ヒト高次脳機能におけるmicroRNAを介した遺伝子ネットワークの解明

• 研究課題/領域番号: 21H02465
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43060:システムゲノム科学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 程 久美子 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50213327)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2024-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円); 2023年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円); 2022年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円); 2021年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
• キーワード: microRNA / bioinformatics / gene network / neuron / memory / pathway / dsRNA binding protein

研究開始時の研究の概要

miRNAは約22塩基程度の小さなnon-coding RNAであり、相補的な塩基配列をもつmRNAに対合し、RNAサイレンシングという機構により翻訳を抑制する。miRNAは多数の遺伝子を一括して抑制するだけでなく、その程度もさまざまという非常に複雑な遺伝子発現調節をおこなうことから、記憶・学習・思考などの高次脳機能の分子メカニズム解明の鍵となる分子と考えられる。しかしながら、その遺伝子発現制御機構の複雑さから、どのように高次生命機能を制御しているのか、詳細は不明である。そこで、本研究ではさまざまな手法を組み合わせ、miRNAが制御する複雑な遺伝子ネットワークの詳細を明らかにすることをめざす。

研究実績の概要

ヒトには2,000以上のmicroRNA(miRNA)という小さなノンコーディングRNAが存在し、それぞれが複数の遺伝子の発現を異なる程度で微調整していることが近年のRNA研究によりわかってきた。このような極めて複雑な遺伝子発現の制御機序は、特に学習・記憶・思考などの高次脳機能の調節や、ヒトに特有の生体防御機構などの複雑な生命機能を制御するのに適したシステムと考えられる。しかしながら、従来の研究ではmiRNAを介した高次脳機能における遺伝子ネットワークの詳細は明らかになっていない。本研究では、トランスクリプトーム解析と共に、独自性が高く、従来法とは異なる視点からの実験的解析手法と、申請者らが新たに開発したバイオインフォマティクス的解析手法を組み合わせ、高次生命機能におけるmiRNAによって構築される遺伝子ネットワークの詳細を明らかにし、その動作原理の解明をめざしている。具体的には、miRNAの生合成過程の制御機構、miRNAに優先的に結合する二本鎖RNA結合タンパク質の種類とその発現制御機構、さらにはmiRNA-mRNAのネットワーク解析により、複雑な高次生命機能の制御機構を解明する。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

miRNAは、それぞれが異なる複数の遺伝子の発現を異なる程度で制御している。このように、miRNAは遺伝子発現を複雑に微調整できることから、特にヒトに特有な生体防御機構や高次脳機能の調節に適したシステムと考えられる。しかし、従来の研究では、そのような複雑な生命現象におけるmiRNAを介した遺伝子ネットワークの詳細は明らかにされていない。本研究では、実験的研究手法と計算科学的研究手法の両方を用いて、miRNAによる高次生命機能の制御機構を解明することを目指している。申請者らは、特定のmiRNA群の活性は、それらに特徴的な二次構造を識別して結合する二本鎖RNA結合タンパク質によって制御される可能性について検討し、実際に二本鎖RNA結合タンパク質の種類によって、miRNAのプロセシングのステップが制御されることを明らかにした。さらに、その下流のmRNAの発現解析を行うことで、成熟型miRNAによるmiRNA-mRNAネットワークを解析した。一方で、二本鎖RNA結合タンパク質同志の相互作用についても、共同研究によるマススペクトロメトリー解析と計算科学的研究手法により明らかにした。その結果、miRNAの成熟過程に関わるタンパク質と相互作用する二本鎖RNA結合タンパク質同志の相互作用により、miRNAの成熟過程が制御されることがわかってきた。さらに、制御されるmiRNAの種類は外部からの刺激による二本鎖RNA結合タンパク質の発現変動により、巧みに制御されていると考えられる結果が得られた。

今後の研究の推進方策

高次生命機能におけるmiRNA-mRNAによる遺伝子ネットワークの制御は、外部からの環境要因によって変動する可能性が強く示唆された。それは、特に二本鎖RNA結合タンパク質の発現変動が大きな影響をもたらすと考えられた。今回の研究結果から、二本鎖RNA結合タンパク質同志の相互作用がmiRNAの成熟化過程に大きな影響を与える可能性が提唱できたので、この点について新たな検討を行う。
また、miR-124aはヒト・マウス・ラットで塩基配列が同一で、脳に発現する全miRNAの25~48%を占める脳でもっとも多く存在するmiRNAである。そのノックアウトマウスでは脳の発達障害や「記憶」に重要な海馬の神経回路形成に異常が認められるため、ニューロンの維持・機能に関与するmiRNAと考えられている。miR-124aによる遺伝子ネットワークは解析できていないが、miR-124aの二本鎖RNA結合タンパク質による制御機構についても検討する予定である。

研究成果

• [雑誌論文] Caspase-mediated processing of TRBP regulates apoptosis during viral infection (2024)
  • 著者名/発表者名: Shibata Keiko、Moriizumi Harune、Onomoto Koji、Kaneko Yuka、Miyakawa Takuya、Zenno Shuhei、Tanokura Masaru、Yoneyama Mitsutoshi、Takahashi Tomoko、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: gkae246 号: 9 ページ: 5209-5225
  • DOI: 10.1093/nar/gkae246
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Utilizing Large Functional and Population Genomics Resources for CRISPR/Cas Perturbation Experiment Design (2023)
  • 著者名/発表者名: Wang Qingbo S.、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 2023 ページ: 63-73
  • DOI: 10.1007/978-1-0716-3016-7_5
  • ISBN: 9781071630150, 9781071630167
• [雑誌論文] SNPD-CRISPR: Single Nucleotide Polymorphism-Distinguishable Repression or Enhancement of a Target Gene Expression by CRISPR System (2023)
  • 著者名/発表者名: Maruyama Shohei、Kusakabe Takashi、Zou Xinyi、Kobayashi Yoshiaki、Asano Yoshimasa、Wang Qingbo S.、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology 巻: 2637 ページ: 49-62
  • DOI: 10.1007/978-1-0716-3016-7_4
  • ISBN: 9781071630150, 9781071630167
• [雑誌論文] siRNA核酸医薬品の研究開発動向と実用化へ向けた今後の展開 (2023)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 雑誌名: PHARM STAGE 巻: 23 ページ: 65-72
• [雑誌論文] miRNAやsiRNAを用いた創薬研究 (2023)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、程久美子
  • 雑誌名: RNAの科学-21世紀のテキストブック 巻: -
