3次元構造を基にした、生理活性小分子化合物のデザイン

• 研究課題/領域番号: 21870016
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 佐藤 慎一 京都大学, 物質ー細胞統合システム拠点, 助教 (70534478)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 2,704千円 (直接経費: 2,080千円、間接経費: 624千円); 2010年度: 1,287千円 (直接経費: 990千円、間接経費: 297千円); 2009年度: 1,417千円 (直接経費: 1,090千円、間接経費: 327千円)
• キーワード: X線結晶解析 / 標的タンパク質同定 / 生理活性化合物 / 分子設計 / 分子認識

研究概要

本研究では、生理活性物質レンチノロールとその標的タンパク質複合体の構造を解析し、その構造情報を基にレンチノロールを分子設計し、標的タンパク質への特異性の向上を目指した。
:成果:
1.リコンビナントS-100A11、S-100A13およびS-100A16を大量発現・精製を行った。
2.レンチノロールを合成により、大量調整した。
3.調整したS100タンパク質とレンチノロールは完全なS100タンパク質-wrenchnolol複合体を形成させるために、モル比でwrenchnolol過剰となるように混ぜることで複合体形成を行い、最濃度2mMのS100タンパク質-wrenchnolol複合体を得た。
4.得られたS100A11-wrenchonolol複合体溶液は、共結晶作成条件をキットによりそれぞれ960種の条件をスクリーニングし、数種類の結晶を作成することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Small-molecule fluorescent probes for specific RNA targets Chem. (2011)
  • 著者名/発表者名: Murata, A., Sato, S., Kawazoe, Y., Uesugi M.
  • 雑誌名: Comm. 47(16) ページ: 4712-4714
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marine Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin Chem. (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Orihara, T.,Shirakawa, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
  • 雑誌名: Biol. 18(1) ページ: 131-139
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deactivation of STAT6 through serine 707 phosphorylation by JNK (2011)
  • 著者名/発表者名: Shirakawa, T., Kawazoe, Y., Tsujikawa, T., Jung, D., Sato, S., Uesugi M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 286(5) ページ: 4003-4010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Small-molecule fluorescent probes for specific RNA targets (2011)
  • 著者名/発表者名: Murata, A., Sato, S., Kawazoe, Y., Uesugi M.
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 47 ページ: 4712-4714
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marine Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Orihara, T., Shirakawa, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
  • 雑誌名: Chemistry & Biology 巻: 18 ページ: 131-139
  • NAID: 120002807468
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deactivation of STAT6 through serine 707 phosphorylation by JNK (2011)
  • 著者名/発表者名: Shirakawa, T., Kawazoe, Y., Tsujikawa, T., Jung, D., Sato, S., Uesugi M.
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 286 ページ: 4003-4010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical target isolation for novices : affinity-based strategies Chem. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Shirakawa, T.,Uesugi, M.
  • 雑誌名: Biol. 17(6) ページ: 616-623
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical target isolation for novices : affinity-based strategies (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Shirakawa, T., Uesugi, M.
  • 雑誌名: Chemistry & Biology 巻: 17 ページ: 616-623
  • 査読あり
• [雑誌論文] 化合物推理ゲーム (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Uesugi, M.
  • 雑誌名: ファルマシア 46(1) ページ: 83-86
• [雑誌論文] 海洋天然物のケミカルジェネティクス (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Uesugi, M.
  • 雑誌名: 細胞工学 28(4) ページ: 332-337
• [雑誌論文] 化合物推理ゲーム (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Uesugi, M.
  • 雑誌名: ファルマシア 45(12) ページ: 1263-1266
• [学会発表] Marine Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Orihara, T.,Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
  • 学会等名: The 8th iCeMS International Symposium : “Meso-Control of Functional Architecture"
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2010-11-09
• [学会発表] Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Orihara, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
  • 学会等名: The 8th iCeMS International Symposium
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2010-11-01
• [学会発表] Protein Target Identification of Bioactive Small Molecules. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato S.
  • 学会等名: Department of Chemistry Seminar
  • 発表場所: Athens, Georgia, USA, University of Georgia (招待講演)
  • 年月日: 2010-10-06
• [学会発表] Protein Target Identification of Bioactive Small Molecules. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato, S.
  • 学会等名: University of Georgia, Department of Chemistry Seminar
  • 発表場所: Athens, Georgia, USA
  • 年月日: 2010-10-06
• [学会発表] Small molecule-based FRET probes for specific RNA targets. (2010)
  • 著者名/発表者名: Murata, A., Sato, S., Kawazoe, Y., Uesugi M.
  • 学会等名: The 5th Japan-Korea Chemical Biology Symposium
  • 発表場所: Busan, Korea
  • 年月日: 2010-01-26
• [学会発表] Marine Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, S., Murata, A., Orihara, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
  • 学会等名: The 25th Naito Conference on Chemical Biology [II]
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2009-09-10
• [学会発表] The Marine Natural Product, Aurilide, Activates OPAl-mediated Apoptosis by Targeting Prohibitin (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一
  • 学会等名: 第25回内藤コンファレンス
  • 発表場所: 北海道・札幌
  • 年月日: 2009-09-10
• [図書] 生理活性物質による創薬標的同定のコツ(創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析) 別冊 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一, 村田亜沙子, 白川貴詩, 上杉志成
  • 出版者: 羊土社出版
• [図書] ファルマシア(化合物推理ゲーム) 46(1) (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一, 上杉志成
• [図書] 生理活性物質による創薬標的同定のコツ (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一, 村田亜沙子, 白川貴詩, 上杉志成
  • 総ページ数: 5
  • 出版者: 創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析
• [図書] 細胞工学(海洋天然物のケミカルジェネティクス) 28 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一, 村田亜沙子, 上杉志成
  • 出版者: 学研メディカル秀潤社出版
• [図書] ファルマシア(化合物推理ゲーム) 45(12) (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤慎一,上杉志成