トランス翻訳の分子メカニズムの解明

• 研究課題/領域番号: 21880009
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用生物化学
• 研究機関: 弘前大学
• 研究代表者: 栗田 大輔 弘前大学, 農学生命科学部, 助教 (60552651)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 2,756千円 (直接経費: 2,120千円、間接経費: 636千円); 2010年度: 1,313千円 (直接経費: 1,010千円、間接経費: 303千円); 2009年度: 1,443千円 (直接経費: 1,110千円、間接経費: 333千円)
• キーワード: tmRNA,SmpB,リボソーム / トランス翻訳 / tmRNA / SmpB / トランス・トランスレーション / リボソーム / 分子擬態 / 翻訳

研究概要

トランス翻訳反応の初期段階における反応中間体をin vitroで形成するための系の確立を行った。この系を用いて、トランス翻訳反応の主役であるtmRNA/SmpBの機能を明らかにした。特にSmpBのC末端ドメインに着目し、このドメインがtmRNAのリボソームAサイトへの収容において重要であることを示し、この際に重要な役割を果たすSmpB上の残基を特定した。

研究成果

• [雑誌論文] tRNA/mRNA mimicry by tmRNA and SmpB in trans-translation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 雑誌名: Journal of Nucleic Acids
• [雑誌論文] tRNA/mRNA mimicry by tmRNA and SmpB in trans-translation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 雑誌名: Journal of nucleic acids 巻: 2011
  • 査読あり
• [雑誌論文] Trans-translation by tmRNA and SmpB: a bacterial quality control system of translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Himeno H, Kurita D, Muto, A
  • 雑誌名: Advances in Genetics Research
• [雑誌論文] 2つのtRNA/mRNAハイブリッド-トランス・トランスレーション-mRNAプログラム 多様性と非対称性の獲得戦略(稲田利文、大野睦人編) (2010)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、武藤昇
  • 雑誌名: 共立出版 ページ: 2201-2206
• [雑誌論文] Role of the C-terminal tail of SmpB in the early stage of trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 雑誌名: RNA 巻: 5 ページ: 980-990
• [雑誌論文] Role of the C-terminal tail of SmpB in the early stage of trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H.
  • 雑誌名: RNA 16巻 ページ: 980-990
  • 査読あり
• [雑誌論文] Trans-translation by tmRNA and SmpB (2009)
  • 著者名/発表者名: Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp Ser 巻: 53 ページ: 305-306
• [雑誌論文] 2つのtRNA/mRNAハイブリッド-トランス・トランスレーション-蛋白質核酸酵素 (2009)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、武藤昇
  • 雑誌名: 共立出版 ページ: 2201-2206
• [雑誌論文] Trans-translation by tmRNA and SmpB (2009)
  • 著者名/発表者名: Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symposium Series 53巻 ページ: 305-306
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、武藤〓
  • 雑誌名: 2つのtRNA/mRNAハイブリッド-トランス・トランスレーション-(共立出版) ページ: 2201-2206
• [学会発表] Molecular mechanism of trans-translation mediated by tmRNA/SmpB (2011)
  • 著者名/発表者名: Himeno H, Kurita D, Muto A
  • 学会等名: International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
  • 発表場所: Sapporo, Japan
• [学会発表] Molecular mechanism of the early stages of trans-translation by tmRNA/SmpB (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Hattori Y, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: 16th Annual meeting of the RNA society
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Molecular mechanism of the early stage of trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: 7th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Role of the C-terminal tail of SmpB during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H.
  • 学会等名: 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro(Portugal)
  • 年月日: 2010-02-01
• [学会発表] tRNA/mRNAハイブリッドとtRNA/mRNA擬態タンパク質によるtrans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、宇根理高、武藤昇
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Molecular mechanism of the early stage of trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: 7th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Yokohama, Japan
• [学会発表] Trans-translation by tmRNA/SmpB (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Protein Community
  • 発表場所: Nara, Japan
• [学会発表] 無細胞トランス・トランスレーション系におけるSmpBのC末端tailの働き (2010)
  • 著者名/発表者名: 栗田大輔、武藤昇、姫野俵太