• [雑誌論文] 核酸医療の基礎知識：mRNAの発現制御機構ーsiRNAとmiRNAの比較ー (2023)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明・程久美子
  • 雑誌名: CLINICAL NEUROSICENCE 巻: - ページ: 616-620
• [雑誌論文] 第3節 オフターゲット効果を回避するsiRNA医薬の分子設計 (2023)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明、程久美子
  • 雑誌名: 核酸医薬・mRNA医薬の製造分析の基礎と基盤技術開発 巻: - ページ: 119-126
• [雑誌論文] siRNAが働く仕組みと医薬品としての研究開発の現状 (2023)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明、浅野吉政、程久美子
  • 雑誌名: 循環器内科 巻: 93 ページ: 1-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] A 2′-modified uridine analog, 2′-O-(methylthiomethoxy)methyl uridine, for siRNA applications (2022)
  • 著者名/発表者名: Fangjie Lyu, Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Rintaro Baba, Naoko Abe, Haruka Hiraoka, Fumitaka Hashiya, Zhaoma Shu, Kumiko Ui-Tei, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 巻: 74 ページ: 128939-128939
  • DOI: 10.1016/j.bmcl.2022.128939
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Knockdown of 15-bp Deletion-Type v-raf Murine Sarcoma Viral Oncogene Homolog B1 mRNA in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Cells Repressed Cell Growth In Vitro and Tumor Volume In Vivo (2022)
  • 著者名/発表者名: Song Jiaxuan、Kobayashi Yoshiaki、Asano Yoshimasa、Sato Atsushi、Taniguchi Hiroaki、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Cancers 巻: 14 号: 13 ページ: 3162-3162
  • DOI: 10.3390/cancers14133162
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The siRNA Off-Target Effect Is Determined by Base-Pairing Stabilities of Two Different Regions with Opposite Effects (2022)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Yoshiaki、Tian Shen、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Genes 巻: 13 号: 2 ページ: 319-319
  • DOI: 10.3390/genes13020319
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] siRNA Seed Region Is Divided into Two Functionally Different Domains in RNA Interference in Response to 2′-OMe Modifications (2022)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Yoshiaki、Fukuhara Daiki、Akase Dai、Aida Misako、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: ACS Omega 巻: 7 号: 2 ページ: 2398-2410
  • DOI: 10.1021/acsomega.1c06455
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Modulation of MicroRNA Processing by Dicer via Its Associated dsRNA Binding Proteins (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Toyotaka、Asano Yoshimasa、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Non-Coding RNA 巻: 7 号: 3 ページ: 57-57
  • DOI: 10.3390/ncrna7030057
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Extreme deformability of insect cell membranes is governed by phospholipid scrambling (2021)
  • 著者名/発表者名: Shiomi A., Nagao K., Yokota N., Tsuchiya M., Kato U., Juni N., Hara Y., Mori M.X., Mori Y., Ui-Tei K., Murate M., Kobayashi T., Nishino Y., Miyazawa A., Yamamoto A., Suzuki R., Kaufmann S., Tanaka M., Tatsumi K., Nakabe K., Shintaku H., Yesylevsky S., Bogdanov M., Umeda M.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 35 号: 10 ページ: 109219-109219
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109219
  • NAID: 120007052731
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Selection of Chemical Modifications in the siRNA Seed Region That Repress Off-Target Effect (2021)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Yoshiaki、Miyamoto Kengo、Aida Misako、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 2021 ページ: 17-30
  • DOI: 10.1007/978-1-0716-1298-9_2
  • ISBN: 9781071612972, 9781071612989
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of Phosphorylated Amino Acids in Human TNRC6A C-Terminal Region and Their Effects on the Interaction with the CCR4-NOT Complex (2021)
  • 著者名/発表者名: Munakata Fusako、Suzawa Masataka、Ui-Tei Kumiko
  • 雑誌名: Genes 巻: 12 号: 2 ページ: 271-271
  • DOI: 10.3390/genes12020271
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 循環器疾患におけるsiRNAの可能性 (2024)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: レクビオWeb Symposium in 九州
  • 招待講演
