ゲノム網羅的薬理ゲノム研究における研究デザインとそのデータ解析法に関する研究

• 研究課題/領域番号: 21890035
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 佐藤 泰憲 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (90536723)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 2,652千円 (直接経費: 2,040千円、間接経費: 612千円); 2010年度: 1,261千円 (直接経費: 970千円、間接経費: 291千円); 2009年度: 1,391千円 (直接経費: 1,070千円、間接経費: 321千円)
• キーワード: ゲノム / 薬剤反応性 / 統計科学 / 遺伝疫学 / ゲノム網羅的アプローチ / ファーマコゲノミクス / 一塩基多型(SNP) / 生物統計手法 / 母集団薬物動態解析 / 一塩基多型 / 薬物動態解析 / 統計学的アプローチ / 生存時間解析

研究概要

薬剤反応性の個体差の原因となる遺伝子を明らかにすることを目標として,ゲノム綱羅的薬理ゲノム研究における以下の三つの課題を統計学的視点から取り組み,新たな提案を与えた.(1)薬物動態関連遺伝子を同定するための統計手法の開発及び実データへの適用,(2)薬剤反応性遺伝子を同定するための統計手法の開発及び実データへの適用,(3)薬物動態及び遺伝子多型情報を考慮した薬効強度の予測モデルの構築.これらの研究成果は,学術雑誌や国際学会等で発表した.

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide association study detected candidate polvmorphisms associated with overall survival (OS) in advanced non-small cell lung cancer treated with carboplatin and paclitaxel. (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Yamamoto N, Kunitoh H, Ohe Y, Minami H, Laird NM, Katori N, Saito Y, Ohnami S, Sakamoto H, Sawada J, Saijo N, Yoshida T, Tamura T.
  • 雑誌名: J Thorac Oncol. 6 ページ: 132-138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study detected candidate polymorphisms associated with overall survival (OS) in advanced non-small cell lung cancer treated with carboplatin and paclitaxel (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato Y., et al
  • 雑誌名: J Thorac Oncol 巻: 6 ページ: 132-138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detection of inappropriate samples in association studies by an IBS-based method considering linkage disequilibrium between genetic markers. (2010)
  • 著者名/発表者名: Andoh M, Sato Y, Sakamoto H, Yoshida T, Ohtaki M.
  • 雑誌名: J Hum Genet. 53 ページ: 436-440
  • NAID: 10030735869
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bio statistic tools in Pharmacogenomics-advances, challenges, potential. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Laird NM, Yoshida T.
  • 雑誌名: Cur Pharm Design.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic Polymorphisms in Folate and Alcohol metabolism and breast cancer risk : A case-control study in Thai women. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sangrajrang S, Sato Y, Sakamoto H, Ohnami S, Khuhaprema T, Yoshida T.
  • 雑誌名: Breast Cancer Res Treat.
  • 査読あり
• [雑誌論文] 個別化医療のための研究デザインと統計解析法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤泰憲, 長島健悟, 浜田知久馬
  • 雑誌名: 臨床薬理 41 ページ: 291-300
  • NAID: 10027754505
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detection of inappropriate samples in association studies by an IBS-based method considering linkage disequilibrium between genetic markers (2010)
  • 著者名/発表者名: Andoh M, Sato Y, Sakamoto H, Yoshida T, Ohtaki M
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 55 ページ: 436-440
  • NAID: 10030735869
  • 査読あり
• [雑誌論文] 個別化医療のための研究デザインと統計解析法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤泰憲, 長島健悟, 浜田知久馬
  • 雑誌名: 臨床薬理 巻: 41 ページ: 291-300
  • NAID: 10027754505
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biostatistic tools in Pharmacogenomics-advances, challenges, potential. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato Y., et al
  • 雑誌名: Cur Pharm Design (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic Polymorphisms in Folate and Alcohol metabolism and breast cancer risk : A case-control study in Thai women (2010)
  • 著者名/発表者名: Sangrajrang S., et al
  • 雑誌名: Breast Cancer Res Treat (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Statistical screening method for genetic. factors influencing susceptibility to common diseases in a two-stage genome-wide association study. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Laird N, Suganami H. Hamata C, Niki N, Yoshimura I, Yoshida T.
  • 雑誌名: Stat Appl Genet Mol Biol.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Statistical screening method for genetic factors influencing susceptibility to common diseases in a two-stage genome-wide association study (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato Y., et al
  • 雑誌名: Stat Appl Genet Mol Biol 8
  • 査読あり
• [学会発表] Studentized modified maximum contrast method for unequal sample sizes in pharmacogenomics Studies. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nagashima K, Sato Y. Hamada C.
  • 学会等名: International Biometric Society.
  • 発表場所: Florianopolis, Brazil.
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Studentized modified maximum contrast method for unequal sample sizes in pharmacogenomics STUDIES (2010)
  • 著者名/発表者名: Nagashima K, Sato Y, Hamada C.
  • 学会等名: International Biometric Society
  • 発表場所: Florianopolis, Brazil
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Genome-wide association scan detected candidate polymorphisms associated with overall survival (OS) in advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) treated with carboplatin (CBDCA) and paclitaxel (PTX). (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Yamamoto N, Tamura T, Kunitoh H, Ohe Y, Katori N, Sawada J, Sakamoto H, Saijo N, Yoshida T.
  • 学会等名: 第45回米国臨床腫瘍学会
  • 発表場所: 米国・オーランド
• [学会発表] Genome-wide association scan detected candidate polymorphisms associated with overall survival in stage IV pancreatic adenocarcinoma patients receiving gemcitabine monotherapy. (2009)
  • 著者名/発表者名: Uenol H, Okusakal T, Furuse J, Ishii H, Saijo N, Saito Y, Sawada J, Sakamoto H, Yoshida T, Sato Y.
  • 学会等名: 第45回米国臨床腫瘍学会
  • 発表場所: 米国・オーランド
• [学会発表] Genome-wide association scan detected candidate polymorphisms associated with overall survival(OS)in advanced non-small cell lung cancer(NSCLC)treated with carboplatin(CBDCA)and paclitaxel(PTX). (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤泰憲
  • 学会等名: 第45回米国臨床腫瘍学会
  • 発表場所: 米国・オーランド
• [備考]
  • URL: http://cran.r-project.org/web/packages/mmcm/
• [備考]
  • URL: https://gemdbj.nibio.go.jp/dgdb/