バイオインフォマティクスの手法を用いたクロロフィル代謝経路の確立

• 研究課題/領域番号: 21870003
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 高林 厚史 北海道大学, 低温科学研究所, 助教 (90546417)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 2,639千円 (直接経費: 2,030千円、間接経費: 609千円); 2010年度: 1,469千円 (直接経費: 1,130千円、間接経費: 339千円); 2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: クロロフィル代謝 / バイオインフォマティクス / シロイヌナズナ

研究概要

公開マイクロアレイデータを用いた共発現解析と系統プロファイル解析を組み合わせた解析により、7-hydroxymethyl chlorophyll a reductaseの候補遺伝子を選抜し、その後の変異株解析により有力な候補を得た。また、BN-PAGE を用いてクロロフィル代謝系の酵素群がタンパク質複合体を形成しているかどうかを網羅的に解析し、新たな知見を得た。

研究成果

• [雑誌論文] LIL3, a light-harvesting-like protein, plays an essential role in chlorophyll and tocopherol biosynthesis. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryoichi Tanaka, Maxi Rothbart, Seiko Oka, Atsushi Takabayashi, Kaori Takahashi, Masaru Shibata, Fumiyoshi Myouga, Reiko Motohashi, Kazuo Shinozaki, Bernhard Grimm, Ayumi Tanaka
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.U S A. 107 ページ: 16721-16725
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノム世代のタンパク質複合体解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史
  • 雑誌名: 光合成研究 20 ページ: 60-64
  • NAID: 40017325906
  • 査読あり
• [雑誌論文] Three PsbQ-like proteins are required for the function of the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase complex in Arabidopsis. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shinya Yabuta, Kentaro Ifuku, Atsushi Takabayashi, Seiko Ishihara, Kunio Ido, Noriko Ishikawa, Tsuyoshi Endo, Fumihiko Sato
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 51 ページ: 866-876
  • NAID: 10027349591
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct interaction between KaiA and KaiB revealed by a site-directed spin labeling electron spin resonance analysis. (2010)
  • 著者名/発表者名: Risa Mutoh, Hiroyuki Mino, Reiko Murakami, Tatsuya Uzumaki, Atsushi Takabayashi, Kentaro Ishii, Masahiro Ishiura
  • 雑誌名: Genes to Cells. 15 ページ: 269-280
  • 査読あり
• [学会発表] The application of BN-PAGE for comprehensive detection of the protein complexes in the chloroplast. (2011)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 東北大学(仙台市)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] クロロフィルb蓄積変異株における チラコイド膜タンパク質の網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本市)
  • 年月日: 2010-03-20
• [学会発表] クロロフィルb蓄積変異株における チラコイド膜タンパク質の網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本市)
  • 年月日: 2010-03-20
• [学会発表] バイオインフォマティクスを利用した光合成研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史
  • 学会等名: 第12回植物オルガネラワークショップ
  • 発表場所: 熊本市民会館(熊本市)
  • 年月日: 2010-03-17
• [備考]
  • URL: http://www.lowtem.hokudai.ac.jp/Plantadapt/ayumi/
• [備考]
  • URL: http://www.lowtem.hokudai.ac.jp/plantadapt/ayumi/