• [学会発表] 循環器疾患におけるsiRNAの可能性 (2024)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: LEQVIO Web Symposium ~Long-acting PCSK9産生阻害薬~
  • 招待講演
• [学会発表] siRNA核酸医薬品の開発と今後の展望 (2023)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: 第44回日本臨床薬理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] The dsRNA binding proteins, PACT and TRBP, switch their binding partners during the poly(I:C)-induced antiviral response (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Toyotaka Yoshida, Yang Xiaoxiong, Yuta Otobe, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Hikari Yoshitane, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development and characterization of SNPD-siKRAS which specifically represses KRAS gene with single nucleotide mutation (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Hiroaki Taniguchi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Regulation of miRNA-mediated gene expression network by interferon-inducible ADAR1 (2023)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] The promising chemical modifications in the siRNA seed region that can avoid off-target effects by steric hindrance or thermodynamic stability (2023)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Akase Dai, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of siRNA specific for PIK3CA proto-oncogene with single-nucleotide mutation and its effect on cancer cell proliferation (2023)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Ohyama, Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Susumu Goyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of siRNA that specifically represses the expression of oncogenic fusion gene and verification of the effectiveness (2023)
  • 著者名/発表者名: Soto Ohkubo, Koki Furukawa, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of a CRISPR system that distinguishes single nucleotide mutations in the TERT promoter to suppress carcinogenesis. (2023)
  • 著者名/発表者名: Taku Yunomae, Hiromu Matsui, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Different roles of TRBP in multiple steps of antiviral response (2023)
  • 著者名/発表者名: Shota Azuma, Yuko Nakano, Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of a CRISPR-Cas9 system that targets only harmful bacteria or metabolites (2023)
  • 著者名/発表者名: Ryuichi Ono, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第46回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 新規モダティーとしてのsiRNA核酸医薬品 (2023)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: 「ニューモダリティと有機合成化学」研究部会第10回勉強会
  • 招待講演
• [学会発表] 一塩基変異を特異的に抑制するSNPD-siRNA核酸医薬開発 (2023)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: NCC-VIP第III期中間報告会
• [学会発表] 循環器疾患におけるsiRNAの可能性 (2023)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: TRIANGLE
  • 招待講演
• [学会発表] Development and verification of a single nucleotide mutation-distinguishable siRNA for PIK3CA (SNPD-siPIK3CA) (2023)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Ohyama, Yoshiaki Kobayashi, Susumu Goyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第8回日本核酸医薬学会
• [学会発表] The 2'-formamide modification in the siRNA seed region avoids off-target effects by steric hindrance (2023)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Akase Dai, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第8回日本核酸医薬学会
• [学会発表] Development of SNPD-siKRAS which specifically represses KRAS gene with single nucleotide mutation (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Hiroaki Taniguchi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第8回日本核酸医薬学会
• [学会発表] TRBP regulates anti-viral response by affecting miRNA biogenesis and OAS-RNase L pathway (2023)
  • 著者名/発表者名: Shota Azuma, Yuko Nakano, Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第24回日本RNA学会年会
• [学会発表] TENT2 and TENT4B regulate miRNA 3’-end adenylation in the immune response. (2023)
  • 著者名/発表者名: Zhou Fang, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第24回日本RNA学会年会
• [学会発表] Possible regulation of miRNA-mediated gene expression through TRBP and ADAR1 interaction. (2023)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第24回日本RNA学会年会
