光遊離バーコードを用いた時空間的組織細胞解析

• 研究課題/領域番号: 21H02790
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
• 研究機関: 和歌山県立医科大学
• 研究代表者: 橋本 真一 和歌山県立医科大学, 先端医学研究所, 教授 (00313099)
• 研究分担者: 高村 禅 北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (20290877) ; 藤渕 航 京都大学, iPS細胞研究所, 教授 (60273512)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2024-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円); 2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2022年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2021年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
• キーワード: シングルセル / 組織空間情報 / 遺伝子発現 / Single Cell / 組織微小環境 / 時空間解析 / 組織

研究開始時の研究の概要

組織や細胞の複雑性/多様性を特徴付けるために最近、1細胞の解析手法が多く開発されている。しかしながら遺伝子発現解析の感度ならびに、1細胞中の複数の要素を簡単にかつ同時に測定できる状態には至っていない。また、位置情報をもった1細胞のデータが欠けている。本研究では、光分裂オリゴバーコードを使用し空間内にあるバーコードビーズを紐付けすることでこれらの問題点を解決する研究を提案する。