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機構拘束言語としてのロボットキネマティクスによる生体機能分子の理解

研究課題

研究課題/領域番号 21K03971
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分20020:ロボティクスおよび知能機械システム関連
研究機関神奈川工科大学

研究代表者

有川 敬輔  神奈川工科大学, 工学部, 教授 (50350674)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2023年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2022年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2021年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワードロボットキネマティクス / ロボット機構学 / 機構拘束 / 生体機能分子 / タンパク質 / 形状操作性 / 逆運動学問題
研究開始時の研究の概要

ロボット機構としてモデル化した生体機能分子の各種運動学特性を解析する方法を明らかにし,これらを計算機プログラムとして実装する.そして,注目する機能に応じた有効な解析の組み合わせを,文献に報告されている実際の機能と比較しながら検討する.この過程を,様々な生体機能分子について,ある種のフィードバックによって前段の検討を修正しながら繰り返し,これを通じて構成した機構拘束言語としてのロボットキネマティクスが,生体機能分子の機能的振舞を支える構造や現象をどの程度説明しうるか検証する.

研究成果の概要

タンパク質をはじめとする生体機能分子をロボット機構としてモデル化する汎用的手法,逆運動学解析を分子に適用する手法,形状変化特性を解析する手法,大規模構造変化を解析する手法を,機構拘束の観点からロボットキネマティクスを一般化する形で定式化した.さらに,これらを計算機プログラムとして実装し,様々なタンパク質の3次元構造データを解析した.解析の結果,逆運動学解の解の個数と構造的特徴の間,および,形状変化特性とタンパク質の機能の間に一定の関係性を見出した.また,いくつかのタンパク質の大規模構造変化を,柔軟性の高い運動モードの組み合わせで表現できることを示した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

従来から,生体機能分子とロボット機構の間には構造的なアナロジーがあることは知られていたが,理論体系に設定された暗黙の強い制約(2つの参照リンク間の相対運動を対象とする等)のため,標準的なロボットキネマティクスを使って生体機能分子の解析を行うことは容易ではなかった.本研究の成果は,ロボットキネマティクスに設定された暗黙の強い制約を,機構拘束という枠組みを維持しつつ適切に解除したことを意味する同時に,生体機能分子を理解するという生命科学上の重要な問題に対し,ロボットキネマティクスという新たな視点と新たな道具を提供したことを意味する.

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Analysis of Instantaneous Kinematic Properties regarding the Shape of Robotic Mechanisms2024

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Arikawa
    • 雑誌名

      Journal of Mechanisms and Robotics

      巻: 掲載決定 号: 12

    • DOI

      10.1115/1.4065371

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 構造コンプライアンス特性のロボット機構学的解析に基づくタンパク質の運動生成2023

    • 著者名/発表者名
      有川敬輔
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の局所構造の形状操作性に関するロボット工学的解析手法2022

    • 著者名/発表者名
      有川敬輔
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Kinematic Modeling and Inverse Kinematics of Serial 6R Fragment of Molecule2021

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Arikawa
    • 学会等名
      ASME, IDETC, 45th Mechanisms and Robotics Conference
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] タンパク質における連続3残基Loop-Closure問題の解の個数に関するロボット工学的解析2021

    • 著者名/発表者名
      有川 敬輔
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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