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生息環境に応じて生じた生活史変異に駆動される遺伝動態:進化生態学の新展開

研究課題

研究課題/領域番号 21J10814
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分45040:生態学および環境学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

都築 洋一  北海道大学, 環境科学院, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2021-04-28 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード遺伝的多様性 / デモグラフィー / 生活史 / 多年生草本植物 / 有効集団サイズ / 多年生草本 / 個体群行列モデル
研究開始時の研究の概要

生物が生まれてから成長・繁殖して死ぬまでの一生の生活様式を「生活史」という。多年生草本の生活史は、発芽してから開花に至るまでの成長率や生存率、さらに繁殖回数などの個体群統計パラメーターで特徴づけられる。本研究では多年生草本オオバナノエンレイソウを対象に、個体群統計パラメーターの変異が、個体群動態や遺伝的多様性、適応進化に与える影響を、「個体追跡モニタリング」、「集団遺伝解析」、「数理シミュレーション」等の多元的なアプローチを統合して解明する。

研究実績の概要

生物が生まれてから死ぬまでの一連の生命活動の過程を生活史という。本研究課題は北海道十勝地方に生息する多年生草本植物オオバナノエンレイソウを対象に、発芽してから成長・開花するまでの生活史過程に基づいて遺伝的多様性の時間変化を評価することを試みた。
令和4年度は、まず12集団に2018年から設置している計41個の調査区において、個体モニタリング調査を継続することで、各集団の個体の生存・成長の成否や種子生産数を記録した。得られた4年分のモニタリングデータから、階層ベイズモデルの一種である統合個体群モデルを用いて、成長率や生存率、繁殖率などの生活史パラメーターを推定し、発芽してから開花・繁殖して種子が形成されるまでの生活史サイクルを明らかにした。次に、推定された生活史パラメーターの値に基づいて、昨年度構築した数理モデルを用いて各集団の遺伝的多様性の減少速度を理論的に予測した。最後に、得られた理論予測が、ddRAD-seq法で得られた一塩基多型データと一致するのかを検証した。その結果、理論予測と実データの間に不一致が見られ、理論予測では遺伝的多様性が高く維持されると考えられた集団でも、実際には遺伝的多様性の減少が進んでいることが示唆された。この原因として、野生の植物集団では、距離依存的な花粉・種子の分散や個体数変動があることで、実際に遺伝的に有効に集団として機能する個体数が、見かけ上の個体数よりもはるかに小さい可能性が示唆された。また実データから、発芽したばかりの実生段階から成熟した開花段階までの複数の生活史段階の間で、遺伝的多様性の高さが異なっていることが判明した。この結果は、減少しつつある野生集団の遺伝的多様性を維持する上で、特に重要な生活史段階が存在する可能性を示唆している。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Corrigendum to “Modeling temporal dynamics of genetic diversity in stage-structured plant populations with reference to demographic genetic structure” [Theor. Popul. Biol. 148 (2022) 76-85]2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Yoichi、Takada Takenori、Ohara Masashi
    • 雑誌名

      Theoretical Population Biology

      巻: - ページ: 39-40

    • DOI

      10.1016/j.tpb.2023.03.002

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Temporal skewness of pollination success in the spring ephemeral Trillium camschatcense2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Yoichi、Ohara Masashi
    • 雑誌名

      The Science of Nature

      巻: 109 号: 4 ページ: 35-35

    • DOI

      10.1007/s00114-022-01807-8

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Modeling temporal dynamics of genetic diversity in stage-structured plant populations with reference to demographic genetic structure2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Yoichi、Takada Takenori、Ohara Masashi
    • 雑誌名

      Theoretical Population Biology

      巻: 148 ページ: 76-85

    • DOI

      10.1016/j.tpb.2022.11.001

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Which life history strategy can maintain high genetic diversity in plants?2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Yoichi、Takada Takenori、Ohara Masashi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2022.04.26.489613

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Genetic consequences of habitat fragmentation in a perennial plant Trillium camschatcense are subjected to its slow‐paced life history2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Yoichi、Sato Mitsuhiko P.、Matsuo Ayumi、Suyama Yoshihisa、Ohara Masashi
    • 雑誌名

      Population Ecology

      巻: 64 号: 1 ページ: 5-18

    • DOI

      10.1002/1438-390x.12093

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Potential effects of life history on demographic genetic structure in stage-structured plant populations2021

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Tsuzuki, Takenori Takada, Masashi Ohara
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.11.30.470535

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] How life history drives genetic diversity of fragmented perennial plant populations2023

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Tsuzuki, Mitsuhiko P. Sato, Takenori Takada, Masashi Ohara
    • 学会等名
      第70回日本生態学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 多年生植物を対象にデモグラフィーと遺伝動態の接点を紐解く2022

    • 著者名/発表者名
      都築洋一
    • 学会等名
      第38回個体群生態学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝情報から推定されたオオバナノエンレイソウの生活史サイクル2022

    • 著者名/発表者名
      都築洋一, 佐藤光彦, 大原雅
    • 学会等名
      第54回種生物学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 多年生草本植物における遺伝的多様性の時間変化:遺伝解析と理論的導出2022

    • 著者名/発表者名
      都築洋一, 佐藤 光彦, 松尾歩, 陶山佳久, 高田壮則, 大原雅
    • 学会等名
      第69回日本生態学会年次大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Mathematical derivation of the temporal dynamics of genetic diversity in stage-structured plant populations gives population genetic insights into life history2021

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Tsuzuki, Takenori Takada, Masashi Ohara
    • 学会等名
      Ecology Across Borders 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-03-26  

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