消化器癌細胞および癌幹細胞の網羅的エピゲノム解析

• 研究課題/領域番号: 21790675
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 札幌医科大学
• 研究代表者: 鈴木 拓 札幌医科大学, 医学部, 助教 (20381254)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2009年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 消化器癌 / メチル化 / エピゲノム / 癌幹細胞

研究概要

消化器癌細胞および消化器癌幹細胞に特徴的なエピゲノムパターンを明らかにするため、マイクロアレイおよび次世代シークエンサーを用いて大腸癌細胞における遺伝子発現、miRNA発現およびヒストンメチル化をゲノムワイドに解析した。また、内視鏡切除された大腸癌臨床検体のDNAメチル化およびピストン修飾解析を行った。得られたエピゲノムデータを解析することで、大腸癌においてエピジェネティックに不活化したmicroRNA遺伝子を複数同定した。今回の研究から大腸癌における大規模エピゲノムデータが得られ、それらの情報を癌関連遺伝子やmiRNAの同定に応用できることが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Role of DNA Methylation in the Development of Diffuse-Type Gastric Cancer. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto E, Suzuki H, Takamaru H, Yamamoto H, Toyota M, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Digestion 83 ページ: 241-249
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic inactivation of calcium-sensing receptor in colorectal carcinogenesis. (2011)
  • 著者名/発表者名: K, Yamamoto H, Taniguchi H, Adachi Y, Nakazawa M, Tanuma T, Kato N, Sukawa Y, Sanchez JV, Suzuki H, Sasaki S, Imai K, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Mod Pathol
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Novel Correlation between LINE-1 Hypomethylation and the Malignancy of Gastrointestinal Stromal Tumors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Igarashi S, Suzuki H, Niinuma T, Shimizu H, Nojima M, Iwaki H, Nobuoka T, Nishida T, Miyazaki Y, Takamaru H, Yamamoto E, Yamamoto H, Tokino T, Hasegawa T, Hirata K, Imai K, Toyota M, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 16 ページ: 5114-5123
  • NAID: 130004927691
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylation-associated silencing of microRNA-34b/c in gastric cancer and its involvement in an epigenetic field defect. (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, Yamamoto E, Nojima M, Kai M, Yamano HO, Yoshikawa K, Kimura T, Kudo T, Harada E, Sugai T, Takamaru H, Niinuma T, Maruyama R, Yamamoto H, Tokino T, Imai K, Toyota M, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 31 ページ: 2066-2073
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methylation of interferon regulatory factors in gastric cancer and noncancerous gastric mucosae. (2010)
  • 著者名/発表者名: Awe Yamashita M, Toyota M, Suzuki H, Nojima M, Yamamoto E, Kamimae S, Watanabe Y, Kai M, Akashi H, Maruyama R, Sasaki Y, Yamano H, Sugai T, Shinomura Y, Imai K, Tokino T, Itoh F.
  • 雑誌名: Cancer Sci 101 ページ: 1708-1716
  • NAID: 10026594987
  • 査読あり
• [雑誌論文] Array-based genomic resequencing of human leukemia. (2010)
  • 著者名/発表者名: Awe Yamashita Y, Yuan J, Suetake I, Suzuki H, Ishikawa Y, Choi YL, Ueno T, Soda M, Hamada T, Haruta H, Takada S, Miyazaki Y, Kiyoi H, Ito E, Naoe T, Tomonaga M, Toyota M, Tajima S, Iwama A, Mano H.
  • 雑誌名: Oncogene 29 ページ: 3723-3731
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic dissection of differential signaling threshold requirements for the Wnt/beta-catenin pathway in vivo. (2010)
  • 著者名/発表者名: MBuchert M, Athineos D, Abud HE, Burke ZD, Faux MC, Samuel MS, Jarnicki AG, Winbanks CE, Newton IP, Meniel VS, Suzuki H, Stacker SA, Nathke IS, Tosh D, Huelsken J, Clarke AR, Heath JK, Sansom OJ, Ernst M.
