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森林生態系におけるコウチュウ目ー微生物群集共生系の共進化動態解析

研究課題

研究課題/領域番号 21H04736
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

久保田 耕平  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (30272438)

研究分担者 池田 紘士  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (00508880)
研究期間 (年度) 2021-04-05 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
42,250千円 (直接経費: 32,500千円、間接経費: 9,750千円)
2024年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
2023年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
2022年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
2021年度: 15,860千円 (直接経費: 12,200千円、間接経費: 3,660千円)
キーワード菌嚢 / 酵母 / 材食性 / 腐食連鎖 / 気候変動 / バクテリア
研究開始時の研究の概要

本研究では、コウチュウ目を材料として、主として材食性および腐食連鎖に関わるコウチュウ目-微生物共生系に焦点をあて、新規の微生物保持器官の探索、多様な分類群における共生微生物群集の網羅的解析、共進化動態の解析、生態的機能の解明、気候変動にともなう共生系の動態予測を行う。すでにクワガタムシ科で新規の共生系を発見して予備的研究を進めており、多様なコウチュウ目に対象を広げることで、森林生態系における昆虫―微生物共生系への理解を格段に深め、共生機能に配慮した森林管理法の開発に貢献することを目指している。

研究実績の概要

〇コウチュウ分類群の共生微生物のメタゲノム解析:本年度はホスト材のタイプが異なるルリクワガタPlatycerus属3種の雌成虫菌嚢、消化管、幼虫の消化管、糞、ホスト材中の坑道壁等の120サンプルについて、真菌類、バクテリア類のメタゲノムを解析中で、次年度に結果の取りまとめを行う。
〇ホストコウチュウ目と共生微生物の共進化動態解析:昨年度までの解析結果に加えて、本年度は中国安徽農業大学の張勝男博士との共同研究関係を構築し、日本産・中国産クワガタムシ科のさらに幅広い分類群と共生酵母の共進化動態解析を行った。クワガタムシ科の種・個体群において、性比の偏りに共生バクテリアであるWolbachia pipientisが関与している可能性を検討し、実際に感染している個体をクワガタムシ科で初めて確認した。
〇気候変動にともなうコウチュウ目分類群―微生物共生系の動態予測:日本産クワガタムシ科の多様な種から分離した共生酵母について、高温耐性がホストクワガタ種の生息環境と相関を持つことが明らかになり、ホスト昆虫の動態予測には、共生微生物の要求環境を考慮する必要があることが示唆された。
〇コウチュウ分類群―微生物共生系の生態的機能の解明:昨年のコクワガタから材料を多様な属に広げ、共生酵母および共生バクテリアが木材構成成分の資化やホスト昆虫の成長・発育にどのような機能を果たしているか検討するため、培養実験・飼育実験を行った。それぞれの微生物の効果が示唆される結果が得られており、さらに次年度も実験を継続する。
〇解析候補種の遺伝的分化、生態ニッチ分化解析:解析候補の材食性昆虫のクワガタムシ科、腐食連鎖に関わるオサムシ科の種について、解析ユニットを決定するための遺伝的分化、生態ニッチ分化解析を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

年度当初の計画のうち、材食性昆虫の共生微生物のメタゲノム解析や共進化動態解析に関しては、解析が順調に進んでおり、次年度中に結果が取りまとめられる見込みである。また、性比の偏りをもたらす可能性のあるバクテリアのWolbachia pipientisとの共生関係がクワガタムシ科で初めて明らかにされる等の新規の発見もあった。年度をまたいで継続している気候変動にともなうコウチュウ目分類群―微生物共生系の動態予測、コウチュウ分類群―微生物共生系の生態的機能の解明等についても、順調にデータを積み重ねている。2023年12月より研究代表者が公務災害での左膝の骨折・手術とリハビリテーションのため、80日間ほど実験実施が困難となった期間があったが、全体としてはほぼ順調な進捗状況と判断できる。

今後の研究の推進方策

クワガタムシ科の微生物に関するメタゲノム解析は、現在1回目の解析中であるが、2回目に向けてのサンプル収集も進めている。共生系の機能解析についても、各種のクワガタムシ科の種で進行中であり、ホスト昆虫と共生微生物の共進化動態の解明、共生微生物の垂直伝播プロセス、幼虫の成長・生存への貢献、各種糖類の資化能力等の検討を2024年度も継続し、論文化を進める。現在多くの項目で中国(安徽農業大学:張勝男博士)および韓国(江原大学校:金鍾國博士)の研究者とのデータを共有しての共同研究に向けて情報交換を行っており、東アジア地域全体としてのコウチュウ目と共生微生物の共進化動態の解明に向けても研究を進めてゆく予定である。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 5件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件)

  • [国際共同研究] 安徽農業大学(中国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] 華南農業大学(中国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] 華南農業大学(中国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Stages in the degeneration of flight ability degeneration and their interspecific comparisons in the genus Synuchus (Coleoptera: Carabidae) in Japan2024

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T., Kubota K., Ikeda H.
    • 雑誌名

      European Journal of Entomology

      巻: 121 ページ: 7-18

    • DOI

      10.14411/eje.2024.002

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Accounting for dispersal and intraspecific variations in forecasts of species’ distribution under climate change2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang S.-N., Kubota K.
    • 雑誌名

      Insect Conservation and Diversity

      巻: 16 号: 6 ページ: 902-908

    • DOI

      10.1111/icad.12681

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Strongly exclusive distribution with putative character displacement in two flying stag beetles2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang S.-N., Kubota K.
    • 雑誌名

      Evolution

      巻: 77 号: 1 ページ: 155-165

    • DOI

      10.1093/evolut/qpac034

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Local ecological divergence of two closely related stag beetles based on genetic, morphometric, and environmental analyses2022

