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光駆動型イオンポンプの分子動画解析とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 21H02439
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関東北大学

研究代表者

南後 恵理子  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (90376947)

研究分担者 保坂 俊彰  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 技師 (40462725)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2023年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2022年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2021年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
キーワードロドプシン / X線自由電子レーザー / X線結晶解析 / 微生物型ロドプシン
研究開始時の研究の概要

微生物由来ロドプシンは、光を受容して機能を発揮する膜タンパク質であり、最近では光遺伝学に利用されるなど応用面でも注目されている。ロドプシンの最も代表的な機能は、同一方向への能動的なイオン輸送であり、塩化物イオンや水素イオンなどを輸送するロドプシンが知られている。それらは構造が類似しているにも関わらず、それぞれ電荷の異なるイオンを輸送するため、その仕組みに興味が持たれている。本課題では、ロドプシンの光反応過程をリアルタイム且つ原子レベルで可視化することを目的とし、X線自由電子レーザーによる分子動画解析を実施する。得られた動的構造情報を基に合理的設計を行い、新たな機能を持つ分子の創製を目指す。

研究成果の概要

微生物由来のレチナールタンパク質(ロドプシン)は、光により機能を発揮する膜タンパク質である。代表的な機能は、光受容により一方向にイオンを能動輸送する機能であり、様々なイオンを輸送するロドプシンが知られている。その基本構造は類似しており、構造の類似性にも関わらず電荷の異なるイオンを同一方向に輸送する仕組みに興味が持たれてきた。本課題では、数種のイオンポンプロドプシンの発現、結晶化を行い、実際にX線自由電子レーザーを用いた時分割実験により、動的構造を取得するに至った。

研究成果の学術的意義や社会的意義

今までに、部位特異的変異導入及びその活性測定やクライオトラップ法による中間体X線結晶構造解析などが行われてきたが、イオンの選択性やイオン輸送機構の全容は明らかではなかった。本課題では、X線自由電子レーザーにより、光反応の過程をリアルタイム且つ原子レベルで可視化することが可能なことから、従来の課題を克服し新たな知見を見出すことが期待される。また、本ターゲットはその光応答性を利用して細胞の光制御を可能とするオプトジェネティクスに利用されるなど応用面でも注目されており、分子設計への応用も期待される。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 9件、 招待講演 25件)

  • [雑誌論文] Recent progress in membrane protein dynamics revealed by X-ray free electron lasers: Molecular movies of microbial rhodopsins2023

    • 著者名/発表者名
      Eriko Nango and So Iwata
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Struct.Biol.

      巻: 81 ページ: 102629-102629

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2023.102629

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrafast structural changes direct the first molecular events of vision2023

    • 著者名/発表者名
      Gruhl T, Weinert T, Rodrigues M J, Milne C J, Ortolani G, Nass K, Nango E, ...Schertler G, and Panneels V. et al.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 615 号: 7954 ページ: 939-944

    • DOI

      10.1038/s41586-023-05863-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Conformational alterations in unidirectional ion transport of a light-driven chloride pump revealed using X-ray free electron lasers.2022

    • 著者名/発表者名
      Hosaka, T. et al.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 119 号: 9

    • DOI

      10.1073/pnas.2117433119

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] X線自由電子レーザーによる時分割実験の現状と展望2024

    • 著者名/発表者名
      南後 恵理子
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Seeing is believing:X線自由電子レーザーによるタンパク質分子動画解析2023

    • 著者名/発表者名
      南後 恵理子
    • 学会等名
      生物物理学会若手の会夏の学校
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 3D movies of structural changes in proteins captured by X-ray free electron lasers2023

    • 著者名/発表者名
      南後 恵理子
    • 学会等名
      the 9th CWRU x Tohoku Joint Workshop
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーによるタンパク質分子動画解析2023

    • 著者名/発表者名
      南後 恵理子
    • 学会等名
      第 17 回 日本分子イメージング学会 総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Time-resolved serial femtosecond crystallography of microbial rhodopsins2023

    • 著者名/発表者名
      南後 恵理子
    • 学会等名
      EMBO Workshop Time-resolved spectroscopy meets time-resolved crystallography: The future of dynamic photobiology
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Recent activities of biology research fields and requests for facilities (tentative)2023

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      SACLA User's Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーによるタンパク質分子動画解析2023

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      2022年度iBIX-JAXA-KEK物構研-QST合同タンパク質研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] XFELによるタンパク質分子動画解析の現状と今後の展望2023

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第36回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X 線自由電子レーザーによるタンパク質分子動画解析2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      光・量子デバイス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 3D Movies of Structural Changes in Proteins Captured by X-ray Free Electron Lasers2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      AsBIC10(10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高速分子動画計測の現状と今後の課題2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      新学術領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X 線自由電子レーザーによる高時空間分解能タンパク質分子動画2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第8回電子状態理論シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速分子動画法で観るタンパク質構造変化2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Time-resolved serial femtosecond crystallography of microbial rhodopsins2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      ICRP2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 3D movies of structural changes in proteins captured by X-ray free electron lasers2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      Sendai2022 workshop, An Update on Molecular Machines: Open Challenges and New Perspectives
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高速分子動画法で観るタンパク質構造変化2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      Agtechセミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーを用いた膜タンパク質分子動画解析2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      バイオインタストリー協会「発酵と代謝研究会」第1回勉強会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 百聞は一見に如かず:タンパク質分子動画から見えてくる世界2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      LINK-J×東北大学次世代放射光イベント
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Time-resolved serial femtosecond crystallography of microbial rhodopsins2022

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      “The Molecular Movies and beyond” International Symposium 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural changes in chloride ion pump rhodopsin by time-resolved crystallography2022

    • 著者名/発表者名
      保坂俊彰
    • 学会等名
      大阪大学蛋白研セミナー Frontier of Dynamic Structural Biology(招待講演)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーによるタンパク質分子動画解析2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      日本化学会 東海コンファレンス2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 原子レベルの動的構造解析が 拓く生体分子機能の理解2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会(BSJ2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] SACLAでの時分割構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      よこはまNMR研究会 第67回ワークショップ「放射光解析の最前線」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Protein structural;dynamics revealed by molecular movie analysis2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第35回アメリカ蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高速分子動画:タンパク質の構造機能相関研究の最先端 Non-equilibrium state molecular movies: a new frontier in structural and functional studies on proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Eriko Nango
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速分子動画が捉えるタンパク質構造ダイナミ クス Protein structural dynamics captured by molecular movie analysis2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第77回学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーによる分子動画解析2021

    • 著者名/発表者名
      南後恵理子
    • 学会等名
      第47回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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