• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

張力ホメオスタシスを説明する細胞内分子挙動の測定と熱力学的記述

研究課題

研究課題/領域番号 21H03796
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分90110:生体医工学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

出口 真次  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 教授 (30379713)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2022年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2021年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード張力ホメオスタシス / 適応 / メカノバイオロジー / 細胞バイオメカニクス / 慢性炎症 / CM-FRAP / 熱力学 / 統計力学 / FRAP / バイオメカニクス / パーコレーション
研究開始時の研究の概要

増殖が可能な細胞には「張力ホメオスタシス」と呼ばれる、細胞内部の物理的な張力を一定に維持する性質が備わっている。これは細胞が周囲環境の変化に対して適応的に振る舞うための基盤となっており、その能力の不全は様々な疾患との関連をもつことが指摘されている。本研究の目的は、複雑な要素を含むために不明な点の多い当該現象のメカニズムを明らかにすることである。まず、従来は困難であった「細胞内」タンパク質の「複数の挙動(純拡散・化学結合・移流・機械的変形)の区別」を行うことができる測定法を開発する。得られた関連分子の挙動と熱力学の体系をもとに、張力ホメオスタシスのメカニズムを説明する。

研究成果の概要

増殖が可能な細胞には、細胞内部の物理的な張力を一定に維持する性質である張力ホメオスタシスが備わっている。これは、細胞が周囲環境の変化に適応し、自身の構造や機能を維持するための機能であり、その能力の不全は様々な疾患につながることがわかっている。本研究では、張力ホメオスタシス応答時の細胞内の挙動を計測する方法、具体的にはCM-FRAP法(Continuum mechanics-based fluorescence recovery after photobleaching)を開発し、細胞内で複雑な流れや変形が存在する中でも正確な分子ターンオーバー速度の計測が可能となった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

「張力ホメオスタシス」は細胞が外部環境の変化に適応し、内部の物理的・生化学的な状態を一定に保つ重要な機能です。この機能の不全は動脈硬化やがんなどの疾患と関連しており重要な研究課題です。しかし、この現象の理解には生物学だけでなく物理化学を含む広範な知識と技術が必要なために十分に研究が進んでいませんでした。本研究ではCM-FRAP法という新しい計測方法を開発し、細胞の張力ホメオスタシスのメカニズム、すなわち細胞が環境の変化に応じて適応的に振る舞う際の変化の仕組みを詳細に解析することが可能になりました。ここで得た知見は張力ホメオスタシスの不全に起因する様々な疾患の予防や治療に役立つ可能性があります。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (49件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (17件) (うち国際共著 2件、 査読あり 17件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (29件) (うち国際学会 14件、 招待講演 27件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Pontificia Universidad Catolica de Chile(チリ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Niels Bohr Institute/University of Copenhagen(デンマーク)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Unraveling a Key Molecular Player Governing Pulmonary Alveolar Development2024

    • 著者名/発表者名
      Ding Shihang、Deguchi Shinji、Kim Taeyoon
    • 雑誌名

      American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology

      巻: 70 号: 4 ページ: 237-238

    • DOI

      10.1165/rcmb.2024-0025ed

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Advancing FRAP for cell studies: Where there is a new method, there is a new field2023

    • 著者名/発表者名
      SAITO Takumi、DEGUCHI Shinji
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      巻: 18 号: 4 ページ: 23-00028-23-00028

    • DOI

      10.1299/jbse.23-00028

    • ISSN
      1880-9863
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Emergence of multiple set-points of cellular homeostatic tension2023

    • 著者名/発表者名
      Ueda Yuika、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics

      巻: 151 ページ: 111543-111543

    • DOI

      10.1016/j.jbiomech.2023.111543

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CM‐FRAP?Continuum Mechanics‐Based Fluorescence Recovery After Photobleaching2023

    • 著者名/発表者名
      Saito Takumi、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      Current Protocols

      巻: 3 号: 1

    • DOI

      10.1002/cpz1.655

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long-term fluorescence recovery after photobleaching (FRAP)2023