• [学会発表] Profiling of protein–protein network during the poly(I:C)-induced antiviral response (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Yang Xiaoxiong, Toyotaka Yoshida, Yuta Otobe, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Hikari Yoshitane, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第24回日本RNA学会年会
• [学会発表] Reducing Off-Target Effects of siRNA by Introducing 2'-Formamide Modification in the Seed Region. (2023)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Akase Dai, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: CSHL Asia, The Now and Future of RNA Therapeutics
  • 国際学会
• [学会発表] Development of single nucleotide mutation-distinguishable siRNA for PIK3CA (SNPD-siPIK3CA) and its effects on cancer cells. (2023)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Ohyama, Yoshiaki Kobayashi, Susumu Goyama, Kumiko Ui-Te
  • 学会等名: CSHL Asia, The Now and Future of RNA Therapeutics
  • 国際学会
• [学会発表] A new technology of siRNA that specifically represses the growth of human pancreatic cancer by reducing the mutated KRAS expression. (2023)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei, Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Hiroaki Taniguchi
  • 学会等名: The 28th Annual Meeting of the RNA Society
  • 国際学会
• [学会発表] Profiling of protein–protein network during the poly(I:C)-induced antiviral response (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Yuta Otobe, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Hikari Yoshitane, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: The 28th Annual Meeting of the RNA Society
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of TRBP and ADAR1 interaction that regulates downstream microRNA-mediated gene expression (2023)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: The 28th Annual Meeting of the RNA Society
  • 国際学会
• [学会発表] SNPD-siRNA: New technology of RNA interference that can knockdown the mutated gene without suppressing the normal gene. (2022)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei, Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Hiroaki Taniguchi
  • 学会等名: Gordon Research Conference : RNA Nanotechnology
  • 国際学会
• [学会発表] SNPD-siRNA: A New Technology of RNA Interference That Can Knockdown the Gene with Single Nucleotide Mutation Without Suppressing The Wild-type Gene. (2022)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: Gordon Research Conference : RNA Nanotechnology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Protein-protein interaction of RNA binding proteins induced by anti-viral response (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Yuta Otobe, Hikari Yoshitane, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第31回日本免疫学会学術集会
• [学会発表] Molecular design of single nucleotide polymorphism-distinguishable SNPD-siRNA (2022)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei, Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Verification of SNPD-siPIK3CA targeting single nucleotide mutation in PIK3CA oncogene in breast cancer-derived cells (2022)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Ohyama, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Development of siRNA which specifically represses the expression of oncogenic fusion gene (2022)
  • 著者名/発表者名: Soto Okubo, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Development of the CRISPR system to regulate TERT expression utilizing single nucleotide mutations in the promoter region (2022)
  • 著者名/発表者名: Hiromu Matsui, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] TRBP-LGP2 interaction induces apoptosis during viral infection by affecting miRNA biogenesis and OAS-RNase L pathway (2022)
  • 著者名/発表者名: Shota Azuma, Yuko Nakano, Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Functional difference of TNRC6 paralog in microRNA-mediated gene silencing through the combination of Argonaute/CCR4-NOT complex (2022)
