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革新的な機能調節化合物の創製による概日時計システムの統合的な理解と制御

研究課題

研究課題/領域番号 21H04766
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関名古屋大学

研究代表者

廣田 毅  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任准教授 (50372412)

研究期間 (年度) 2021-04-05 – 2024-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
42,510千円 (直接経費: 32,700千円、間接経費: 9,810千円)
2023年度: 12,350千円 (直接経費: 9,500千円、間接経費: 2,850千円)
2022年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円)
2021年度: 17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
キーワード概日時計 / ケミカルバイオロジー / 時計タンパク質 / 化合物 / 構造解析
研究開始時の研究の概要

睡眠・覚醒など様々な生理機能の日内リズムを支配する概日時計について、私たちが世界に先駆けて発見した独自の時計調節化合物を用い、新たな時計タンパク質の発見や概日リズムの自在な制御を可能にする新技術を開発する。これらの革新的な技術を用いて、分子メカニズム解析から組織・個体における機能制御を統合的に行い、従来の分子遺伝学研究を超えて概日時計システムの作動原理を徹底解剖する。

研究実績の概要

概日時計は多様な生理機能の日内リズムを支配し、その攪乱は睡眠障害などの現代疾患に関連する。本研究は概日時計の分子解析から、生物がどのように時間を計るのかという本質的な謎を解明し、概日リズムの変調と諸疾患を時間の観点から理解することを目指す。この重要課題に対して、時計機能の操作技術の開発が突破口を開くと考え、ケミカルバイオロジーを応用した研究を行う。申請者が世界に先駆けて発見した独自の時計調節化合物を用い、新たな時計タンパク質の発見や、概日リズムの時空間制御を可能にする新技術を開発する。これらの革新的な技術を用いて、結晶構造解析による分子メカニズム解析から組織・個体における機能制御を統合的に行い、従来の分子遺伝学研究を超えて概日時計システムの作動原理を徹底解剖する。本年度はCRY1とCRY2の両方に作用する化合物KL001の誘導体として開発されたSHP656の機能解析を行い、予想外にもこの化合物がCRY2に選択性を示すことを見出した。CRY2とSHP656の複合体の構造と機能の解析から、ゲートキーパーと名付けたトリプトファンの向きがSHP656のアイソフォーム選択性にも重要な役割を果たすことが判明した。さらに、概日リズムの周期を変化させる化合物の解析から新規化合物TH401を発見し、CRY1とCRY2の両者に作用することを明らかにした。CRY1とTH401の複合体においては、ゲートキーパーがCRY1-PER2複合体の場合と同様の向きに変化することを見出した。以上の研究からCRYの機能制御の理解を深めることができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

下記のように研究3において当初の計画以上に研究が進展した。
KL001の誘導体であるSHP656は糖尿病マウスの血糖値を低下させるだけでなく、致死性の脳腫瘍を引き起こすグリオブラストーマ幹細胞の増殖を抑制することが示されている。しかし、これらの作用がCRY1とCRY2のどのアイソフォームを介しているのかは不明であった。本研究においてSHP656の作用メカニズムを解明するためにCRY1とCRY2のそれぞれに対する影響を解析したところ、意外にもSHP656はCRY2に選択性を示すことを見出した。さらに、結晶構造解析からSHP656がCRY2の内向きのゲートキーパーとの間に相互作用を形成していることを明らかにした。ゲートキーパーの向きを変化させるCRY2変異体ではSHP656の作用が大幅に低下し、この部位が選択性に重要な役割を果たすことが判明した。その上、CRY2-SHP656の結晶構造に基づいて、より活性の高い誘導体であるSHP1703を見出すことに成功し、当初の計画以上の成果を得た。

今後の研究の推進方策

研究1-3において、計画通りに研究を推進する。研究1では新規の概日時計調節化合物について作用機序の解析を進める。アフィニティープローブの開発と解析を進めると共に、時計タンパク質と化合物の相互作用を熱安定性の変化によって検出する系を用いた解析を進める。研究2では光スイッチ化合物と一細胞レベルのイメージングシステムを用いた概日リズムの空間的な制御に向けた検討を進める。研究3ではCRY1とCRY2のアイソフォーム選択性に注目した機能解析を進める。In vivo実験に用いるCRY1とCRY2のそれぞれに選択的な誘導体の開発を進め、マウス個体に投与して睡眠・覚醒の行動リズムに与える影響を解析する。アイソフォーム選択性を明らかにするために、Cry1ノックアウトマウスおよびCry2ノックアウトマウスを用いた解析も行う。さらに、これらの化合物を肥満モデルマウスに投与し、血糖値や各組織の形態・遺伝子発現などに与える影響を解析する。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 5件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] University of Southern California(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Padova(イタリア)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Groningen(オランダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Southern California(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Indian Institute of Technology(インド)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of the phosphoproteome of CK2α(-/-)/Δα' C2C12 myoblasts compared to the wild-type cells2023

    • 著者名/発表者名
      Borgo Christian、Cesaro Luca、Hirota Tsuyoshi、Kuwata Keiko、D'Amore Claudio、Ruppert Thomas、Blatnik Renata、Salvi Mauro、Pinna Lorenzo A.
    • 雑誌名

      Open Biology

      巻: 13 号: 2 ページ: 220220-220220

    • DOI

      10.1098/rsob.220220

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Phosphorylation of RNA Polymerase II by CDKC;2 Maintains the Arabidopsis Circadian Clock Period2022

