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生化学ネットワークを用いたバイオコンピューティング

研究課題

研究課題/領域番号 21810004
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 ナノ材料・ナノバイオサイエンス
研究機関東京大学

研究代表者

ロンドレーズ ヤニック  東京大学, 生産技術研究所, 特任准教授 (10548770)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
2,756千円 (直接経費: 2,120千円、間接経費: 636千円)
2010年度: 1,313千円 (直接経費: 1,010千円、間接経費: 303千円)
2009年度: 1,443千円 (直接経費: 1,110千円、間接経費: 333千円)
キーワードDNAコンピュータ / DNA増幅反応 / 生化学ネットワーク
研究概要

生きている有機体は化学反応連鎖が作り出す高度なネットワークにより、複雑な挙動を発揮する。この生体内化学反応システムの概念はまさに生物学の核心であるが、非生物として人工的にこのような構造を作り出すことは極めて難しい。ここではそのよう生化学反応システムを任意に構成できるような最小ユニットを作製するために分子生物学の生体外化学反応の標準的な手法を用いて効率的な化学反応振動子を組み立てた。化学反応振動子に対応するネットワークをもつように、20個程度の塩基からなるDNA鋳型をエンコードし、そしてDNA合成量の発振現象を得た。この結果は、簡便なモジュールの連鎖反応を用いることで、人工的に生体の複雑な挙動を論理的かつ予測可能な形で再現できる可能性があること示している。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Programming an in vitro DNA oscillator using a molecular networking strategy2011

    • 著者名/発表者名
      K.Montagne, R.Plasson, Y.Sakai, T.Fujii, Y.Rondelez
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology Vol.7

      ページ: 466-466

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Programming an in vitro DNA oscillator using a molecular networking strategy2011

    • 著者名/発表者名
      K.Montagne, R.Plasson, Y.Sakai, T.Fujii, Y.Rondelez.
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology

      巻: 7 ページ: 466-466

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Microchamber array for cell-free protein synthesis from single DNA molecules2010

    • 著者名/発表者名
      S.H.Kim, Y.Rondelez, S.Takeuchi, S.Yoshizawa, D.Fourmy, T.Fujii
    • 学会等名
      The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2010)
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Electro-active microwell array for trapping and lysing single2009

    • 著者名/発表者名
      S.H.Kim, T.Yamamoto, Y.Rondelez, D.Fourmy, T.Fujii
    • 学会等名
      13th International Conference on Miniaturized Chemical and Biochemical Analysis Systems (MicroTAS2009)
    • 発表場所
      済州,韓国
    • 年月日
      2009-11-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Electro-active microwell array for trapping and lysing single2009

    • 著者名/発表者名
      S.H.Kim, T.Yamamoto, Y.Rondelez, D.Fourmy, T.Fujii
    • 学会等名
      13th International Conference on Miniaturized Chemical and Biochemical Analysis Systems(MicroTAS2009)
    • 発表場所
      済州, 韓国
    • 年月日
      2009-11-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://limmshp.iis.u-tokyo.ac.jp/mediawiki/index.php/Yannick_RONDELEZ,_Dr.

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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