研究課題/領域番号 |
21H03187
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
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研究機関 | 愛知医科大学 |
研究代表者 |
菊地 正悟 愛知医科大学, 愛知医科大学, 名誉教授 (40224901)
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研究分担者 |
上野 誠 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), その他部局等, その他 (10520760)
中杤 昌弘 名古屋大学, 医学系研究科(保健), 准教授 (10559983)
笹平 直樹 公益財団法人がん研究会, 有明病院 肝・胆・膵内科, 部長 (30401102)
米澤 英雄 東京歯科大学, 歯学部, 講師 (60453528)
櫻井 美佳 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 准教授 (80508359)
大崎 敬子 杏林大学, 医学部, 教授 (90255406)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2022年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2021年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
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キーワード | ゲノムワイド関連解析 / 胆道がんの予防 / Helicobacter属抗体 / 要因の交互作用 / 生活習慣 / 胆のうがん予防 / 肝外胆管がん / 肝内胆管がん |
研究開始時の研究の概要 |
胆のうがん症例と対照のリンパ球由来DNAと血漿、生活習慣データを収集しん146例とペアを収集済みである。DNAで1塩基多型のゲノムワイド関連解析と全エクソーム解析を、血漿でHelicobacter属抗体測定を行う。これらの結果と生活習慣に関するデータを用いて、胆のうがんの発がん要因を、要因同士-特に遺伝子と生活習慣や慢性感染-の交互作用を含めて明らかにする。日本多施設共同コホート研究のおよび東北メガバンクのゲノム解析結果の利用申請を行い、対照に加えることで、検出力を高めた分析も行う。最終ゴールは、胆のうがんの予防に応用可能な要因を明らかにすることである。
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研究実績の概要 |
胆のうがんの発がん要因は何か、生活習慣など環境要因や遺伝的要因は相互にどのように影響し合いながら胆のうの発がんに作用しているか、を明らかにする目的で研究を進めている。これらの結果と生活習慣に関するデータのうち、喫煙歴、飲酒歴、身長体重の情報を用いて、胆のうがんの発がん要因を、要因同士特に遺伝子と生活習慣やの交互作用を含めて明らかにする。胆のうがんの予防に応用できる要因を見出すことが最終ゴールである。検出力を高めるため、公開されている東北メガバンクのデータを合わせた分析を行っている。2022年度で、胆のうがん155例に加え、肝内胆管がん115例、肝外胆管がん222例、その他の胆道がん43例、対照703例について、GWAS(ゲノムワイド関連解析)の測定が終了した。これに、東北大東北メガバンクで測定済みの症例のデータ16,848例を対照として加えた分析を行っている。用いている症例のデータには、生活習慣のデータが付属している。現在はGWASののデータによってimputationの作業を進めているところである。Imputationの方法について、検討が必要な部分が明らかになってきたので、十分検討した上で最終的な分析を行うこととなった。 H. bilisやH. hepaticusについては、関連を否定できないという結果を報告した(Osaki Tet al. Helicobacter. 2022 Feb;27(1): e12866.)。抗体測定に関して、測定系の精度が十分でない可能性がある。測定系の精度を上げることで、関連を積極的に示すエビデンスが得られる可能性があるので、更に分析を進めている。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
Imputationの方法について、検討した上で最終結果を出すことになり、わずかであるが、計画より進行が遅れている。
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今後の研究の推進方策 |
Imputaionに続いて、生活習慣要因との交互作用の分析を行う。検体数が少ないので、要因の数を少なくして、多数のモデルでの解析を行う。結果の妥当性についてグループ全体で会議を開いて討論する。感染症について、H. bilisとH. hepaticusの抗体測定の精度を上げる研究を続ける。結果については、関連がなさそう、どちらともいえない、関連がありそうのどの結果と考えられるかを十分検討した上で公表(学会発表、英文論文作成)する。
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