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Protein-RNA conjugateによる細胞内代謝産物のイメージング

研究課題

研究課題/領域番号 21850026
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関甲南大学

研究代表者

遠藤 玉樹  甲南大学, 先端生命工学研究所, 講師 (90550236)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
2,704千円 (直接経費: 2,080千円、間接経費: 624千円)
2010年度: 1,287千円 (直接経費: 990千円、間接経費: 297千円)
2009年度: 1,417千円 (直接経費: 1,090千円、間接経費: 327千円)
キーワード代謝産物検 / 細胞内イメージング / RNA-タンパク質相互作用 / アロステリック相互作用 / RNA構造変化 / 代謝産物検出 / RNAセレクション / リボスイッチ / 代謝産物の検出
研究概要

代謝産物などの低分子化合物を細胞内で検出するために、ウイルス由来のTatとTAR-RNAとの相互作用をアロステリックに調整することによる検出系の構築を試みた。RNAアプタマーとTAR-RNAとを組み合わせた人工のRNAライブラリーを設計し、標的分子の存在下でTatと結合する改変型TAR-RNAをセレクションにより獲得した。獲得したRNAは、Tatを挿入したルシフェラーゼと協働させることにより、発光シグナルによる標的分子の検出を可能とした。また、RNAアプタマー直結型のTAR-RNAを用いて、遺伝子発現量変化より標的分子を検出することにも成功した。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (14件)

  • [雑誌論文] Gene Regulation System with an Artificial RNA Switch Operating in Human Cells2011

    • 著者名/発表者名
      Endoh T., Sugimoto N.
    • 雑誌名

      Chembiochem 12

      ページ: 1174-1178

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 話題「遺伝子制御を可能にするRNAの構造スイッチ」2011

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹、杉本直己
    • 雑誌名

      ファルマシア 47

      ページ: 146-150

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Direct detection of RNAs in living cells using peptide-inserted Renilla luciferase2011

    • 著者名/発表者名
      Andou T., Endoh T., Mie M., Kobatake E.
    • 雑誌名

      Analyst 136

      ページ: 2446-2449

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of an RNA detection system using bioluminescence resonance energy transfer2011

    • 著者名/発表者名
      Andou T., Endoh T., Mie M., Kobatake E.
    • 雑誌名

      Sensor Actuat.B Chem. 152

      ページ: 277-284

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of an RNA detection system using bioluminescence resonance energy transfer2011

    • 著者名/発表者名
      Andou T, Endoh T, Mie M, Kobatake E.
    • 雑誌名

      Sensor Actuat.B Chem.

      巻: 152 ページ: 277-284

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 話題「遺伝子制御を可能にするRNAの構造スイッチ」2011

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹、杉本直己
    • 雑誌名

      ファルマシア

      巻: 47 ページ: 146-150

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Cellular siRNA delivery using TatU1A and photo-induced RNA interference.2010

    • 著者名/発表者名
      Endoh T, Ohtsuki T.
    • 雑誌名

      Methods Mol.Biol.

      巻: 623 ページ: 271-281

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Evaluation of small ligand-protein interactions by using T7 RNA polymerase with DNA-modified ligand2010

    • 著者名/発表者名
      Mie M, Sugita R, Endoh T, Kobatake E.
    • 雑誌名

      Anal.Biochem.

      巻: 405 ページ: 109-113

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 解説「タンパク質の合成を制御する環境-分子クラウディングによる時間概念-」2010

    • 著者名/発表者名
      杉本直己、遠藤玉樹
    • 雑誌名

      現代化学

      巻: 472 ページ: 26-31

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection of bioactive small molecules by fluorescent resonance energy transfer (FRET) in RNA-protein conjugates2009

    • 著者名/発表者名
      Endoh T., Shintani R., Mie M., Kobatake E., Ohtsuki T., Sisido M.
    • 雑誌名

      Bioconjug.Chem. 20

      ページ: 2242-2246

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial regulation of specific gene expression through photoactivation of RNAi2009

    • 著者名/発表者名
      Tamaki ENDOH
    • 雑誌名

      Journal of Controlled Release 137

      ページ: 241-245

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Carrier PNA for shRNA delivery into cells2009

    • 著者名/発表者名
      Tamaki ENDOH
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medical Chemistry Letters 19

      ページ: 3410-3413

    • NAID

      120003386546

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of bioactive small molecules by fluorescent resonance energy transfer(FRET)in RNA-protein conjugates2009

    • 著者名/発表者名
      Tamaki ENDOH
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry 20

      ページ: 2242-2246

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cellular siRNA delivery using cell-penetrating peptides modified for endosomal escape2009

    • 著者名/発表者名
      Tamaki ENDOH
    • 雑誌名

      Advanced Drug Delivery Review 61

      ページ: 704-709

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞内分子機能スイッチの構築に向けたタンパク質とのアロステリック相互作用を示すRNAのセレクション2011

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2011-03-25
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(25)mRNA構造に及ぼす分子クラウディング環境の影響2011

    • 著者名/発表者名
      村上健太郎・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(26)mRNAの高次構造が影響する翻訳伸長反応の解析手法の構築2011

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(27)細胞内分子機能スイッチの構築に向けたタンパク質とのアロステリック相互作用を示すRNAのセレクション2011

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Control of gene expression through an allosteric interaction of transactivator protein and its target RNA2010

    • 著者名/発表者名
      Endoh T., Sugimoto N.
    • 学会等名
      The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2010-11-10
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 分子クラウディング環境におけるリボスイッチRNAの高次構造安定化に対する熱力学的定量評価2010

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・村上健太郎・杉本直己
    • 学会等名
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] タンパク質-RNA間相互作用を活用したヒト細胞内で機能する人工リボスイッチシステムの構築2010

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] mRNAの熱安定性が及ぼす翻訳反応への影響2010

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・村上健太郎・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Control of gene expression through an allosteric interaction of transactivator prote in and its target RNA2010

    • 著者名/発表者名
      T.Endah, N.Sugimoto
    • 学会等名
      The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • 発表場所
      Yokohama
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Stabilization of the adenine-specific riboswitch in its ligand binding under molecular crowding condition2010

    • 著者名/発表者名
      K.Murakami, T.Endoh, N.Sugimoto
    • 学会等名
      The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • 発表場所
      Yokohama
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(16)タンパク質-RNA間相互作用を活用したヒト細胞内で機能する人工リボスイッチシステムの構築2010

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(15)アデニンリボスイッチのリガンド結合に及ぼす分子クラウディング環境の影響2010

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] RNA配列改変によるRNA-protein conjugateバイオセンサーの効率化2009

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・村上健太郎・新谷諒・小畠英理・大槻高史・宍戸昌彦・杉本直己
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-09-14
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] RNA配列改変によるRNA-protein conjugateバイオセンサーの効率化2009

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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