• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

単細胞生物の複雑性:有孔虫サブシングルセル遺伝子発現と超微細構造解析で迫る

研究課題

研究課題/領域番号 21H01202
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分17050:地球生命科学関連
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

野牧 秀隆  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 上席研究員 (90435834)

研究分担者 HUSNIK Filip  沖縄科学技術大学院大学, 進化・細胞・共生の生物学ユニット, 准教授 (30886130)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
14,170千円 (直接経費: 10,900千円、間接経費: 3,270千円)
2023年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2022年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2021年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
キーワード単細胞真核生物 / 機能分化 / 真核単細胞生物 / 細胞内機能分化 / 細胞小器官 / 遺伝子発現解析 / シングルセルゲノミクス / 細胞構造
研究開始時の研究の概要

単細胞でありながら細胞の大きい底生有孔虫の多くの種は、細胞質が複数の房室内にまたがって存在し、房室ごとに区切られ細胞間で、細胞小器官の分布に大きな偏りがみられる。これは、有孔虫は単細胞でありながらも房室ごとに細胞質を区切り、細胞機能を分化させ、大きな細胞内の特定の範囲内で効率的な代謝や物質貯蔵をしている可能性を示す。
この仮説を検証するため、房室ごとの細胞小器官の分布を定量的に示し、房室ごとの機能を推定する。さらに、房室ごとのトランスクリプトーム解析を行い、細胞小器官分布から推測される機能分化を遺伝子発現レベルで検証する。

研究成果の概要

単細胞でありながら細胞が最大で10cm以上にもなる底生有孔虫が、細胞を格納する房室ごとに異なる機能を持たせた「疑似的な」多細胞化を行っているのではないかという仮説のもと、超微細構造解析、細胞内元素マッピング、細胞を区分した遺伝子発現解析を行った。細胞の部位ごとに細胞小器官の分布は大きく異なり、エネルギー貯蔵に特化した場所、微生物との共生に特化した場所、餌の消化に特化した場所、など、が見られ、それに伴った元素分布も確認された。これらの場所ごとに発現している遺伝子が異なることも確認され、単細胞生物が細胞内の機能分化を行うことで多様な代謝機能を持ちうることが示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生物の進化は、「単純な単細胞生物が誕生し、それらが共生して真核生物になり、やがて多細胞になり、大型化、複雑化し、現在の動物や植物になった」というストーリーがよく知られている。本研究の成果から、有孔虫などの生物は「単細胞生物が多細胞化することなく独自の異なるメカニズムにより機能分化、大型化したことで、海洋の様々な環境で繁栄している」ことが明らかになり、生物の進化、適応がこれまで以上に複雑かつ謎に満ちたストーリーであることを示している。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (10件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 5件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 12件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 6件)

  • [国際共同研究] ハンブルグ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] マルケ工科大学(イタリア)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] ヘルシンキ大学(フィンランド)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] 国立海洋研究所(英国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] サウサンプトン国立海洋研究所(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ウッズホール海洋学研究所(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ハンブルグ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] サウサンプトン国立海洋研究所(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ウッズホール海洋学研究所(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ハンブルグ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Fungal Abundance and Diversity in the Mariana Trench, the Deepest Ecosystem on Earth2024

    • 著者名/発表者名
      Varrella Stefano、Barone Giulio、Corinaldesi Cinzia、Giorgetti Alessio、Nomaki Hidetaka、Nunoura Takuro、Rastelli Eugenio、Tangherlini Michael、Danovaro Roberto、Dell’Anno Antonio
    • 雑誌名

      Journal of Fungi

      巻: 10 号: 1 ページ: 73-73

    • DOI

      10.3390/jof10010073

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Rapid Freezing and Cryo-SEM?EDS Imaging of Foraminifera (Unicellular Eukaryotes) Using a Conductive Viscous Cryogenic Glue2024

    • 著者名/発表者名
      Okada Satoshi、Richirt Julien、Tame Akihiro、Nomaki Hidetaka
    • 雑誌名

      Microscopy and Microanalysis

      巻: ozae026 号: 2 ページ: 359-367

    • DOI

      10.1093/mam/ozae026

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Composite calcite and opal test in Foraminifera (Rhizaria)2024

    • 著者名/発表者名
      Richirt Julien、Okada Satoshi、Ishitani Yoshiyuki、Uematsu Katsuyuki、Tame Akihiro、Oda Kaya、Isobe Noriyuki、Ishimura Toyoho、Tsuchiya Masashi、Nomaki Hidetaka
    • 雑誌名

      EGUsphere

      巻: 10.5194/egusphere-2024-60

    • DOI

      10.5194/egusphere-2024-60

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A deep-learning automated image recognition method for measuring pore patterns in closely related bolivinids and calibration for quantitative nitrate paleo-reconstructions2023

    • 著者名/発表者名
      Govindankutty Menon Anjaly、Davis Catherine V.、N?rnberg Dirk、Nomaki Hidetaka、Salonen Iines、Schmiedl Gerhard、Glock Nicolaas
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-023-46605-y

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A deep abyssal natural wood fall in the Northwestern Pacific and its associated fauna2023