  • 雑誌名: PLoS Genet 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] IGFBP7 is a p53 Responsive Gene Specifically Silenced in Colorectal Cancer with CpG Island Methylator Phenotype. (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, Igarashi S, Nojima M, Maruyama R, Yamamoto E, Kai M, Akashi H, Watanabe Y, Yamamoto H, Sasaki Y, Itoh F, Imai K, Sugai T, Shen L, Issa JP, Shinomura Y, Tokino T, Toyota M.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 31 ページ: 342-349
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic screening for genes upregulated by demethylation revealed novel targets of epigenetic silencing in breast cancer. (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujikane T, Nishikawa N, Toyota M, Suzuki H, Nojima M, Maruyama R, Ashida M, Ohe-Toyota M, Kai M, Nishidate T, Sasaki Y, Ohmura T, Hirata K, Tokino T.
  • 雑誌名: Breast Cancer Res Treat 122 ページ: 699-710
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular analysis of single isolated glands in gastric cancers and their surrounding gastric intestinal metaplastic mucosa. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sugai T, Habano W, Jiao YF, Toyota M, Suzuki H, Tsukahara M, Koizuka H, Akasaka R, Koeda K, Wakabayashi G, Suzuki K.
  • 雑誌名: Oncol Rep 23 ページ: 25-33
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylation-associated silencing of microRNA-34b/c in gastric cancer and its involvement in an epigenetic field defect. (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H., et al.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 31 ページ: 2066-2073
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Novel Correlation between LINE-1 Hypomethylation and the Malignancy of Gastrointestinal Stromal Tumors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Igarashi S., Suzuki H., et al.
  • 雑誌名: Clinical Cancer Research 巻: 16 ページ: 5114-5123
  • NAID: 130004927691
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic dissection of differential signaling threshold requirements for the Wnt/beta-catenin pathway in vivo. (2010)
  • 著者名/発表者名: Buchert M., et al.
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic Profiles Distinguish Malignant Pleural Mesothelioma from Lung Adenocarcinoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Goto Y, Shinjo K, Kondo Y, Shen L, Toyota M, Suzuki H, Gao W, An B, Fujii M, Murakami H, Osada H, Taniguchi T, Usami N, Kondo M, Hasegawa Y, Shimokata K, Matsuo K, Hida T, Fujimoto N, Kishimoto T, Issa JP, Sekido Y.
  • 雑誌名: Cancer Res 69 ページ: 9073-9082
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic screening for genes silenced by DNA methylation revealed an association between RASD1 inactivation and dexamethasone resistance in multiple myeloma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Nojima M, Maruyama R, Yasui H, Suzuki H, Maruyama Y, Tarasawa I, Sasaki Y, Asaoku H, Sakai H, Hayashi T, Mori M, Imai K, Tokino T, Ishida T, Toyota M, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 15 ページ: 4356-4364
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel method, digital genome scanning detects KRAS gene amplification in gastric cancers : involvement of overexpressed wild-type KRAS in downstream signaling and cancer cell growth. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mita H, Toyota M, Aoki F, Akashi H, Maruyama R, Sasaki Y, Suzuki H, Idogawa M, Kashima L, Yanagihara K, Fujita M, Hosokawa M, Kusano M, Sabau SV, Tatsumi H, Imai K, Shinomura Y, Tokino T.
  • 雑誌名: BMC Cancer 9 ページ: 198-198
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elevated Dnmt3a activity promotes polyposis in Apc Min mice by relaxing extracellular restraints on Wnt signaling. (2009)
  • 著者名/発表者名: Samuel MS, Suzuki H, Buchert M, Putoczki TL, Tebbutt NC, Lundgren-May T, Christou A, Inglese M, Toyota M, Heath JK, Ward RL, Waring PM, Ernst M.
  • 雑誌名: Gastroenterology 137 ページ: 902-913
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Single Recombinant Adenovirus Expressing p53 and p21-targeting Artificial microRNAs Efficiently Induces Apoptosis in Human Cancer Cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: Idogawa M, Sasaki Y, Suzuki H, Mita H, Imai K, Shinomura Y, Tokino T.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 15 ページ: 3725-3732
  • 査読あり
• [雑誌論文] CHFR, a potential tumor suppressor, downregulates interleukin-8 through the inhibition of NF-kappaB. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kashima L, Toyota M, Mita H, Suzuki H, Idogawa M, Ogi K, Sasaki Y, Tokino T.
  • 雑誌名: Oncogene 28 ページ: 2643-2653
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic dysregulation of secreted Frizzled-related proteins in multiple myeloma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Jost E, Gezer D, Wilop S, Suzuki H, Herman JG, Osieka R, Galm O.
