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陸上植物における植物ホルモン・ジベレリンを介した生殖細胞分化機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21J15550
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分38060:応用分子細胞生物学関連
研究機関京都大学

研究代表者

川村 昇吾  京都大学, 生命科学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2021-04-28 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワードジベレリン / 進化 / ゼニゴケ / 陸上植物進化 / 生殖成長
研究開始時の研究の概要

重要な植物ホルモンであるジベレリンの生殖細胞分化における機能について、基部陸上植物である苔類ゼニゴケを研究対象として用いることで、これまで被子植物では困難であった生殖細胞(配偶体)におけるジベレリンの役割を解析することで、ジベレリンの進化的な普遍性を明らかにする。さらに、被子植物とは異なるジベレリンの分子実態や生合成遺伝子、受容体遺伝子をゼニゴケにおいて同定することで、陸上植物進化におけるジベレリンに関する多様性も明らかにする。

研究実績の概要

国立遺伝学研究所と共同研究の上、発現量・共発現データベースについて、Plant and Cell Physiology誌への投稿を行い、受理された。ゼニゴケのGA様活性化合物の不活化酵素変異体のRNA-seq解析についてより詳細に解析を行い、クロロフィルの分解系への影響や、デンプンの異常な蓄積などが転写レベルで起こっていることを明らかにした。また、その現象について実際の変異株で確認を行った。その結果、クロロフィル、デンプンがともに野生型に比べて顕著に増加していることが明らかになった。また、TEMを用いて変異株の葉緑体の内部を観察したところ、多くのデンプン粒が変異株で観察された。さらに、進化的に保存されたGA生合成経路とは異なるジテルペノイド合成経路が強く発現しており、基質の転用が行われている可能性が示唆された。これらに加えて、変異株におけるゼニゴケの生殖器官が非誘導条件下でも形成される表現型の原因を明らかにするため、ゼニゴケの生殖器官形成の制御を行うMpBNBタンパクを非誘導条件下でHiBitとLgBitによる発光定量系を用いて定量し、発光が見られることを明らかにした。これにより、変異株の表現型の原因がMpBNBタンパク質が非誘導条件下で発現していることであることがより強く示唆された。また、共著として、研究室として行っている本変異株を用いたスクリーニングと同定された遺伝子に関する学会発表や、苔類ゼニゴケを用いた質量分析によるGA様化合物の分析についても学会発表を行った。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] MarpolBase Expression: A Web-Based, Comprehensive Platform for Visualization and Analysis of Transcriptomes in the Liverwort <i>Marchantia polymorpha</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Kawamura Shogo、Romani Facundo、Yagura Masaru、Mochizuki Takako、Sakamoto Mika、Yamaoka Shohei、Nishihama Ryuichi、Nakamura Yasukazu、Yamato Katsuyuki T、Bowman John L、Kohchi Takayuki、Tanizawa Yasuhiro
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 63 号: 11 ページ: 1745-1755

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac129

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Diminished Auxin Signaling Triggers Cellular Reprogramming by Inducing a Regeneration Factor in the Liverwort <i>Marchantia polymorpha</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Ishida Sakiko、Suzuki Hidemasa、Iwaki Aya、Kawamura Shogo、Yamaoka Shohei、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Yamaguchi Katsushi、Shigenobu Shuji、Sakakibara Hitoshi、Kohchi Takayuki、Nishihama Ryuichi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 63 号: 3 ページ: 384-400

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac004

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system2021

    • 著者名/発表者名
      Miyuki Iwasaki Katsuyuki T. Yamato John L. Bowman Takayuki Kohchi et al
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 31 号: 24 ページ: 5522-5532.e7

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.10.023

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ゼニゴケのジベレリンに関連したメチル化酵素機能に影響する変異体スクリーニング2022

    • 著者名/発表者名
      下川 瑛太, 川村 昇吾, Sun Rui, 鈴木 かおり, 岡部 麻衣子, 吉竹 良洋, 安居 佑季子, 西浜 竜一, 山岡 尚平, 増口 潔, 山口 信次郎, 河内 孝之
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるジベレリン類縁化合物の探索2022

    • 著者名/発表者名
      岡部 麻衣子, 吉竹 良洋, Sun Rui, 川村 昇吾, 鈴木 かおり, 下川 瑛太, 安居 佑季子, 山岡 尚平, 石田 俊晃, 増口 潔, 山口 信次郎, 河内 孝之
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Elucidation of the molecular mechanisms of sexual reproduction using an in vivo system to induce germline cell-like cells in the bryophyte Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Kajiwara, Yoshihiro Yoshitake, Megumi Iwano, Shogo Kawamura, Yukiko Yasui, Shohei Yamaoka, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      5th IRN France-Japan Frontiers in Plant Biology "Emerging models in plant sciences"
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ゼニゴケを用いたジベレリン様化合物の新奇信号伝達因子の探索2022

