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ゲノム情報による黒毛和種の産肉性に関する非相加的遺伝様式の解明と育種改良への応用

研究課題

研究課題/領域番号 21K05905
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42010:動物生産科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

廣岡 博之  京都大学, 農学研究科, 教授 (60192720)

研究分担者 西尾 元秀  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産研究部門, 主任研究員 (10585970)
井上 慶一  宮崎大学, 農学部, 教授 (30753917)
竹田 将悠規  独立行政法人家畜改良センター, 本所(企画調整部 技術グループ), 調査役・係長 (80775205)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワード黒毛和種 / ゲノム / 育種価 / 脂肪交雑 / 染色体 / ゲノム育種価 / ゲノムインプリンティング効果 / ゲノム情報 / 非相加的遺伝 / 育種
研究開始時の研究の概要

本研究では肥育牛とその父と母が完備したゲノム(SNP:一塩基多型マーカー)情報を用いて、父と母からの遺伝伝達様式を明らかにする理論を構築し、全ゲノム関連解析を実施して、新しい遺伝様式を示す遺伝子を特定する。さらに黒毛和種において相加的遺伝様式以外の非相加的遺伝伝達様式が存在するかどうかを遺伝子レベルで明らかにし、そのような遺伝伝達様式を想定した場合の最適な育種計画とそれがもたらす経済効果をシミュレーション法で定量的に算出して、生産現場への普及を目指す。

研究実績の概要

これまでと同様に鳥取県および家畜改良センターで肥育された黒毛和種肥育牛1,908頭の枝肉成績とSNP情報およびその父母のSNP情報から染色体別にゲノム関係行列を構築し、ベイズ推定を実施して、染色体ごとのゲノム育種価を推定した。本年度は肥育牛のゲノム育種価に対するその父と母のゲノム育種価の標準偏回帰係数を父と母それぞれの遺伝的影響度(合計で1.0)として表した。
父と母で遺伝的影響度の相違があり、遺伝的影響度の最も大きかった染色体は、枝肉重量で父0.559(BTA2)、母0.561(BTA9)、BMSで父0.560(BTA9)、母0.559(BTA15)、皮下脂肪厚で父0.563(BTA2)、母0.548(BTA14)、ロース芯面積で父0.551(BTA23)、母0.553(BTA5)、バラ厚で父0.533(BTA14)、母0.575(BTA28)であった。以上から、父母の遺伝伝達様式には大きな偏りは認められず、また小さな偏りであっても形質や染色体ごとで特定の法則のないことが示唆された。しかしその一方で、父母の遺伝伝達様式とその影響が母方祖父によって異なることが示唆された。
さらに前年度に実施した分析において、西洋品種においては脂肪交雑と皮下脂肪厚の間に性の遺伝相関が認められるのに対して黒毛和種においては遺伝相関がほとんどないことを示し、その関係性が染色体ごとに異なることを示したが、ブタにおいても西洋豚では筋肉内脂肪と背脂肪の間には正の遺伝相関があるのに対して、中国豚では遺伝相関が認められないことを明らかにし、このような関係性はアジアの品種の特徴である可能性を示唆した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

概ね予定通りに進行している。

今後の研究の推進方策

本プロジェクトで得られた新しい知見について論文を執筆し、早急に投稿して国際誌での掲載を実現したい。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Genetic parameters for carcass and meat quality traits in Jinhua, Duroc, and their crossbred pigs2023

    • 著者名/発表者名
      Terada Kei、Ohtani Toshiyuki、Ogawa Shinichiro、Hirooka Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of Animal Breeding and Genetics

      巻: 141 号: 1 ページ: 33-41

    • DOI

      10.1111/jbg.12823

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Investigation on inheritance transmission modes using breeding values estimated from genomic or pedigree information2022

    • 著者名/発表者名
      Hirooka H, Nishio M, Inoue K, Takeda M, Inoue Y.
    • 雑誌名

      Proceedings of 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)

      巻: 1 ページ: 2696-2699

    • DOI

      10.3920/978-90-8686-940-4_653

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 黒毛和種の枝肉形質に関する染色体レベルでの遺伝伝達様式の検討2023

    • 著者名/発表者名
      広岡博之・井上慶一・西尾元秀・竹田将悠規・井上喜信
    • 学会等名
      日本畜産学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 黒毛和種の染色体レベルでの脂肪交雑と皮下脂肪厚の遺伝的関係性2022

    • 著者名/発表者名
      広岡博之、井上慶一、西尾元秀、竹田将悠規、井上喜信
    • 学会等名
      日本畜産学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Investigation on inheritance transmission modes using breeding values estimated from genomic or pedigree information2022

    • 著者名/発表者名
      Hirooka H, Nishio M, Inoue K, Takeda M, Inoue Y.
    • 学会等名
      World Congress on Genetics Applied to Livestock
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 黒毛和種の枝肉重量に関与する主働遺伝子の遺伝的効果2021

    • 著者名/発表者名
      広岡博之・井上慶一・西尾元秀・竹田将悠規・井上喜信
    • 学会等名
      日本畜産学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 黒毛和種の枝肉形質における非相加的遺伝効果の推定2021

    • 著者名/発表者名
      井上慶一・西尾元秀・井上喜信・竹田将悠規・内山勝雄・広岡博之
    • 学会等名
      日本畜産学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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