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2600 ページ: 311-322

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] PDGF-B secreted from skeletal muscle enhances myoblast proliferation and myotube maturation via activation of the PDGFR signaling cascade2023

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi Hiroki、Dohi Kitora、Sakai Takaomi、Taoka Masato、Isobe Toshiaki、Matsui Tsubasa S.、Deguchi Shinji、Furuichi Yasuro、Fujii Nobuharu L.、Manabe Yasuko
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 639 ページ: 169-175

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.11.085

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long-term molecular turnover of actin stress fibers revealed by advection-reaction analysis in fluorescence recovery after photobleaching2022

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Matsunaga, D., Matsui, T.S., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 17 号: 11 ページ: 276909-276909

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0276909

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A statistical mechanics model for determining the length distribution of actin filaments under cellular tensional homeostasis2022

    • 著者名/発表者名
      Ueda, Y., Matsunaga, D., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 14466-14466

    • DOI

      10.1038/s41598-022-18833-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Establishment of a system evaluating the contractile force of electrically stimulated myotubes from wrinkles formed on elastic substrate2022

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi Hiroki、Matsui Tsubasa S.、Deguchi Shinji、Furuichi Yasuro、Fujii Nobuharu L.、Manabe Yasuko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 13818-13818

    • DOI

      10.1038/s41598-022-17548-7

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Analysis of chemomechanical behavior of stress fibers by continuum mechanics-based FRAP2022

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 121 号: 15 ページ: 2921-2930

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2022.06.032

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polarized light retardation analysis allows for the evaluation of tension in individual stress fibers2022

    • 著者名/発表者名
      Sugita Shukei、Hozaki Masatoshi、Matsui Tsubasa S.、Nagayama Kazuaki、Deguchi Shinji、Nakamura Masanori
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 620 ページ: 49-55

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.06.066

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inner Nuclear Membrane Protein, SUN1, is Required for Cytoskeletal Force Generation and Focal Adhesion Maturation.2022

    • 著者名/発表者名
      N. Ueda, M. Maekawa, T.S. Matsui, S. Deguchi, T. Takata, J. Katahira, S. Higashiyama, M. Hieda
    • 雑誌名

      Front Cell Dev. Biol.

      巻: 10 ページ: 885859-885859

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.885859

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Wrinkle force microscopy: a machine learning based approach to predict cell mechanics from images2022

    • 著者名/発表者名
      Li Honghan、Matsunaga Daiki、Matsui Tsubasa S.、Aosaki Hiroki、Kinoshita Genki、Inoue Koki、Doostmohammadi Amin、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 5 号: 1 ページ: 361-361

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03288-x

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Analysis of senescence-responsive stress fiber proteome reveals reorganization of stress fibers mediated by elongation factor eEF2 in HFF-1 cells2022

    • 著者名/発表者名
      Liu, S., Matsui, T.S., Kang, N., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell

      巻: 33 号: 1

    • DOI

      10.1091/mbc.e21-05-0229

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanosensitive myosin II but not cofilin primarily contributes to cyclic cell stretch-induced selective disassembly of actin stress fibers2021

    • 著者名/発表者名
      Huang Wenjing、Matsui Tsubasa S.、Saito Takumi、Kuragano Masahiro、Takahashi Masayuki、Kawahara Tomohiro、Sato Masaaki、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      American Journal of Physiology-Cell Physiology

      巻: 320 号: 6 ページ: C1153-C1163

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00225.2020

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Determining the domain-level reaction-diffusion properties of an actin-binding protein transgelin-2 within cells2021

    • 著者名/発表者名
      Saito Takumi、Matsunaga Daiki、Matsui Tsubasa S.、Noi Kentaro、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 404 号: 1 ページ: 112619-112619

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112619

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ARHGAP4-SEPT2-SEPT9 complex enables both up- and down-modulation of integrin-mediated focal adhesions, cell migration, and invasion2021

    • 著者名/発表者名
      Kang, N., Matsui, T.S., Liu, S., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell

      巻: 32 号: 21

    • DOI

      10.1091/mbc.e21-01-0010

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Analyzing cellular mechanical homeostasis and adaptation2023