  • 著者名/発表者名: Zao Zhang, Begar Efe, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] The 2’-formamide modification in the siRNA seed region reduces off-target effects by two different mechanisms (2022)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Dai Akase, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Regulation of microRNA biogenesis by Dicer-ADAR1p110 interaction Dicer-ADAR1p110相互作用によるmicroRNA生合成の制御 (2022)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] The changes in protein-protein interaction of RNA binding proteins during poly(I:C)-transfection Poly(I:C)刺激依存的なタンパク質間の相互作用ネットワークの解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Yuta Otobe, Hikari Yoshitane, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] Verification of CRISPR-Cas9 system for sequence-specific regulation of the gut microbiota CRISPR-Cas9システムによる塩基配列特異的な腸内細菌叢制御の検証 (2022)
  • 著者名/発表者名: Ryuichi Ono, Yoshiaki Kobayashi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] ウイルス感染によるTRBPのプロセシングがRNAサイレンシング活性に与える影響 (2022)
  • 著者名/発表者名: 森泉陽音、柴田惠子、尾野本浩司、米山光俊、程久美子、高橋朋子
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会
• [学会発表] 核酸医薬品siRNAの開発の現状 Update (2022)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: Alnylam Web Seminar - siRNAにより開かれる難病治療の扉
  • 招待講演
• [学会発表] siRNA核酸医薬開発の歴史と現状 (2022)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: 第36回小児脂質研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Specific knockdown of KRAS mutant gene using SNPD-siRNA repressed cell proliferation of pancreatic cancer cells in vitro and in vivo (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Atsushi Sato, Hiroaki Taniguchi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: CBI学会2022年大会
• [学会発表] Prediction of Structural Change of siRNA by 2'-formamide, a Newly-synthesized Chemical Modification, via Density Functional Theory. (2022)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Dai Akase, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: CBI学会2022年大会
• [学会発表] SNPD-siRNA: an siRNA Specifically Suppresses the Expression of a Target Gene with Single Nucleotide Mutation. (2022)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei, Yoshiaki Kobayashi, Yoshimasa Asano, Hiroaki Taniguchi
  • 学会等名: The Fourth RAS Initiative Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] The siRNA Seed Region Is Composed of Two Functionally Different Domains Which Have Different Effects On RNA Interference and Off-target Activities in Response to 2´-OMe Modifications. (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Daiki Fukuhara, Dai Akase, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: The Fourth RAS Initiative Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] Development of siRNA for KRAS and BRAF mutations using a cancer cell-derived Xenograft. (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Yoshiaki Kobayashi, Sato Atsushi, Hiroaki Taniguchi, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: The Fourth RAS Initiative Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] 抗がんsiRNA製剤のオフターゲット回避 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鈴木康哲, 名取幸和, 程久美子, 西原広史, 谷口博昭
  • 学会等名: 第81回 日本癌学会学術総会
• [学会発表] 1塩基の違いを区別して特異的に抑制するsingle-nucleotide polymorphism-distinguishable siRNA (SNPD-siRNA)の開発とその機能解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明，佐藤淳，浅野吉政，谷口博昭，程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会・若手シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 2’-formamide修飾をseed領域にもつsiRNAは塩基の向きを変えることで off-target効果を減弱させる (2022)
  • 著者名/発表者名: 安成鎮、小林芳明、野村浩平、木村康明、阿部洋、赤瀬大、相田美砂子、 程 久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会・若手シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] PIK3CAがん原遺伝子の一塩基多型を識別する小分子干渉RNA (SNPD-siRNA)の開発 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大山隼礼、小林芳明、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [学会発表] Cell-derived Xenograftモデルを用いたKRASやBRAFの変異部位を対象としたsiRNAの有効性の検証 (2022)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、小林芳明、佐藤淳、谷口博昭、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [学会発表] がん関連遺伝子の一塩基の違いを識別するCRISPRシステムの構築と内在遺伝子に対する有効性の検討 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鄒馨逸、小林芳明、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [学会発表] RNAサイレンシング促進因子TRBPのプロセシングを介した新しいIFN応答制御機構 (2022)
