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回転分子モーターのイオン輸送メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 21H02409
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関千葉大学

研究代表者

村田 武士  千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (80415322)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2022年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2021年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワードV-ATPase / 分子モーター / 構造解析 / イオン輸送 / 分子メカニズム
研究開始時の研究の概要

腸球菌V-ATPaseはATPのエネルギーを使って回転しながらイオンを輸送する膜たんぱく質で、腸球菌の生育に重要な役割を担っています。最近我々は薬剤耐性腸球菌の抗菌剤が結合した腸球菌V-ATPaseの詳細な立体構造マップを得ることに成功しました。そこで本研究では、腸球菌V-ATPaseの詳細な立体構造を決定します。そして、得られた構造情報からイオン輸送や抗菌剤結合に重要と考えられる箇所を詳細に解析し、V-ATPaseがどのようにイオンを輸送するのか、抗菌剤がどのようにV-ATPaseを阻害するのかを明らかにします。

研究成果の概要

腸球菌V-ATPaseは、ATPのエネルギーを利用して回転しながらNa+を輸送する膜タンパク質であり、腸球菌の生育に重要な役割を果たしている。我々は、腸球菌V-ATPaseの阻害剤を発見し、多剤耐性腸球菌に対する抗菌薬としての可能性を見出した。本研究では、クライオ電子顕微鏡を用いて、阻害剤が結合した腸球菌V-ATPaseの膜内複合体の詳細な構造を解明した。得られた構造・機能解析情報を統合することにより、①本酵素のNa+輸送メカニズム、②阻害剤によるNa+輸送阻害メカニズム、③Na+輸送とH+輸送の分子メカニズムの違いを明らかにした。現在、得られた情報を基に抗菌薬の開発を進めている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

腸球菌V-ATPaseは、ATPのエネルギーを利用して回転しながらイオンを輸送する膜タンパク質であり、腸球菌の生育に重要な役割を果たしています。我々は、腸球菌V-ATPaseの阻害剤を発見し、多剤耐性腸球菌に対する抗菌薬としての可能性を見出しました。本研究では、阻害剤が結合した腸球菌V-ATPaseの詳細な立体構造を決定しました。そして、V-ATPaseがどのようにイオンを輸送するのか、阻害剤がどのようにV-ATPaseを阻害するのかを明らかにしました。現在、得られた情報を基に抗菌薬の開発を進めています。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (8件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Medical Research Council/Imperial College London(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Medical Research Council/Imperial College London(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Six states of Enterococcus hirae V-type ATPase reveals non-uniform rotor rotation during turnover2023

    • 著者名/発表者名
      Burton-Smith Raymond N.、Song Chihong、Ueno Hiroshi、Murata Takeshi、Iino Ryota、Murata Kazuyoshi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 755-755

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05110-8

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Satoshi、Hayashi Tomohiko、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 10 ページ: 1-23

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1159603

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Revealing a Hidden Intermediate of Rotatory Catalysis with X-ray Crystallography and Molecular Simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Shekhar Mrinal、Gupta Chitrak、Suzuki Kano、Chan Chun Kit、Murata Takeshi、Singharoy Abhishek
    • 雑誌名

      ACS Central Science

      巻: 8 号: 7 ページ: 915-925

    • DOI

      10.1021/acscentsci.1c01599

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Discovery of a novel inhibitor for Na+-transporting V-ATPase enables suppression of VRE colonization in mice and reveals high-resolution structure of the Na+ transport pathway2023

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Murata
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Bioenergetics
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Na+-Transporting V-ATPase Inhibitor Suppresses VRE Growth in Mice and Unveils Na+ Pathway Structure2023

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Murata
    • 学会等名
      21th IPR Retreat
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Takeshi Murata and Masahiro Kinoshita
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 腸球菌V-ATPase阻害剤はウェルシュ菌の増殖をpH依存的に阻害する2022

    • 著者名/発表者名
      阿部 晶平、清水 康輝、金沢 達志、宮城 侑弥、清木 一生、森山 克彦、宮田 茂、村田 武士
    • 学会等名
      第26回腸内細菌学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] The Off-Axis Rotor of Enterococcus hirae V-type ATPase by Volta Phase Contrast and Conventional Phase Cryo-EM2022

    • 著者名/発表者名
      Raymond N. Burton-Smith, Jun Tsunoda, Chihong Song, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino, Kazuyoshi Murata
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule analysis and engineering of rotary V-ATPase2022

    • 著者名/発表者名
      大友 章裕、飯田 龍也、上野 博史、村田 武士、飯野 亮太
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 腸球菌V-ATPase阻害剤はウェルシュ菌の増殖を阻害する2022

    • 著者名/発表者名
      阿部晶平、清水康輝、金沢達志、清木一生、森山克彦、村田武士
    • 学会等名
      第95回日本細菌学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [産業財産権] 抗菌組成物及び医薬並びに抗菌方法2024

    • 発明者名
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • 権利者名
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2024
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 外国

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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