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Wrinkle force microscopy: Predicting cell mechanics from images2023

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi, Honghan Li, Daiki Matsunaga
    • 学会等名
      6th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ストレスファイバーの張力恒常性と老化2023

    • 著者名/発表者名
      出口真次, Pirawan Chantachotikul, 松元瑛司
    • 学会等名
      第75回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Role of stress fibers in cellular adaptation and senescence2023

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      QBIO/PEB Seminar, Yale University
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞老化のプロテオーム解析2023

    • 著者名/発表者名
      出口真次, Pirawan Chantachotikul
    • 学会等名
      第62回日本生体医工学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エントロピーエントロピー2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      第33回バイオフロンティア講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞の力の恒常性と適応2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      九州大学・先導研非常勤講師講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning approach to predicting cell mechanics from images2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      Department Seminar (Programa de Doctorado en Biolog; Celulary Biomedicina, Facultad de Medicina y Ciencia)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Cellular force predicted by machine learning for mechanobiology and drug screening2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      Seminario extraordinario, Universidad de los Andes
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Evaluating cellular force using machine learning for mechanobiology and drug screening2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      1st Annual IIBM PhD Symposium: “Advances in Biological and Medical Engineering”, Pontifical Universidad Catlica de Chile
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゆらぎの定理に基づく細胞張力ホメオスタシスに関する研究2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次, 上田唯花
    • 学会等名
      第60回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Proteome of stress fibers2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      Mechanical Science and Bioengineering Seminar
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based traction force microscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi, Honghan Li, Daiki Matsunaga
    • 学会等名
      9th World Congress of Biomechanics 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Proteomic analysis of actin stress fibers2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi, Shiyou Liu, Tsubasa S. Matsui, Na Kang, Pirawan Chantachotikul
    • 学会等名
      9th World Congress of Biomechanics 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 機械学習による細胞発生力の推定2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次, 李泓翰, 松永大樹
    • 学会等名
      第61回日本生体医工学会大会2022,
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞張力ホメオスタシスの熱・統計力学2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次,上田唯花,松永大樹
    • 学会等名
      第34回バイオエンジニアリング講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Bridging the hierarchies between cells and the cytoskeleton: Thermodynamics, statistical mechanics, and non-equilibrium physics2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi, Yuika Ueda, Daiki Matsunaga
    • 学会等名
      55th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 常在収縮力計測による多能性幹細胞の分化状態評価2022

    • 著者名/発表者名
      出口真次, オケヨ・ケネディ・オモンディ, 松永大樹, 松井翼
    • 学会等名
      「再生医学・再生医療の先端 合的共同研究拠点」「ウイルス感染症・生命科学 先端 合的共同研究拠点」2021年度共同研究合同報告会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Does durotaxis direct NE cell migration in developing lung?2021

    • 著者名/発表者名
      Kana Furukawa, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞による力学環境への適応のメカニズム2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      MMDS・AIMap研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based detection of cellular forces and its application to drug screening2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      International Conference on Future Healthcare and Economic Development
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シグナル伝達, 数理モデルに基づく細胞計測2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      生物物理学会サブグループ・メカノバイオロジー研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] バイオメカニクスの最前線ー細胞の恒常性を理解するー2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      次世代医療システム産業化フォーラム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cellular adaptation to mechanical environment2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      MEI-Center Summer School 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ストレスファイバーの熱力学2021

    • 著者名/発表者名
      出口 真次, 上田 唯花, 松井 翼, 松永 大樹
    • 学会等名
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Wrinkle force microscopy: a machine learning-based approach to evaluate cellular forces2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      DevMech Webinar
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞の力のホメオスタシス、細胞の力のアッセイ2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      京大ウイルス再生研生体材料学分野・セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based cellular force evaluation2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      From Research to Innovation” Symposium on the 15th Anniversary of Osaka University and University of Strasbourg
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based detection of cellular traction forces2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      LINK-J & UC San Diego Joint Webinar Series #4 with Osaka University
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 大阪大学大学院基礎工学研究科・出口研究室

    • URL

      http://mbm.me.es.osaka-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書 2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi