| 研究課題/領域番号 |
21H02848
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分52030:精神神経科学関連
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
木村 大樹 名古屋大学, 医学系研究科, 講師 (30612783)
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| 研究分担者 |
高橋 長秀 名古屋大学, 医学部附属病院, 准教授 (50846714)
Aleksic Branko 名古屋大学, 医学系研究科(国際), 特任准教授 (60547511)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2023年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2022年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
2021年度: 9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
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| キーワード | 自閉スペクトラム症 / 全ゲノムシークエンス / ロングリードシークエンス / ゲノムワイド関連解析 / 全ゲノムジェノタイピング / ポリジェニックスコア / GWAS / リピート配列 / 構造多型 / 多発家系 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
自閉スペクトラム症(ASD)の発症には遺伝要因の関与が指摘されているが、これまでのゲノム解析手法では、一部の症例にしかASD発症脆弱性ゲノム変異が同定されない。近年、ロングリードシークエンス技術が登場し、これまで同定が困難であった小さな規模のゲノム変異や、繰り返し配列の差異の検出が可能となった。この技術を用いることで、創薬や新規診断法に結びつくような、ASD発症への新しいメカニズムの解明を目指す。
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| 研究成果の概要 |
本研究では、自閉スペクトラム症（ASD）脆弱性変異を効率良く同定可能なASD多発家系を対象に、ロングリードによるWGSを実施し、ASD発症メカニズムの検証をした。
ロングリードシークエンスは非常に高額であるため、ASDの全ゲノムジェノタイピング結果からポリジェニックリスクスコアを算出し、ASD多発家系の発症にコモンバリアントが関与する影響を評価した。その上で、ロングリードによる多発家系解析にてASD発症脆弱性変異が同定される期待値の高い家系を抽出した。同時に、ロングリードシークエンスから、小規模CNVやリピート配列変異を抽出するパイプラインの構築と同定される小規模CNVの探索を実施した。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究で同定された中規模サイズの挿入欠失や繰り返し配列数の変異は、統合失調症や自閉スペクトラム症の新規分子病態解明や病態に基づく治療ターゲット分子の同定につながり得る。ロングリードシークエンス研究に関して、精神疾患を大規模に解析した結果は未だ報告されていないのが現状であり、本研究を通じて、発症脆弱性変異同定の検出力を高めるために従来の全ゲノム解析では発症脆弱性につながる遺伝要因が同定されない多発家系を多数抽出できたことは、今後の新規発症脆弱性バリアントの探索に繋がっていくと考えられる。
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