  • 学会等名: 第5回無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] トランス・トランスレーションの初期過程におけるSmpB C末端tailの働き (2010)
  • 著者名/発表者名: 栗田大輔、宇根理高、武藤昇、姫野俵太
  • 学会等名: 第12回RNAミーティング
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] リボソーム成熟因子RsgA/YjeQの構造機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹本千重、Sean R. Connell、長谷要一、直枝智恵子、王宏飛、上西達也、菊池岳志、平田侑也、栗田大輔、武藤昇、武藤裕、横山茂之、Paola Fucini、姫野俵太
  • 学会等名: 第12回RNAミーティング
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Molecular mimicry by tmRNA/SmpB during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: Ribosomes 2010 meeting
  • 発表場所: Orvieto, Italy
• [学会発表] Structural studies for RsgA/YjeQ, a ribosome maturation factor (2010)
  • 著者名/発表者名: Takemoto C, Connell SR, Hase Y, Naoe C, Wang H, Kaminishi T, Kikuchi T, Hirata Y, Kurita D, Muto A, Muto Y, Yokoyama S, Himeno H
  • 学会等名: Ribosomes 2010 meeting
  • 発表場所: Orvieto, Italy
• [学会発表] Molecular mimicry of tRNA/mRNA during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: ASBMB 2010 Annual meeting
  • 発表場所: Anaheim, USA
• [学会発表] Role of the C-terminal tail of SmpB during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro, Portugal
• [学会発表] tRNA/mRNAハイブリッドとtRNA/mRNA擬態タンパク質によるtrans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、宇根理高、武藤〓
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Trans-translation by tmRNA/SmpB (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita, D., Une, M., Muto, A., Himeno, H.
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Protein Community
  • 発表場所: Nara
• [学会発表] トランス・トランスレーション初期過程におけるC末端tailの働き (2010)
  • 著者名/発表者名: 栗田大輔、宇根理高、武藤〓、姫野俵太
  • 学会等名: 第12回RNAミーティング
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Molecular mimicry by tmRNA/SmpB during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita, D., Une, M., Muto, A., Himeno, H.
  • 学会等名: Ribosomes 2010 Meeting
  • 発表場所: Orvieto, Italy
• [学会発表] Structural studies for RsgA/YjeQ, a ribosome maturation factor (2010)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, C., Connell, S.R., Hase, Y., Naoe, C., Wang, H., Kaminishi, T., Kikuchi, T., Hirata, Y., Kurita, D., Muto, A., Muto, Y., Yokoyama, S., Himeno, H.
  • 学会等名: Ribosomes 2010 Meeting
  • 発表場所: Orvieto, Italy
• [学会発表] Molecular mimicry of tRNA/mRNA during trans-translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurita, D., Une, M., Muto, A., Himeno, H.
  • 学会等名: ASBMB 2010 Annual Meeting
  • 発表場所: Anaheim, USA
• [学会発表] Trans-translation by tmRNA and SmpB. (2009)
  • 著者名/発表者名: Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H.
  • 学会等名: 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Takayama Public Cultural Hall(Gifu)
  • 年月日: 2009-09-29
• [学会発表] 部位特異的ヒドロキシラジカルプロービングを用いたRsgAとリボソームの相互作用の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菊地岳志、平田侑也、栗田大輔、長谷要一、木村天胤、武藤〓、姫野俵太
  • 学会等名: 第11回RNAミーティング
  • 発表場所: 新潟コンベンションセンター(新潟県)
  • 年月日: 2009-07-28
• [学会発表] Trans-translation by tmRNA and SmpB (2009)
  • 著者名/発表者名: Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 学会等名: 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Takayama, Gifu, Japan
• [学会発表] 部位特異的ヒドロキシラジカルプロービングを用いたRsgAとリボソームの相互作用の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菊地岳志、平田侑也、栗田大輔、長谷要一、木村天胤、武藤昇、姫野俵太
  • 学会等名: 第11回RNAミーティング
  • 発表場所: 新潟
• [図書] RNA Degradation (2010)
  • 著者名/発表者名: Himeno H, Kurita D, Muto, A
  • 出版者: Nova Science Publishers Inc.(In press)
• [図書] mRNAプログラム多様性と非対称性の獲得戦略 (2010)
  • 著者名/発表者名: 姫野俵太、栗田大輔、武藤〓(稲田利文、大野睦人編)
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: 共立出版
• [図書] Methods in Molecular Biology
  • 著者名/発表者名: Kurita D, Muto A, Himeno H
  • 出版者: In vitro trans-translation assays(In press)