsurumi S, Rahman A
    • 雑誌名

      Plant Cell 21

      ページ: 3823-3838

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PINOID kinase regulates root gravitropism through modulation of PIN2-dependent basipetal transport in Arabidopsis thaliana2009

    • 著者名/発表者名
      Sukumar, P., Edwars, K.S., Rahman, A., Mattox, C., Delong, A., Muday, G.K.
    • 雑誌名

      Plant Physiology 150

      ページ: 722-735

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Indole-3-acetic acid and 2,4-dichlorophenoxyacetic acid : a tale of two auxins.2011

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Invited speaker for "Special Biology Seminar" Biology Department
    • 発表場所
      University of Massachusetts, Amherst, MA, U.S.A
    • 年月日
      2011-02-28
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Indole-3-acetic acid and 2,4-Dichlorophenoxyacetic acid : a tale of two auxins2011

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      University of Massachusetts, Amherst, "Special Biology Seminar"
    • 発表場所
      Amherst, MA, USA(招待講演)
    • 年月日
      2011-02-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Auxin response in Arabidopsis under cold stress : underlying mechanisms2011

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Invited speaker for "Biology Seminar" Biology Department
    • 発表場所
      Howard University, Washington D.C.-U.S.A
    • 年月日
      2011-02-23
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Auxin response in Arabidopsis under cold stress : underlying mechanisms2011

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Howard University, "Biology Seminar"
    • 発表場所
      Washington DC, USA(招待講演)
    • 年月日
      2011-02-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Actin-auxin interaction in regulating root growth and development- Invited speaker for "Special Biology Seminar" Wake Forest University2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 発表場所
      Winston-Salem, N.C., U.S.A
    • 年月日
      2010-08-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Noble Foundation, "Plant Biology 2010 Spring Seminar Series"
    • 発表場所
      Ardmore, OK, USA
    • 年月日
      2010-02-11
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms.2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman A, Takahashi M, Shibasaki K, Wu S, Inaba T, Tsurumi S, Baskin TI
    • 学会等名
      Abstract No.03008-21st International conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Yokohama, Japan.
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] SMAP1 acts as a positive regulator for 2,4-dichlorophenoxyacetic acid mediated actin degradation and acts independent of known signaling pathway.2010

    • 著者名/発表者名
      Takahashi M, Oono Y, Rahman A
    • 学会等名
      Abstract No.12045-21st International conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Yokohama, Japan.
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Role of Indole-3-butyric acid in Arabidopsis root growth.2010

    • 著者名/発表者名
      Kawamura K, Rahman A
    • 学会等名
      Abstract No. P1B042; 51st Annual meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists
    • 発表場所
      Kumamoto, Japan
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms2010

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A., Takahashi, M., Shibasaki, K., Wu, S., Inab, T., Tsurumi, S., Baskin, T.I.
    • 学会等名
      21st International conference on Arabidopsis Research, Yokohama, Japan.
    • 発表場所
      Yokohama, Japan(招待講演)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] SMAP1 acts as a positive regulator for 2,4-dichlorophenoxyacetic acid mediated actin degradation and acts independent of known signaling pathway2010

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, M., Oono, Y., Rahman, A
    • 学会等名
      21st International conference on Arabidopsis Research, Yokohama, Japan.
    • 発表場所
      Yokohama, Japan(招待講演)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanism-Plant Science Centre Seminar2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman A.
    • 学会等名
      RIKEN
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2009-11-09
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      RIKEN, "Plant Science Center Seminar Series"
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2009-11-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Science and the life of a plant biologist.2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman A.
    • 学会等名
      Invited Guest Professor Lecture.
    • 発表場所
      Kobe University, Kobe, Japan
    • 年月日
      2009-06-24
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Science and the life of a plant biologist2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Kobe University, "Guest Professor Lecture Series"
    • 発表場所
      Kobe, Japan
    • 年月日
      2009-04-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Transcytosis of PIN2 in Arabidopsis is regulated by protein phosphatase2A and PID Kinase.2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman A.
    • 学会等名
      Invited speaker for "auxin minisymposium" in Plant Biology 2009
    • 発表場所
      held at Hawaii, U.S.A.
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Transcytosis of PIN2 in Arabidopsis is regulated by protein phosphatase 2A and PID kinase.2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman A, Takahashi M, Shibasaki K, Shuang W, Baskin TI
    • 学会等名
      Abstract No. P53005; Plant Biology 2009
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanism.2009

    • 著者名/発表者名
      Shibasaki K, Uemura M, Tsurumi S, Rahman A
    • 学会等名
      Abstract No.P34002; Plant Biology 2009
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] SMAP is a positive regulator for 2,4-dichlorophenoxyacetic acid mediated actin degradation and acts independent of known auxin signaling pathway.2009

    • 著者名/発表者名
      Takahashi M, Yutaka O, Rahman A
    • 学会等名
      Abstract No. P34039; Plant Biology 2009
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Transcytosis of PIN2 in Arabidopsis is regulated by protein phosphatase 2A and PID Kinase2009

    • 著者名/発表者名
      Rahman, A.
    • 学会等名
      Plant Biology 2009
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Auxin response under cold stress : underlying molecular mechanisms- Invited speaker for Plant Biology 2010 spring seminar series

    • 著者名/発表者名
      Rahman A.
    • 学会等名
      Noble Foundation
    • 発表場所
      Ardmore, Oklahoma, U.S.A-Feb 11, 2010
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~abidur/

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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