天然変性蛋白質PQBP1のセグメントラベルとNMRによる分子認識機構の解明

• 研究課題/領域番号: 21790034
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 物理系薬学
• 研究機関: 富山大学
• 研究代表者: 水口 峰之 富山大学, 大学院・医学薬学研究部(薬学), 教授 (30332662)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 生体分子 / 蛋白質 / 分子認識 / NMR / タンパク質 / 天然変性蛋白質

研究概要

Expressed Protein ligation(EPL)法をPQBP1に適用し、C末端ドメインが15N標識されたセグメントラベル体を作成することに成功した。コールドショックベクターを用いて、2つのPQBP1フラグメントを大腸菌で高発現させ、これらをEPL法によって連結した。本研究の成果は、他の天然変性蛋白質のセグメントラベルに適用できると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Hydrogen-bondnetwork and pH sensitivity in transthyretin : neutron crystal structure of humantransthyretin (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, T., Mizuguchi, M., Nabeshima, Y., Kusaka, K., Yamada, T., Hosoya, T., Ohhara, T., Kurihara, K., Tomoyori, K., Tanaka, I. and Niimura. N.
  • 雑誌名: J Struct Biol 巻: 177 ページ: 283-290
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydrogen-bond network and pH sensitivity in transthyretin: neutron crystal structure of human transthyretin (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, T., et al.
  • 雑誌名: Journal of Structural Biology 巻: 177 ページ: 283-290
  • 査読あり
• [雑誌論文] 天然変性タンパク質PQBP-1の揺らぎと生体機能.メディカルバイオ (2010)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之, 岡澤均
  • 雑誌名: 10月号別冊「揺らぎと生体機能」 ページ: 44-48
• [雑誌論文] Polyglutamine tract-bindingprotein-1 binds to U5-15kD via a continuous23-residue segment of the C-terminaldomain (2010)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., Mizuguchi, M., Shinoda, H., Aizawa, T., Demura, M., Okazawa H. andKawano, K
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta 巻: 1804 ページ: 1500-1507
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyglutamine tract-binding protein-1 binds to U5-15kD via a continuous 23-residue segment of the C-terminal domain. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., et al.
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics 巻: 1804 ページ: 1500-1507
  • 査読あり
• [雑誌論文] 天然変性タンパク質PQBP-1の揺らぎと生体機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之, 岡澤均
  • 雑誌名: メディカルバイオ 巻: 10月号別冊 ページ: 44-48
• [雑誌論文] A novelβ-defensin structure : big defensin changes its N-terminal structureto associate with the target membrane (2009)
  • 著者名/発表者名: Kouno, T., Mizuguchi, M., Aizawa, T., Shinoda, H., Demura, M., Kawabata, S. andKawano, K
  • 雑誌名: Biochemistry 48 ページ: 7629-7635
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyglutamine tract bindingprotein-1 is an intrinsically unstructuredprotein (2009)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., Mizuguchi, M., Shinoda, H., Aizawa, T., Demura, M., Okazawa, H. andKawano, K
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta 巻: 1794 ページ: 936-943
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyglutamine tract binding protein-1 in an intrinsically unstructured protein. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., et al.
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics 1794 ページ: 936-943
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel β-defensin structure : big defensin changes its N-terminal structure to associate with the target membrane. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kouno, T., et al.
  • 雑誌名: Biochemistry 48 ページ: 7629-7635
  • 査読あり
• [学会発表] ポリグルタミン結合タンパク質の構造生物学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] ポリグルタミン結合タンパク質の構造生物学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 北海道大学(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] Structural changes of theintrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M
  • 学会等名: 9thJapan-Korea Bilateral Symposium onBiological NMR
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] Structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi M.
  • 学会等名: 9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Hokkaido University(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] Dynamic structural changesof the intrinsically disordered proteinPQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M
  • 学会等名: 4th Japan-Korea Seminar onBiomolecular Sciences, Experiments andSimulations
  • 発表場所: Nara
  • 年月日: 2012-01-11
• [学会発表] Dynamic structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi M.
  • 学会等名: 4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences, Experiments and Simulations
  • 発表場所: Cultural Center of Todaiji-Temple(招待講演)
  • 年月日: 2012-01-11
• [学会発表] 精神遅滞の原因タンパク質PQBP-1の構造と機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 第21回WSフォーラムタンパク質・ペプチド研究の現状と展望
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-11-19
• [学会発表] 精神遅滞の原因タンパク質PQBP-1の構造と機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 第21回WSフォーラムタンパク質・ペプチド研究の現状と展望
  • 発表場所: 九州大学(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-19
• [学会発表] 天然変性蛋白質PQBP-1の動的な構造変化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] 天然変性蛋白質PQBP-1の動的な構造変化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] Fluctuation and function ofpolyglutamine tract binding protein-1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M., Takahashi, M., Okazawa, H. and Kawano, K
  • 学会等名: The3rd International Symposium on MolecularScience of Fluctuations toward BiologicalFunctions
  • 発表場所: Nagoya
  • 年月日: 2009-12-21
• [学会発表] Fluctuation and function of polyglutamine tract binding protein-1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M., Takahashi, M., Okazawa, H., Kawano, K.
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: Nagoya University
  • 年月日: 2009-12-21
• [備考]
  • URL: http://www.pha.u-toyama.ac.jp/phypha2/index-j.html