    • 著者名/発表者名
      Uehara Takahiro N、Nonoyama Takashi、Taki Kyomi、Kuwata Keiko、Sato Ayato、Fujimoto Kazuhiro J、Hirota Tsuyoshi、Matsuo Hiromi、Maeda Akari E、Ono Azusa、Takahara Tomoaki T、Tsutsui Hiroki、Suzuki Takamasa、Yanai Takeshi、Kay Steve A、Itami Kenichiro、Kinoshita Toshinori、Yamaguchi Junichiro、Nakamichi Norihito
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 63 号: 4 ページ: 450-462

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac011

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cell-Based Phenotypic Screens to Discover Circadian Clock-Modulating Compounds2022

    • 著者名/発表者名
      Hatori Megumi、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2482 ページ: 95-104

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2249-0_6

    • ISBN
      9781071622483, 9781071622490
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CRY2 isoform selectivity of a circadian clock modulator with antiglioblastoma efficacy2022

    • 著者名/発表者名
      Miller Simon、Kesherwani Manish、Chan Priscilla、Nagai Yoshiko、Yagi Moeri、Cope Jamie、Tama Florence、Kay Steve A.、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 40

    • DOI

      10.1073/pnas.2203936119

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A methylbenzimidazole derivative regulates mammalian circadian rhythms by targeting Cryptochrome proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Yagi Moeri、Miller Simon、Nagai Yoshiko、Inuki Shinsuke、Sato Ayato、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      F1000Research

      巻: 11 ページ: 1016-1016

    • DOI

      10.12688/f1000research.124658.2

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 概日時計の分子機構をケミカルバイオロジーで紐解く2022

    • 著者名/発表者名
      松田 智宏、廣田 毅
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 60 ページ: 212-214

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Chemical Biology Approaches Reveal Isoform-Selective Mechanisms of Ligand Interactions in Mammalian Cryptochromes2022

    • 著者名/発表者名
      Miller Simon、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      Frontiers in Physiology

      巻: 13 ページ: 837280-837280

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.837280

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 体内時計のケミカルバイオロジー研究と創薬の可能性2021

    • 著者名/発表者名
      廣田 毅、松田 智宏
    • 雑誌名

      MEDCHEM NEWS

      巻: 31 号: 2 ページ: 62-67

    • DOI

      10.14894/medchem.31.2_62

    • NAID

      130008033651

    • ISSN
      2432-8618, 2432-8626
    • 年月日
      2021-05-01
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Effects of Cryptochrome-modulating compounds on circadian behavioral rhythms in zebrafish2021

    • 著者名/発表者名
      Iida M, Nakane Y, Yoshimura T, Hirota T
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: Sep 号: 5 ページ: 501-507

    • DOI

      10.1093/jb/mvab096

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reversible modulation of circadian time with chronophotopharmacology2021

    • 著者名/発表者名
      Kolarski Dusan、Mir-Vinyals Carla、Sugiyama Akiko、Srivastava Ashutosh、Ono Daisuke、Nagai Yoshiko、Iida Mui、Itami Kenichiro、Tama Florence、Szymanski Wiktor、Hirota Tsuyoshi、Feringa Ben L.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 3164-3164

    • DOI

      10.1038/s41467-021-23301-x

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural differences in the FAD-binding pockets and lid loops of mammalian CRY1 and CRY2 for isoform-selective regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Miller Simon、Srivastava Ashutosh、Nagai Yoshiko、Aikawa Yoshiki、Tama Florence、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 118 号: 26

    • DOI

      10.1073/pnas.2026191118

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modulation of circadian clock by crude drug extracts used in Japanese Kampo medicine2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang M, Kobayashi K, Atsumi H, Katada Y, Nakane Y, Chen J, Nagano R, Kadofusa N, Nishiwaki-Ohkawa T, Kon N, Hirota T, Sato A, Makino T, Yoshimura T
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 21038-21038

    • DOI

      10.1038/s41598-021-00499-w

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 概日時計を標的とした化合物と創薬の最前線2021

    • 著者名/発表者名
      飯田 夢惟、廣田 毅
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: 47 ページ: 23-25

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural insights into isoform-selective regulators of mammalian Cryptochromes2021

    • 著者名/発表者名
      Miller Simon、Hirota Tsuyoshi
    • 雑誌名

      SPring-8 /SACLA Research Frontiers 2020

      巻: - ページ: 22-23

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] Regulation of mammalian Cryptochrome with small molecule compounds from in vitro to in vivo2022

    • 著者名/発表者名
      Hirota Tsuyoshi
    • 学会等名
      Sapporo Symposium on Biological Rhythm 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Isoform-selective compounds for mammalian CRY proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Hirota
    • 学会等名
      5th Asian Forum on Chronobiology
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 低分子化合物を用いた概日時計タンパク質の機能制御の最先端2021

    • 著者名/発表者名
      廣田 毅
    • 学会等名
      日本睡眠学会第46回定期学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 哺乳類の階層時計システムの理解に向けた時計タンパク質の調節化合物の開発2021

    • 著者名/発表者名
      廣田 毅
    • 学会等名
      第28回日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical biology of the circadian clock and its potential to improve health2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Hirota
    • 学会等名
      The 94th Japanese Biochemical Society Meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Circadian Clocks2022

    • 著者名/発表者名
      Hirota, T., Hatori, M., and Panda, S
    • 総ページ数
      429
    • 出版者
      Springer Nature
    • ISBN
      9781071625767
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所Kay-廣田グループ

    • URL

      https://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/kay-hirota_group/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所Kay-廣田グループ

    • URL

      http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/kay-hirota_group/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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