  • 著者名/発表者名: 柴田惠子、森泉陽音、尾野本浩司、米山光俊、程久美子、高橋朋子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [学会発表] Next generation siRNAs specific for mutations in the disease-causing genes. (2022)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第7回年会・Premium Oral Session
  • 招待講演
• [学会発表] Effects of inter-paralog combinations of TNRC6-Argonaute complexes on microRNA-mediated gene silencing (2022)
  • 著者名/発表者名: Zao Zhang, Efe Begar, Masataka Suzawa, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] MiRNA adenylation factors regulate miRNA silencing activities in the immune response (2022)
  • 著者名/発表者名: Zhou Fang, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] TRBP-LGP2 interaction induces apoptosis during viral infection by affecting miRNA biogenesis and OAS-RNase L pathway (2022)
  • 著者名/発表者名: Shota Azuma, Yuko Nakano, Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] The siRNA seed region is divided into two functionally different domains in RNA interference in response to 2´-OMe modifications. (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Daiki Fukuhara, Dai Akase, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] Regulation of miRNA biogenesis via Dicer-dsRBP interactions. (2022)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano and Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] The network of protein-protein interaction during poly(I:C)-transfection. (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Yoshitane Hikari, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第23回日本RNA学会年会
• [学会発表] Regulation of miRNA biogenesis by double-stranded RNA binding proteins, TRBP and ADAR1. (2022)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第21回東京大学生命科学シンポジウム
• [学会発表] Functional analysis of TRBP in antiviral innate immune signal. (2022)
  • 著者名/発表者名: Koji Onomoto, Miyu Watanabe, Tomoko Takahashi, Kumiko Ui-Tei, Mitsutoshi Yoneyama
  • 学会等名: 第86回日本サイトカイン・インターフェロン学会
• [学会発表] siRNA核酸医薬品とは？歴史・現状・展望 (2022)
  • 著者名/発表者名: 程 久美子
  • 学会等名: 慶應義塾大学先端生命研究所「概念構想」
  • 招待講演
• [学会発表] siRNA核酸医薬品開発の歴史、現状、今後の展望 (2022)
  • 著者名/発表者名: 程 久美子
  • 学会等名: ノバルティスファーマ株式会社 社内レクチャー
  • 招待講演
• [学会発表] The protein-protein interaction network during poly(I:C)-induced interferon response (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Yoshitane Hikari, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] TRBPとLIN28との相互作用によるmicroRNAの成熟化および分解制御メカニズムの解明 (2021)
  • 著者名/発表者名: 古川倖輝、濱田真平、高橋朋子、浅野吉政、程久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] BaseとSugar修飾を利用したsiRNAのoff-target効果の回避 (2021)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Akase Dai, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] 1塩基変異をもつがん原遺伝子を正常型と区別して特異的に抑制するCRISPR/Cas9システムの構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 日下部峻、程久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] Functional Analyses of Human TNRC6 Protein Paralogs Using Their Knockout Cells (2021)
  • 著者名/発表者名: Zao Zhang, Efe Begar, Masataka Suzawa, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] PIK3CAがん原遺伝子の一塩基変異を識別して抑制する小分子干渉RNA(SNPD-siRNA)の有効性の検証 (2021)
  • 著者名/発表者名: 大山隼礼、小林芳明、佐藤淳、程久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] miRNA-mRNA network during viral infection-induced apoptosis (2021)
  • 著者名/発表者名: Shota Azuma, Yuko Nakano, Yoshimasa Asano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] 2´-OMe修飾したsiRNAのseed領域は2つの機能ドメインをもつ (2021)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明、田申、福原大輝、赤瀬大、相田美砂子、程久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] ２本鎖RNA結合タンパク質、TRBPとADAR1、によるmicroRNA生合成過程の制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊珍、浅野吉政、程 久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] トリプレットリピート病の原因遺伝子における一塩基多型を識別する小分子干渉RNA（SNPD-siRNA）の構築とマカド・ジョセフ病由来細胞における検証 (2021)