    • 著者名/発表者名
      Zhang S.-N., Kubota K.
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 12 号: 4

    • DOI

      10.1002/ece3.8837

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Phylogeographic analysis of Japanese Nippoligidium (Isopoda, Oniscidea) using molecules and morphology reveals high biodiversity and the genetic differentiation process in the Kanto region, Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshino H., Kubota K.
    • 雑誌名

      Entomological Science

      巻: 25 号: 2

    • DOI

      10.1111/ens.12501

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High Temperature tolerance of the yeast symbionts of Platycerus stag beetles in Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu X.-J., Zhang S.-N., Watanabe K., Kawakami K., Kubota N., Takagi E., Tanahashi M., Wen X.-J., Kubota K.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 12

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.793592

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Lateral transmission of the yeast symbionts among lucanid beetle taxa2021

    • 著者名/発表者名
      Ueki G., Zhang S.-N., Zhu X.-J., Wen X.-J., Tojo K., Kubota K.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 12

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Two isolated populations of Carabus (Ohomopterus) maiyasanus Bates (Coleoptera, Carabidae) from Mie Prefecture, central Japan, with description of a new subspecies2021

    • 著者名/発表者名
      Makita S., Zhang S.-N., Kubota K.
    • 雑誌名

      Elytra New Series

      巻: 11 ページ: 285-292

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ルリクワガタ属の産卵痕の意義とは?-産卵行動の観察と産卵痕の分布-2024

    • 著者名/発表者名
      久保田耕平・張勝男
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 日本列島におけるAsiopodabrus属(甲虫目ジョウカイボン科)の種多様化プロセス2024

    • 著者名/発表者名
      中村涼・池田紘士・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 日本産クワガタムシ科全属における共生酵母の多様性2023

    • 著者名/発表者名
      上木岳・東城幸治・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Diversification of the genus Asiopodabrus (Coleoptera, Cantharidae) in the Ryukyu Archipelago, Japan2023

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Relationship between traits for flight and habitat environment in two related Synuchus species2023

    • 著者名/発表者名
      清水隆史・久保田耕平・池田紘士
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of the genus Platycerus (Coleoptera, Lucanidae) and its yeast symbionts in East Asia2023

    • 著者名/発表者名
      Kubota K.
    • 学会等名
      "Forestry-Carbon Neutrality" Forum, 2023 Maritime Silk Road International Conference on the Cooperation and Integration of Industry, Education, Research and Application
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シリブトジョウカイ属Yukikoaの分類学的研究と課題2023

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      日本甲虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 日本列島のツヤヒラタゴミムシ属におけるニッチ・形質進化2023

    • 著者名/発表者名
      清水隆史・久保田耕平
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クワガタムシ科における共生酵母との共進化2022

    • 著者名/発表者名
      上木岳・東城幸治・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ルリクワガタ属とその共生微生物に対する気候変動のインパクト2022

    • 著者名/発表者名
      張勝男・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ツヤヒラタゴミムシ属の系統進化・形質 進化・集団動態2022

    • 著者名/発表者名
      清水隆史・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 関東地方周辺におけるAsiopodabrus 属(甲虫目ジョウカイボン科)の多様化プロセス2022

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 2種の飛翔可能なクワガタムシにおける形質置換を伴う強い排他的分布2022

    • 著者名/発表者名
      張勝男・久保田耕平
    • 学会等名
      日本昆虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 日本産 ochraceus種群(ジョウカイボン科 Asiopodabrus 属)の種分化,個体群分化2022

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      日本甲虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ユキグニコルリクワガタの産卵行動と産卵マークの分布2022

    • 著者名/発表者名
      張勝男・久保田耕平
    • 学会等名
      日本甲虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 日本産クワガタムシにおける共生微生物との共進化からみる生息環境への適応2022

    • 著者名/発表者名
      上木岳・東城幸治・久保田耕平
    • 学会等名
      第69回日本生態学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ツヤヒラタゴミムシ属における系統進化・形質進化2022

    • 著者名/発表者名
      清水隆史・久保田耕平
    • 学会等名
      第69回日本生態学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Strongly exclusive distribution with putative character displacement in two flying stag beetles2022

    • 著者名/発表者名
      張勝男・久保田耕平
    • 学会等名
      第133回日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 朝鮮半島-九州地方における別属のクワガタムシ種間(オニクワガタ属・ルリクワガタ属)での共生酵母の水平伝搬2021

    • 著者名/発表者名
      上木岳・東城幸治・久保田耕平
    • 学会等名
      第32回信州昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] クワガタムシ近縁2種における遺伝子浸透と形態変異2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang, S.-N.・久保田耕平
    • 学会等名
      第81回日本昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] オニクワガタ属とルリクワガタ属における共生酵母の水平伝播2021

    • 著者名/発表者名
      上木岳・張勝男・朱雪コウ・温秀軍・東城幸治・久保田耕平
    • 学会等名
      第81回日本昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 関東地方におけるツヤヒラタゴミムシ属の系統進化と遺伝的分化2021

    • 著者名/発表者名
      清水隆史・久保田耕平
    • 学会等名
      第81回日本昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Asiopodabrus属(甲虫目ジョウカイボン科)の雄交尾器内袋の形態2021

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      第81回日本昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒメフナムシ属の系統地理2021

    • 著者名/発表者名
      吉野広軌・久保田耕平
    • 学会等名
      第81回日本昆虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア遺伝子によるAsiopodabrus属(甲虫目ジョウカイボン科)の遺伝的分化プロセスの推定2021

    • 著者名/発表者名
      中村涼・久保田耕平
    • 学会等名
      第11回日本甲虫学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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