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細胞核構造によるゲノム安定化と老化抑制の機構解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K05497
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38060:応用分子細胞生物学関連
研究機関東北大学

研究代表者

堀籠 智洋  東北大学, 農学研究科, 准教授 (10771206)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードリボソームRNA遺伝子 / rDNA / 核膜 / 老化 / 若返り / マイクロ流体チップ
研究開始時の研究の概要

近年、早老症を対象とした研究により、ヒトの老化には細胞核構造とゲノム安定性が重要な影響を及ぼしていることが明らかになってきている。また、出芽酵母を用いた一細胞老化解析では、ゲノム最大の反復配列であるリボソームRNA遺伝子(rDNA)の安定性が細胞レベルでの健康寿命に決定的な影響を及ぼす可能性が示唆されている。
本研究では核膜結合がrDNAを安定化する作用機構を明らかにし、核膜とrDNA安定性が細胞寿命におよぼす役割の関連性について検証する。また、老化した細胞において核膜によるゲノム安定化機能が維持されているかを、若い細胞と比較して検証する。

研究実績の概要

課題1 核膜結合がrDNA安定化および細胞老化抑制に果たす役割の解明: リボソームRNA遺伝子(rDNA)においてDNA二本鎖切断を誘導した時のコヒージョン形成と核膜の関係について、顕微鏡を用いて定量解析した。rDNA反復配列の1箇所にI-SceI切断部位とtetO配列を導入した株を用い、ガラクトースによりI-SceIエンドヌクレアーゼを発現誘導し、その切断部位をTetI-mRFPにより可視化する株を用いた解析を行った。その結果、rDNAの核膜孔結合に欠陥のあるnup120破壊株及びtel1破壊株におけるDNA損傷誘導性コヒージョンが、野生株と比較して違いがないことが示された。これにより核膜孔はrDNAの安定性に寄与しているが、これはDNA損傷誘導性コヒージョンを介した反応ではないことが示された。
核膜結合によるrDNA安定化の作用点を遺伝学的に同定するため、fob1 nup120二重破壊株を構築した。パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)でrDNAの安定性に関する解析を行ったところ、Fob1依存的なrDNA損傷の修復に核膜孔が関与しないことが明らかになった。
課題2 老化細胞における核膜でのゲノム安定化についての解析: rDNAの反復配列中にADE2遺伝子をひとつ導入した酵母細胞を、ビオチン標識した後に分裂を繰り返させて細胞を老化させ、ストレプトアビジン磁性ビーズにより老化細胞(平均5~6回出芽)を選別した。老化細胞およびそこから生まれた若い細胞を寒天固形培地に播種して、ハーフセクターと呼ばれる赤白半円ずつのコロニーが形成される確率を求めることで、ADE2遺伝子の抜け落ちの頻度、つまりrDNAの不安定性を定量的に測定した。老化細胞ではそこから生まれた若い細胞よりも高い頻度でのADE2遺伝子の抜け落ちが観察され、rDNAが不安定になっていることが示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究はおおむね順調に進展しており、以下のような成果をあげている。
課題1については予定していた目的の主要な部分を達成して論文原稿としてまとめた。現在、査読を受けて指摘された項目について追加実験を行っている。
課題2についてもおおむね順調に進展している。特にADE2の脱落を指標とした老化細胞とその娘細胞におけるrDNA安定性の解析は、rDNAの不均等分配を示したGanleyらの論文におけるパルスフィールドゲル電気泳動とは別の方法で母娘細胞の不均等性を確認した初めての結果である(Ganley et al., Mol Cell 35:683-93 (2009))。細胞分裂における老化と若返りの不均等性を理解するうえで非常に重要な結果であり、想定以上の進展と言える。

今後の研究の推進方策

課題1: Fob1に依存せずにrDNAが不安定になるsgs1破壊と、nup120破壊との二重変異株を作製し、パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)でrDNAの安定性に関する遺伝学的解析を行う。
課題2: 老化細胞とその娘細胞におけるrDNAの安定性をADE2の脱落により定量解析する。野生株に加えて、sir2破壊株、fob1破壊株、nup120破壊株で解析する。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Changed life course upon defective replication of ribosomal RNA genes2022

    • 著者名/発表者名
      Mei Hattori, Chihiro Horigome, Theo Aspert, Gilles Charvin, Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 97 号: 6 ページ: 285-295

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00100

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2022-12-01
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Analysis of the molecular evolution of histone variant H2A.Z using a linker-mediated complex strategy and yeast genetic complementation2021

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa Saho、Kusakabe Masayuki、Takahashi Daisuke、Narimiya Takumi、Nakabayashi Yu、Seki Masayuki、Horigome Chihiro、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 1 ページ: 104-108

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab190

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 出芽酵母の核膜孔におけるリボソームRNA遺伝子安定化メカニズムの解析2023

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第56回研究報告会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 相同組換え修復におけるホモロジー・サーチの動態解析2023

    • 著者名/発表者名
      蓜島万紘、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第56回研究報告会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 出芽酵母のリボソームRNA遺伝子安定性と核膜孔および老化の関係2023

    • 著者名/発表者名
      牧田蒼生、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第56回研究報告会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 出芽酵母の核膜におけるリボソーム RNA 遺伝子の 安定維持機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、蓜島万紘、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部 第158回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Visualizing homology search during DNA double strand break repair.2023

    • 著者名/発表者名
      Aoi Makita, Masahiko Harata, Chihiro Horigome
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia conference on Yeast and Life Sciences
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA二本鎖切断部位の核膜結合がゲノム安定化に果たす役割2022

    • 著者名/発表者名
      岡田大和, 堀川和希, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希、高橋大輔、小西辰紀、岡田大和、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、 原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷誘導性姉妹染色分体間接着には損傷部位と核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 老化した出芽酵母におけるDNA二本鎖切断の解析2021

    • 著者名/発表者名
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色体分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 老化した出芽酵母における DNA 二本鎖切断の核膜結合に関する解析2021

    • 著者名/発表者名
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 堀籠智洋准教授が酵母遺伝学フォーラム第56回研究報告会会長賞を受賞

    • URL

      https://www.agri.tohoku.ac.jp/jp/news/20230913m/

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 東北大学大学院農学研究科・農学部 分子生物化学分野ウェブサイト

    • URL

      https://www.harata-lab.org/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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