    • 著者名/発表者名
      下川 瑛太、川村 昇吾、Sun Rui、鈴木 かおり、岡部 麻衣子、吉竹 良洋、安居 佑季子、西浜 竜一、山岡 尚平、増口 潔、山口 信次郎、河内 孝之
    • 学会等名
      近畿植物学会 第11回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケの生殖系列細胞様細胞分化誘導系の構築2022

    • 著者名/発表者名
      梶原 智明、吉竹 良洋、岩野 恵、川村 昇吾、安居 佑季子、山岡 尚平、河内 孝之
    • 学会等名
      第18回 京大植物縦横無尽の会ワークショップ
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Establishment of an in vivo system to induce germline cell-like cells from somatic cells in the bryophyte Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Kajiwara, Yoshihiro Yoshitake, Megumi Iwano, Shogo Kawamura, Yukiko Yasui, Shohei Yamaoka, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第45回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Genetic screen for suppressors of a gibberellin-related mutation in the liverwort Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Eita Shimokawa, Shogo Kawamura, Rui Sun, Kaori Suzuki, Maiko Okabe, Yoshihiro Yoshitake, Yukiko Yasui, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Kiyoshi Mashiguchi, Shinjiro Yamaguchi, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第45回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionally origin of photoperiod dependent germline cells formation pathway in land plants2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Yoshitake, Shohei Yamaoka, Shogo Kawamura, Tomoaki Kajiwara, Ryuichi Nishihama, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第45回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] MarpolBase Expression: A web-based, comprehensive platform for visualization and insight acquisition out of publicly available transcriptomes of the liverwort Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Shogo Kawamura, Facundo Romani, Masaru Yagura, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Yasukazu Nakamura, Katsuyuki T Yamato, John L Bowman, Takayuki Kohchi, Yasuhiro Tanizawa
    • 学会等名
      第45回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケにおける生殖系列細胞様細胞の分化誘導系の構築2022

    • 著者名/発表者名
      梶原 智明、吉竹 良洋、岩野 恵、川村 昇吾、安居 佑季子、山岡 尚平、河内 孝之
    • 学会等名
      第5回コケ幹細胞研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 陸上植物における日長依存的な生殖細胞系列決定機構の分子進化2022

    • 著者名/発表者名
      吉竹 良洋、山岡 尚平、川村 昇吾、梶原 智明、西浜竜一、河内 孝之
    • 学会等名
      第5回コケ幹細胞研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Development of a trans-activating system to induce germline cell-like cells from somatic cells in the bryophyte Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Kajiwara, Yoshihiro Yoshitake, Megumi Iwano, Shogo Kawamura, Yukiko Yasui, Shohei Yamaoka, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      Cold Spring Harbar Asia Symposium "Integrative Epigenetics in Plants
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic screen for a non-canonical signaling factor of gibberellin in Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Eita Shimokawa, Shogo Kawamura, Rui Sun, Kaori Suzuki, Maiko Okabe, Yoshihiro Yoshitake, Yukiko Yasui, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Kiyoshi Mashiguchi, Shinjiro Yamaguchi, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      19th International Student Seminar
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケにおけるジベレリン新奇信号伝達因子の探索2022

    • 著者名/発表者名
      下川 瑛太、川村 昇吾、Sun Rui、鈴木 かおり、岡部 麻衣子、吉竹 良洋、安居 佑季子、西浜 竜一、山岡 尚平、増口 潔、山口 信次郎、河内 孝之
    • 学会等名
      日本植物生理学会第64回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Screening of novel mutants affecting a gibberellin-related methyltransferase function in Marchantia polymorpha2022

    • 著者名/発表者名
      Eita Shimokawa, Shogo Kawamura, Rui Sun, Kaori Suzuki, Yoshihiro Yoshitake, Yukiko Yasui, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Kiyoshi Mashiguchi, Shinjiro Yamaguchi, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第62回植物生理学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるジベレリン関連経路を介した生殖器官形成のメチル 基転移酵素によるフィードバック制御2021

    • 著者名/発表者名
      Shogo Kawamura, Rui Sun, Yoshihiro Yoshitake, Ryunosuke Kusunoki, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第44 回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-03-26  

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