研究課題/領域番号 |
21K05905
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分42010:動物生産科学関連
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研究機関 | 京都大学 |
研究代表者 |
廣岡 博之 京都大学, 農学研究科, 教授 (60192720)
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研究分担者 |
西尾 元秀 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産研究部門, 主任研究員 (10585970)
井上 慶一 宮崎大学, 農学部, 教授 (30753917)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
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キーワード | 黒毛和種 / 染色体 / 脂肪交雑 / ゲノム育種価 / ゲノムインプリンティング効果 / ゲノム情報 / 非相加的遺伝 / 育種 |
研究開始時の研究の概要 |
本研究では肥育牛とその父と母が完備したゲノム(SNP:一塩基多型マーカー)情報を用いて、父と母からの遺伝伝達様式を明らかにする理論を構築し、全ゲノム関連解析を実施して、新しい遺伝様式を示す遺伝子を特定する。さらに黒毛和種において相加的遺伝様式以外の非相加的遺伝伝達様式が存在するかどうかを遺伝子レベルで明らかにし、そのような遺伝伝達様式を想定した場合の最適な育種計画とそれがもたらす経済効果をシミュレーション法で定量的に算出して、生産現場への普及を目指す。
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研究実績の概要 |
本研究では肥育牛とその父と母が完備したゲノム(SNP:一塩基多型マーカー)情報を用いて、父と母からの遺伝伝達様式を明らかにする理論を構築し、全ゲノム関連解析を実施して、新しい遺伝様式を示す遺伝子を特定することを目的とした。昨年度と同様に鳥取県畜産試験場および家畜改良センターから黒毛和種種雄牛240頭、母牛1,563頭、肥育牛2,006頭について34,481個のSNPデータを収集した。 本年度は、特に染色体レベルでの分析を実施した。黒毛和種や褐毛和種の遺伝的特徴として脂肪交雑と皮下脂肪の間に弱い負の遺伝相関があり、このことは脂肪交雑による選抜が皮下脂肪の増加をもたらさないという意味で望ましい関係であることが知られている。そこでゲノム情報を用いることでこれらの形質間の遺伝的関係性を染色体レベルで検討した。 鳥取県および家畜改良センターで肥育された黒毛和種肥育牛1,908頭の脂肪交雑(BMSナンバー)と皮下脂肪厚の枝肉成績とSNP情報から染色体別にゲノム関係行列を構築し、ベイズ推定を実施して、染色体ごとのゲノム遺伝分散とゲノム育種価を推定した。 ゲノム遺伝分散はBMSナンバーでは第2、7、12染色体で大きく、皮下脂肪厚では第3染色体で大きかったが、極端に大きな値を示す染色体は存在せず、これらの形質は主にポリジーンによって支配されていることが示唆された。これら2形質のゲノム育種価間の相関係数はゲノム全体では-0.118であったが、第21と28染色体で高い正の相関があり(0.579と0.512)、第6と9染色体で高い負の相関が認められた(-0.487と-0.470)。このことから、これらの染色体上の遺伝子はこれら2形質に対して強い多面作用のあることが示唆された。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
概ね、予定通りに研究は進行している。
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今後の研究の推進方策 |
黒毛和種の枝肉形質について、父と母からの遺伝子の伝達様式がどうなっているかを染色体レベルで明らかにしたい。また、特に脂肪交雑についてはまだまだ未知のことも多いので、これまでの先行研究から個々の染色体上の遺伝子についてその機能等を調べ、本研究から得られた結果との整合性を図りたい。また、ブタなどの他の畜種に関する筋肉内脂肪の皮下脂肪の関連性を調べるのに適したデータがあるので、畜種間の比較も行いたい。
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