    • 著者名/発表者名
      Chen Chong、Isobe Noriyuki、Nomaki Hidetaka
    • 雑誌名

      Marine Biology Research

      巻: 19 号: 10 ページ: 556-563

    • DOI

      10.1080/17451000.2023.2291579

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Hydrothermal vent chimney-base sediments as unique habitat for meiobenthos and nanobenthos: Observations on millimeter-scale distributions2023

    • 著者名/発表者名
      Bernhard Joan M.、Nomaki Hidetaka、Shiratori Takashi、Elmendorf Anastasia、Yabuki Akinori、Kimoto Katsunori、Tsuchiya Masashi、Shimanaga Motohiro
    • 雑誌名

      Frontiers in Marine Science

      巻: 9

    • DOI

      10.3389/fmars.2022.1033381

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Bacterivory of the hydrothermal-vent-specific copepod <i>Stygiopontius senokuchiae</i> (Dirivultidae, Siphonostomatoida) from copepodite through adult stages2023

    • 著者名/発表者名
      Nomaki Hidetaka、Kawatani Kento、Motomura Yusuke、Tame Akihiro、Uyeno Daisuke、Ogawa Nanako O.、Ohkouchi Naohiko、Shimanaga Motohiro
    • 雑誌名

      Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom

      巻: 103

    • DOI

      10.1017/s0025315423000139

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Foraminifera and plastic pollution: Knowledge gaps and research opportunities2023

    • 著者名/発表者名
      Bouchet Vincent M.P.、Seuront Laurent、Tsujimoto Akira、Richirt Julien、Frontalini Fabrizio、Tsuchiya Masashi、Matsuba Misako、Nomaki Hidetaka
    • 雑誌名

      Environmental Pollution

      巻: 324 ページ: 121365-121365

    • DOI

      10.1016/j.envpol.2023.121365

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The use of radiocarbon to evaluate the trophic role of geothermal bacteria in shallow hydrothermal water ecosystem2023

    • 著者名/発表者名
      Pascal Pierre-Yves、Nomaki Hidetaka、Miyairi Yosuke、Yokoyama Yusuke
    • 雑誌名

      Ecological Indicators

      巻: 148 ページ: 110108-110108

    • DOI

      10.1016/j.ecolind.2023.110108

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Microplastic particles are phagocytosed in gill cells of deep-sea and coastal mussels2022

    • 著者名/発表者名
      Ikuta Tetsuro、Tame Akihiro、Takahashi Tomoko、Nomaki Hidetaka、Nakajima Ryota
    • 雑誌名

      Frontiers in Marine Science

      巻: 9 ページ: 2132-2132

    • DOI

      10.3389/fmars.2022.1034950

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Deep-sea infauna with calcified exoskeletons imaged in situ using a new 3D acoustic coring system (A-core-2000)2022

    • 著者名/発表者名
      Mizuno Katsunori、Nomaki Hidetaka、Chen Chong、Seike Koji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/s41598-022-16356-3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Deep-sea bottom-water environment change caused by sediment resuspension on the continental slope off Sanriku, Japan, before and after the 2011 Tohoku Earthquake2022

    • 著者名/発表者名
      Wakita Masahide、Watanabe Shuichi、Yoshino Jun、Oguri Kazumasa、Nomaki Hidetaka、Kawagucci Shinsuke、Ariyoshi Keisuke、Nagano Akira、Fujikura Katsunori
    • 雑誌名

      Progress in Earth and Planetary Science

      巻: 9 号: 1

    • DOI

      10.1186/s40645-022-00515-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Abundant chitinous structures in cytoplasm of Chilostomella and their potential functions2024

    • 著者名/発表者名
      Nomaki H, Chen C, Oda K, Tsuchiya M, Tame A, Uematsu K, Salonen IS, Isobe N
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Correlative analyses of cellular structures and elemental distribution of soluble compounds: Cryo-SEM imaging coupled to EDS elemental mapping in the denitrifying species Bolivina spissa2024

    • 著者名/発表者名
      Richirt J, Okada S, Glock N, Ishitani Y, Nomaki H
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Pore detection of denitrifying benthic foraminifera Bolivina spissa through automated image analysis technique2024

    • 著者名/発表者名
      Menon AG, Davis CV, Numberg D, Nomaki H, Salonen IS, Glock N
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Ubiquitous occurrence of phosphate storage in foraminifera: Another adaptation to anaerobic environments?2024

    • 著者名/発表者名
      Glock N, Nomaki H, Woehle C, Algar C, Kienast M, Menon AG, Mutzberg A, Rakshit S, Richirt J, Schmiedl G, Steiner Z, Zhang Z
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Vacuoles size and abundance in Foraminifera: new insight about their metabolic adaptation to low oxygen environments2024

    • 著者名/発表者名
      Richirt J, Matsuzaki T, Ishitani Y, Tame A, Oda K, Nomaki H
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular insights into ecology and evolution of the deep-sea foraminifer Chilostomella ovoidea and its endobiotic plastid2024

    • 著者名/発表者名
      Salonen I, Husnik F, Naumova M, Ishitani Y, Richirt J, Nomaki H
    • 学会等名
      FORAMS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi