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活性イオウ化タンパク質解析法の開発:活性イオウプロテオミクスに向けての基盤研究

研究課題

研究課題/領域番号 21H02082
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関大阪公立大学 (2022-2023)
大阪府立大学 (2021)

研究代表者

居原 秀  大阪公立大学, 大学院理学研究科, 教授 (60254447)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
キーワード活性イオウ分子 / LC-MS/MS / 活性硫黄 / プロテオミクス / ポリスルフィド / 活性イオウプロテオミクス / TME-IAM / iCPS / アルキル化剤補足法
研究開始時の研究の概要

応募者らが活性イオウ分子を発見して以来、生物(特に高等動物)におけるイオウの重要性が再認識されている。活性イオウ分子は、多様な存在様式を示すが、最近、応募者らは、タンパク質活性イオウ化が、翻訳共役型プロセスであり、すべてのシステイン含有タンパク質が活性イオウ化されていることを明らかにした。本研究では、応募者が明らかにしてきた活性イオウ分子の諸性質、開発してきた解析技術、試薬に加え、さらに活性イオウ化タンパク質の解析に特化した技術を開発し、活性イオウ化タンパク質の解析方法を確立することを目的とし、活性イオウプロテオミクスの基盤とする。

研究成果の概要

これまでにタンパク質の活性イオウ化の解析法は確立されていなかった。本研究ではLC-MS/MSを用いて活性イオウ化タンパク質の解析方法を確立することを目的としした。
従来解析が困難であったタンパク質中の酸化型活性イオウ構造をLC-MS/MSを用いて解析する方法を開発し、細菌の硫化水素センサータンパク質である大腸菌YgaVが、硫化水素依存的に分子内テトラスルフィド構造を形成することを示した。
また、酸化ストレスセンサータンパク質であるKeap1の細胞内における還元型活性イオウ化部位をLC-MS/MSを用いて解析し、25残基中19残基の活性イオウ化システイン残基の検出に成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

応募者らにより、すべてのシステイン含有タンパク質は活性イオウ化されていることが明らかにされたが、タンパク質中の活性イオウの存在様式、つまり「どのタンパク質の、どのシステインが、どのように活性イオウ化(還元型、酸化型、イオウの数)されているのか」は不明であった。
本研究により、活性イオウ化タンパク質の解析が可能となり、そこから得られる新たな知見が、タンパク質の機能制御、立体構造形成メカニズム解明の手掛かりとなり、タンパク質科学の新展開につながると期待される。
また本研究成果は、基礎生物学のみならず、医薬、薬学、農学、工学分野においても新領域を開拓するための礎になることが期待される。

報告書

(2件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 8件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] SOD1 is an essential H2S detoxifying enzyme2023

    • 著者名/発表者名
      Switzer Christopher H.、Kasamatsu Shingo、Ihara Hideshi、Eaton Philip
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 120 号: 3

    • DOI

      10.1073/pnas.2205044120

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of methods for quantitative determination of the total and reactive polysulfides: Reactive polysulfide profiling in vegetables2023

    • 著者名/発表者名
      Kasamatsu Shingo、Kinno Ayaka、Hishiyama Jun-ichi、Akaike Takaaki、Hideshi IharaIhara Hideshi
    • 雑誌名

      Food Chemistry

      巻: 413 ページ: 135610-135610

    • DOI

      10.1016/j.foodchem.2023.135610

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] S-allyl cysteine increases blood flow in NO-dependent and-independent manners2022

    • 著者名/発表者名
      Takemura Shigekazu, Ihara Hideshi, Nakagawa Kanako, Minamiyama Yukiko
    • 雑誌名

      Glycative Stress Research

      巻: 9 ページ: 146-157

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Sulfide-Responsive SqrR/BigR Homologous Regulator YgaV of Escherichia coli Controls Expression of Anaerobic Respiratory Genes and Antibiotic Tolerance2022

    • 著者名/発表者名
      Balasubramanian Rajalakshmi、Hori Koichi、Shimizu Takayuki、Kasamatsu Shingo、Okamura Kae、Tanaka Kan、Ihara Hideshi、Masuda Shinji
    • 雑誌名

      Antioxidants

      巻: 11 号: 12 ページ: 2359-2359

    • DOI

      10.3390/antiox11122359

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] nNOS splice variants regulate NO/ROS redox signaling via 8-nitro-cGMP formation: its potential involvement in Parkinson's disease-like neurotoxicity2023

    • 著者名/発表者名
      Shingo Kasamatsu, Kumiko Masuda, Hiroyasu Tsutsuki, Tomoaki Ida, Tsuyoshi Takata, Motohiro Nishida, Yasuo Watanabe, Tomohiro Sawa, Takaaki Akaike, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      Gordon Research Conference - Nitric Oxide 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A mass spectrometry-based technology for exploration of endogenous persulfides/polysulfides2022

    • 著者名/発表者名
      Shingo kasamatsu, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] High precision sulfur metabolomics innovated by a new specific probe for trapping reactive sulfur species2022

    • 著者名/発表者名
      Shingo Kasamatsu, Tomoaki Ida, Kosho Asada, Taisei Koga, Hozumi Motohashi, Takaaki Akaike, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      6th World congress on hydrogen sulfide in biology & medicine
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] S-Nitrosyl L-cysteine acts as suicidal substrate of cystathionine gamma-lyase2022

    • 著者名/発表者名
      Shoma Araki, Yukihiro Tsuchiya, Shingo Kasamatsu, Hideshi Ihara, Hidehiko Nakagawa, Takaaki Akaike, Yasuo Watanabe
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Omics analysis of reactive sulfur species in the brain tissue of mouse model of Alzheimer’s disease2022

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Kinno, Shingo Kasamastu, Takaaki Akaike, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of the effects of germination on endogenous polysulfide production in soybean2022

    • 著者名/発表者名
      Mahiro Kuryu, Shingo Kasamatsu, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of polysulfide profile changes in broccoli during germination2022

    • 著者名/発表者名
      Takuma Owaki , Shingo Kasamatsu , Hideshi Ihara
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of ionization-coupled cleavage of oxidized polysulfide structure (iCOPS): a novel detection method for oxidized polysulfide modifications on proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Kae Okamura, Shingo Kasamatsu, Takayuki Shimizu, Shinji Masuda, Hideshi Ihara
    • 学会等名
      The 12th International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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