  • 雑誌名: Cancer Lett 281 ページ: 24-31
  • 査読あり
• [雑誌論文] IGFBP7 is a p53-responsive gene specifically silenced in colorectal cancer with CpG island methylator phenotype. (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, et al.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 31 ページ: 342-349
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elevated Dnmt3a activity promotes polyposis in Apc(Min) mice by relaxing extracellular restraints on Wnt signaling. (2009)
  • 著者名/発表者名: Samuel MS, et al.
  • 雑誌名: Gastroenterology 137 ページ: 902-913
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic profiles distinguish malignant pleural mesothelioma from lung adenocarcinoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Goto Y, et al.
  • 雑誌名: Cancer Research 69 ページ: 9073-9082
  • 査読あり
• [学会発表] 大腸癌においてエピジェネティックに不活化したmicroRNAの網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会
  • 発表場所: 米子市
  • 年月日: 2010-05-28
• [学会発表] 消化管問質腫瘍におけるHNE-1低メチル化と悪性度との相関 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山本英一郎, 鈴木拓, 新沼猛, 五十嵐伸一, 山本博幸, 豊田実, 篠村恭久
  • 学会等名: 第21回日本消化器癌発生学会総会
  • 発表場所: 軽井沢
• [学会発表] GISTにおけるエピジェネティックな異常とその臨床的意義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓, 新沼猛, 篠村恭久
  • 学会等名: 第18回日本消化器病関連学会週間
• [学会発表] CIMP大腸癌の起源 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山本英一郎, 鈴木拓, 山野泰穂, 神前正幸, 甲斐正広, 菅井有, 時野隆至, 今井浩三, 篠村恭久, 豊田実
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた遺伝子転写開始点予測とエピゲノム解析への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 泰史, 篠村恭久, 時野隆至, 今井浩三
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 大腸がん・胃がん細胞におけるDGKGのエピジェネティック制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 甲斐正広, 鈴木拓, 山本英一郎, 今井浩三, 豊田実
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 胃癌におけるmicroRNA34b/cのエピジェネティックな不活化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓, 山本英一郎, 高丸博之, 五十嵐伸一, 野島正寛, 山本博幸, 豊田実, 今井浩三, 篠村恭久
  • 学会等名: 第6回日本消化管学会学術集会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 大腸癌においてエピジェネティックに不活性したmicroRNAの網羅的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓
  • 学会等名: 第68回日本癌学会総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-10-01
• [学会発表] 多発胃癌背景胃粘膜における異常メチル化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本英一郎, 豊田実, 鈴木拓, 山本博幸, 山野泰穂, 菅井有, 今井浩三, 篠村恭久
  • 学会等名: 第20回日本消化器癌発生学会総会
  • 発表場所: 広島
• [学会発表] 大腸癌におけるIGFBP7のメチル化とCIMPとの相関 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓, 五十嵐伸一, 高丸博之, 新沼猛, 山本英一郎, 野島正寛, 山本博幸, 豊田実, 今井浩三, 篠村恭久
  • 学会等名: 第20回日本消化器癌発生学会総会
  • 発表場所: 広島
• [学会発表] 大腸癌においてエピジェネティックに不活化したmicroRNAの網羅的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓, 五十嵐伸一, 高丸博之, 新沼猛, 山本博幸, 時野隆至, 今井浩三, 豊田実, 篠村恭久
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 大腸発癌におけるDNAメチル化の役割 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本英一郎, 山野泰穂, 鈴木拓, 野島正寛, 丸山玲緒, 時野隆至, 今井浩三, 篠村恭久, 豊田実
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
• [図書] バイサルファイトPCR法.(改訂第5版新遺伝子工学ハンドブック)(村松正實, 山本雅, 岡崎康司編) (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓, 豊田実
  • 出版者: 東京 羊土社
• [図書] 改訂第5版 新遺伝子工学ハンドブック,村松正實,山本雅,岡崎康司編 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓
  • 出版者: 羊土社
• [図書] Inflammation and Cancer Methods and Protocols : Volume 2: Molecular Analysis and Pathways (Inflammation-related aberrant patterns of DNA methylation : detection and role in epigenetic deregulation of cancer cell transcriptome.)(Methods in Molecular Biology Edited by Serguei V.Kozlov.) (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, Toyota M, Kondo Y, Shinomura Y.
  • 総ページ数: 512
  • 出版者: Humana Press, New York, USA.