  • 著者名/発表者名: 鈴木ゆりあ、小林芳明、程久美子
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会
• [学会発表] １塩基の変異を区別するsiRNA核酸医薬品開発と脳腫瘍原因遺伝子への適用の可能性 (2021)
  • 著者名/発表者名: Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 新潟大学脳科学研究所セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Stimulus-dependent regulation of microRNA biogenesis by ADAR1 (2021)
  • 著者名/発表者名: Toyotaka Yoshida, Yoshimasa Asano and Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第22回日本RNA学会年会
• [学会発表] Functional Analysis of Human GW182 Family Proteins Using Their Knockout Cells (2021)
  • 著者名/発表者名: Zao Zhang, Efe Begar, Masataka Suzawa, Yoshimasa Asano, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第22回日本RNA学会年会
• [学会発表] A gene expression network of apoptosis regulated by TRBP-bound miRNAs during poly(I:C)-induced interferon response (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Asano, Yuko Nakano, Tomoko Takahashi, Koji Onomoto, Mitsutoshi Yoneyama, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第22回日本RNA学会年会
• [学会発表] Identification of two functionally different domains in the seed region of 2´-OMe modified siRNA (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kobayashi, Shen Tian, Daiki Fukuhara, Dai Akase, Misako Aida, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 第22回日本RNA学会年会
• [学会発表] Cell-derived Xenograftモデルを用いたKRASの１塩基変異を対象としたSNPD-siRNAの有効性の検証 (2021)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、小林芳明、佐藤淳、谷口博昭、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会・若手シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Development of specific siRNA for 15bp Deletion Type BRAF Gene in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Cells (2021)
  • 著者名/発表者名: Song Jiaxuan, Atsushi Sato, Ui-Tei Kumiko
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] 化学修飾核酸導入によるsiRNAの標的特異性の向上 (2021)
  • 著者名/発表者名: 野村浩平、村瀬裕貴、中本航介、木村康明、阿部奈保子、安成鎮、小林芳明、近藤次郎、程久美子、阿部洋
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] ヒト細胞におけるインターフェロン応答と小分子RNA経路のクロストーク (2021)
  • 著者名/発表者名: 高橋朋子、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会・シンポジウム（生物）
  • 招待講演
• [学会発表] トリプレットリピート病の原因遺伝子における一塩基多型を識別する小分子干渉RNA（SNPD-siRNA）の構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 鈴木ゆりあ、小林芳明、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会・シンポジウム（生物）
  • 招待講演
• [学会発表] 1塩基変異型KRASを野生型と区別して抑制するSNPD-siRNAによる変異KRAS遺伝子抑制効果の膵臓がん由来細胞における検証 (2021)
  • 著者名/発表者名: 佐藤淳、小林芳明、浅野吉政、谷口博昭、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] 一塩基変異を識別して特異的に抑制するsingle nucleotide polymorphism-distinguishable siRNA (SNPD-siRNA)の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明、レディ奈緒美、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] がん原遺伝子の1塩基変異を正常型と区別するCRISPRシステムの構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 日下部峻、程久美子
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] Newly synthesized chemical modifications that reduce siRNA off-target effects (2021)
  • 著者名/発表者名: Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Kohei Nomura, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] Whole Genome analysis-based design and validation of siRNAs targeting the conserved regions of coronaviruses (2021)
  • 著者名/発表者名: Shengliang Ni,Kumiko Ui-Tei
  • 学会等名: 日本核酸医薬学会第6回年会
• [学会発表] K-RAS変異特異的SNPD-siRNA医薬品の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 程久美子
  • 学会等名: 第25回日本がん分子標的治療学会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 自然免疫応答におけるmiRNAサイレンシングとそれに伴う遺伝子発現変動 (2021)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、中野悠子、高橋朋子、尾野本浩司、米山光俊、程久美子
  • 学会等名: 第85回日本インターフェロン・サイトカイン学会学術集会
• [図書] 日本薬学会医薬化学部会機関誌「MEDCHEM NEWS」 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小林芳明、程久美子
  • 総ページ数: 4
  • 出版者: MEDCHEM NEWS
• [図書] 実験医学・増刊号『核酸医薬 本領を発揮する創薬モダリティ』 (2021)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、小林芳明、程久美子
  • 総ページ数: 7
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 実験医学別冊『リアルタイム・デジタルPCR実験スタンダード 検出・定量・診断のためのパーフェクトマニュアル』 (2021)
  • 著者名/発表者名: 浅野吉政、程久美子
  • 総ページ数: 9
  • 出版者: 羊土社