フラグメント法によるGPCR‐リガンド化合物の相互作用解析への新規展開

• 研究課題/領域番号: 21890292
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 創薬化学
• 研究機関: 安田女子大学
• 研究代表者: 下堂 靖代 安田女子大学, 薬学部, 助手 (70551175)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 2,314千円 (直接経費: 1,780千円、間接経費: 534千円); 2010年度: 1,014千円 (直接経費: 780千円、間接経費: 234千円); 2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: 医薬分子設計 / 計算科学 / 生体分子 / 蛋白質 / 相互作用解析 / 創薬 / 計算化学 / Gタンパク質共役受容体 / リガンド化合物 / 電子状態計算

研究概要

βアドレナリン受容体-リガンド複合体の活性部位を特定するため,β受容体内のアミノ酸残基とリガンド化合物との相互作用について,フラグメント密度汎関数理論(FDFT)を用いて解析した.β1,β2,β3サブタイプの同位のASPにおいて,作動薬/拮抗薬との非常に強い引力的な相互作用がみられた.同位のSERにおいては,作動薬と引力的な相互作用がみられたのに対し,拮抗薬との相互作用はほとんどみられなかった.さらに,このSER と作動薬の相互作用エネルギーには,EC50 値との対応があった.したがって,β受容体の主な結合部位と作用部位は,それぞれ同位のASPとSERであることが明らかとなった.

研究成果

• [学会発表] フラグメント法によるβアドレナリン受容体-リガンド複合体の相互作用解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下堂靖代
  • 学会等名: 日本化学会 第4回関東支部大会
  • 発表場所: 筑波大学(茨城県)
  • 年月日: 2010-08-30
• [学会発表] フラグメント法によるβアドレナリン受容体-リガンド複合体の相互作用解折 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下堂靖代
  • 学会等名: 日本化学会第4回関東支部大会
  • 発表場所: 筑波大学(茨城県)
  • 年月日: 2010-08-30