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多様な補因子によるp97の基質特異性制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21H02418
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関鳥取大学

研究代表者

佐藤 裕介  鳥取大学, 工学研究科, 講師 (50568061)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2022年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2021年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワードユビキチン / タンパク質分解 / タンパク質複合体 / クライオ電子顕微鏡 / ATPase / ユビキチン鎖
研究開始時の研究の概要

p97は補因子と共にはたらき、主にユビキチン鎖修飾を受けた基質をアンフォールディングすることでプロテアソーム分解へと導き、多様な細胞機能を制御する。p97が多様な役割を持つのは、ユビキチン鎖修飾の様式が多様である事に加え、p97が約30種類の補因子依存的に基質特異性を獲得しているためである。しかし、ほとんどの補因子についてはp97の基質特異性の決定機構は不明である。本研究では多様な補因子によるp97制御機構を解明するため、生化学的な実験とクライオ電子顕微鏡単粒子解析により、多様な補因子によるp97の基質特異性制御機構を明らかにする。

研究実績の概要

p97は補因子と共にはたらき、主にユビキチン鎖修飾を受けた基質をアンフォールディングすることでプロテアソーム分解へと導き、多様な細胞機能を制御する。p97が多様な役割を持つのは、ユビキチン鎖修飾の様式が多様である事に加え、p97が約30種類の補因子依存的に基質特異性を獲得しているためである。しかし、ほとんどの補因子についてはp97の基質特異性の決定機構は不明である。本研究では多様な補因子によるp97制御機構を解明するため、生化学的な実験とクライオ電子顕微鏡単粒子解析により、多様な補因子によるp97の基質特異性制御機構を明らかにする。本課題によりそれぞれの補因子によるp97の基質特性制御機構が解明されれば、多様な機能を持つp97の研究が進展し、p97が関与する疾患の発症機構の解明へ繋がる。
2021年度にp97を活性を亢進する補因子としてFAF1とUBXD7を発見した。2022年度はさらに、これらの補因子のN末端側、もしくはC末端側を切り詰めることで、これら補因子のいずれの領域がp97の活性に必須であるかを探索し、FAF1とUBXD7が異なる領域でp97を活性化している事を明らかとした。さらに、p97の活性化測定の基質として用いるユビキチン鎖結合型mEosの、ユビキチン鎖の鎖長を制御し、p97の活性化にはユビキチンが5分子以上結合したユビキチン鎖が必要であることを明らかにした。一方、クライオ電子顕微鏡による単粒子解析については、p97と補因子との複合体の構造の解明には至っていない。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

クライオ電子顕微鏡による構造解析には至っていないが、p97の活性を亢進する補因子のp97活性化ドメインを発見することに成功したため、本研究はおおむね順調に進展していると言える。

今後の研究の推進方策

p97の活性を亢進する補因子は発見し、補因子のどの領域が活性亢進に影響しているかも解明できた。今後はp97と補因子の複合体の構造解明により注力していく。これまではヒト由来のp97を主に解析の対象として用いてきたが、今後は出芽酵母のp97(Cdc48)など、異なる生物種について単粒子解析の対象として選択し、より補因子の構造が明瞭に観察できる試料を作成する。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Involvement of heterologous ubiquitination including linear ubiquitination in Alzheimer’s disease and amyotrophic lateral sclerosis2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Yusuke、Terawaki Seigo、Oikawa Daisuke、Shimizu Kouhei、Okina Yoshinori、Ito Hidefumi、Tokunaga Fuminori
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 10 ページ: 1089213-1089213

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1089213

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ユビキチンコードの構造生物学2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤 裕介
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 94 号: 1 ページ: 67-77

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2022.940067

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2022-02-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spinocerebellar ataxia type 17-digenic TBP/STUB1 disease: neuropathologic features of an autopsied patient2022

    • 著者名/発表者名
      Saito Rie、Tada Yui、Oikawa Daisuke、Sato Yusuke、Seto Makiko、Satoh Akira、Kume Kodai、Ueki Nozomi、Nakashima Masahiro、Hayashi Shintaro、Toyoshima Yasuko、Tokunaga Fuminori、Kawakami Hideshi、Kakita Akiyoshi
    • 雑誌名

      Acta Neuropathologica Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 177-177

    • DOI

      10.1186/s40478-022-01486-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification and molecular analysis of <i>RNF31</i> Q622H germline polymorphism2022

    • 著者名/発表者名
      Nakazawa Seshiru、Mamiya Ryo、Kawabata?Iwakawa Reika、Oikawa Daisuke、Kaira Kyoichi、Tokunaga Fuminori、Nobusawa Sumihito、Sato Yusuke、Sasaki Atsushi、Yajima Toshiki、Shirabe Ken
    • 雑誌名

      Oncology Letters

      巻: 24 号: 5 ページ: 394-394

    • DOI

      10.3892/ol.2022.13514

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for the linkage specificity of ubiquitin-binding domain and deubiquitinase2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Yusuke
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 172 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1093/jb/mvac031

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for specific recognition of K6-linked polyubiquitin chains by the TAB2 NZF domain2021

    • 著者名/発表者名
      Li Yanjun、Okatsu Kei、Fukai Shuya、Sato Yusuke
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 120 号: 16 ページ: 3355-3362

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2021.06.037

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミトコンドリアにおけるユビキチンコード形成と分解の構造基盤2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、尾勝圭、深井周也
    • 学会等名
      第63回日本生化学会 中国・四国支部例会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RAD23B UBA2ドメインによるK48結合型ユビキチン鎖特異的認識機構2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、金澤豪、瓜島絢、角田海斗、日野智也、永野真吾
    • 学会等名
      グリーン・サスティナブル・ケミストリー研究センター創立10周年記念シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for specific recognition of Lys48-linked polyubiquitin chains by the UBA2 domain of RAD23B2022

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Sato
    • 学会等名
      The International Symposium in Tokyo 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] RAD23B UBA2ドメインによるK48結合型ユビキチン鎖特異的認識機構2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、金澤豪、瓜島絢、角田海斗、日野智也、永野真吾
    • 学会等名
      第27回日本病態プロテアーゼ学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] RAD23AによるK48鎖特異的認識機構の構造基盤2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、瓜島絢、角田海斗、日野智也、永野真吾
    • 学会等名
      第48回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ユビキチンシグナルの構造生物学 奨励賞受賞記念講演2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介
    • 学会等名
      第94回日本生化学大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RAD23A UBAドメインによるK48結合型ユビキチン鎖特異的認識機構の構造基盤2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、瓜島絢、日野智也、永野真吾
    • 学会等名
      第94回日本生化学大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] AD23A-UBA2によるK48鎖特異的認識機構の構造基盤2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介、瓜島絢、日野智也、永野真吾
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2023-12-25  

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