| 研究課題/領域番号 |
21H02541
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(B)
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分45020:進化生物学関連
|
|---|
| 研究機関 | 沖縄科学技術大学院大学 |
|---|
研究代表者 |
ブギーニョン トマ 沖縄科学技術大学院大学, 進化ゲノミクスユニット, 准教授 (40817558)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
|
| 配分額 *注記 |
11,440千円 (直接経費: 8,800千円、間接経費: 2,640千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2022年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
|
|---|
| キーワード | endosymbionts / insect / evolution / genomics / endosymbiont / cockroach / blattabacterium / GC-content / genome evolution / genome / gene loss / endosymbiosis / Blattabacterium / comparative genomics / Evolution |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
Bacterial endosymbionts are endowed with the smallest genomes known for any life form (excluding viruses). While genetic drift has been proposed as the main factor driving genome reduction in endosymbionts, we recently showed that other mechanisms, especially mutation rate, appear to better explain genome reduction. We will carry out comparative genomic analyses using the genomes of a large number of Blattabacterium strains with the aim of determining what are the factors responsible of genome reduction in bacterial endosymbionts.
|
| 研究成果の概要 |
我々は448のブラタバクテリウム（ゴキブリの細菌内共生体ゲノム解析を行い、うち300以上を単一コンティグにアセンブリした。また、その他のゲノムは断片化され、複数のコンティグにアセンブリした。さらにこれらのゲノムを解析して、ブラタバクテリウムにおける遺伝子喪失の背景を再構築し、遺伝子喪失の原因となるメカニズムの特定を試みた結果、突然変異率の増加が遺伝子喪失の主な原因であることを突き止めた。この研究成果は、Molecular Biology and Evolution (IF:10.7)とMolecular Phylogenet. Evol. (IF:4.3)に2つの論文として掲載された。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
My project improved our understanding of genome reduction in bacterial endosymbionts. It led to two publications in scientific journals, including one publication in MBE, a recognized journal in the field. My project was scientifically relevant and improved our understanding of endosymbionts.
|
